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融合プロテオミクスによるがん診断の新戦略

使用融合蛋白质组学诊断癌症的新策略

基本信息

批准号：
20014021
负责人：
荒木令江
金额：
$ 7.81万
依托单位：
Kumamoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2008
资助国家：
日本
起止时间：
2008 至 2009
项目状态：
已结题

项目摘要

がん研究におけるプロテオミクス解析の最も有効なストラテジーを構築するため、最先端の高感度・分解能・解析速度をもつプロテオミクス解析技術のがん研究への応用と方法論の確立を行っている。本年度は脳神経系腫瘍の薬剤治療標的となりうる分子シグナルを検索するため、病態組織細胞サンプルを用いた統合プロテオミクスの方法論確立を試みた。分子発現差異解析法であるiTRAQ(8Plex)法、2D-DIGE法、およびDNA arrayを融合的に用いて同一サンプル群を同時に解析し、得られたすべての情報を統合マイニングすることによって、病態において異常に制御されたシグナル伝達経路を特異的に抽出する方法論を検討した。全てのデータを統合マイニングし、重要分子シグナル群を抽出するための統合マイニング解析プログラム[MANGO (Mol.Cell.Proteomics 2009), iPEACH(特願2010-81525)]を考案し、さらに抽出重要分子群の迅速検証法、siRNA、阻害剤、活性化剤等を用いた生物学的機能解析法などを検討することによって、スタンダードとなりうる一連の統合的方法論の開発を行った。特に悪性グリオーマの薬剤感受性に関わる分子群の解析、および検証に応用し、新規の抗がん剤感受性低下に関わるシグナルVimentin activation loopを見出した(特願2010-81524)。又、如何に融合技術によって大量に得られたプロテオームデータを迅速に処理し、重要機能分子群を抽出して検証する方法論が重要かつ有用であるか、創薬の観点から考察した。これらの方法論はすべての疾患・病態の解析はもとより、細胞生物学における基礎的な分子メカニズム情報を得るためのアプローチにも応用でき、蓄積されたデータベースを活用することによって、新しい病態メカニズムの解明や診断や治療のマーカー・創薬開発に重要な基礎情報を得る方法論として有用であると考えられる。

The most important part of the research is to make sure that the speed of the high-sensitivity decomposition is very fast, and the analytical technology is very fast. This year, the government is responsible for the diagnosis and treatment of the disease. This year, the disease organization is responsible for the establishment of a clinical trial by using the method of systematic diagnosis and treatment. Molecular differential analysis methods compare iTRAQ (8Plex) method, 2D-DIGE method, and DNA array fusion method to analyze the data of the same cluster at the same time, and obtain the data of the same group of users. The whole system is divided into two parts: the whole system, the important molecule, the group of important molecules, and the group of important molecules. [MANGO (Mol.Cell.Proteomics 2009)] IPEACH (special 2010-81525)] the methods of rapid analysis, siRNA, hindrance and activation of important molecular groups were used to analyze the integrated methods of molecular biology. The molecular group analysis of the sensitivity test, the molecular cluster analysis of the sensitivity test, the use of the new specification, the anti-sensitivity test, the Vimentin activation loop response test (2010-81524). Also, how to integrate the technology to obtain a large number of information about the rapid management of the disease, the extraction of a group of important mechanical molecules, the method discussion of the method, and the investigation of the important information. In the analysis of the state of the disease, the molecular markers of cell biology and cellular biology were used in the analysis of disease and disease. The new disease information system explains how to treat the disease. You can learn the important information about the methods and methods of the disease.