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プロテオミクスによる脳神経系腫瘍の診断・治療法の基礎開発

利用蛋白质组学进行脑和神经系统肿瘤诊断和治疗方法的基础开发

基本信息

批准号：
16023252
负责人：
荒木令江
金额：
$ 3.46万
依托单位：
Kumamoto University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

脳神経系腫瘍の発生初期から進行度や予後予測、薬物治療効果などをモニタリングできる簡便な臨床マーカーを検索する目的で、ヒト脳神経系組織・細胞のプロテオームデータバンクの構築、及び最新の高感度proteomic differential display法による腫瘍関連組織・細胞の解析法の検討を行っている。本研究では、gliomaの形成進行に関連して変化する蛋白質群の検出・同定を、患者脳組織、神経系培養細胞を用いて、2D-DIGE法とnanoLC-MASショシトガン法(clCAT法およびiTRAQ法)を用いたProteomic Differential Displayによる定量的蛋白質情報、及び同時進行で得たmRNA発現情報を統合して、最も重要な細胞内異常シグナルの抽出を試みた。Proteomic Differential Display法では、ヒトGliomaにおいて腫瘍化に関わるものとして221個、薬剤耐性に関わる201個の特異的な蛋白質を検出・同定した。これらにはリン酸化修飾の差異の見られる28個の特異的分子を含め、既知の腫瘍関連分子のみならず腫瘍マーカーとして興味深い分子群が多数含まれていた。同時に、同じ組織・細胞サンプルからトランスクリプトーム解析試料抽出法を検討し解析結果を比較検討した。全解析データから特異的な活性化シグナルネットワークの抽出を行ったところ、血管新成・血管透過性・細胞周期・接着因子関連分子群の関与するキャスケードの上昇、及び特異的核内レセプター群、転写因子群とそれらの下流分子群の活性化が認められた。本研究における検討によって、高感度な脳腫瘍のProteomic Differential Display法、及びその異常活性化シグナルの抽出方法が確立され、その有用性が証明された。

The development of neuropathic tumors in the early stage, the progress, the prediction, the effect of drug therapy, the construction of neuropathic tissues and cells, and the analysis of tumor related tissues and cells by the latest high-sensitivity proteomic differential display method were discussed. In this study, we used 2D-DIGE and nanoLC-MAS methods (clCAT and iTRAQ) to quantify protein information and mRNA expression information related to glioma formation, including identification of protein groups, identification of patient tissues and cultured cells, and extraction of most important intracellular abnormalities. Proteomic Differential Display method: 221 proteins in the tumor and 201 proteins in the tumor. 28 specific molecules were identified, and most of them were identified. At the same time, the same tissue and cell types were analyzed and compared. Complete analysis of specific activation factors, such as vascular regeneration, vascular permeability, cell cycle, and adhesion factors related to molecular groups, and specific activation factors, such as nuclear activation factors, and downstream molecular groups. In this study, we established a new method for detection, Proteomic Differential Display of highly sensitive tumors, and extraction of abnormal active tumors, and demonstrated their usefulness.

项目成果

期刊论文数量（16）

专著数量（0）

科研奖励数量（0）

会议论文数量（0）

专利数量（0）

脳腫瘍の病態プロテオミクズで見えてくる新たなシグナル伝達経路"プロテオミクスでみえてくる生命機能の新たなメカニズム"

脑肿瘤病理学蛋白质组学揭示的新信号转导途径“蛋白质组学揭示生命功能的新机制”

DOI：
发表时间：
2004
期刊：
実験医学 23・7
影响因子：
0
作者：
Araki;N.;荒木令江;荒木令江
通讯作者：
荒木令江

Methods for protein purification from biological samples.

从生物样品中纯化蛋白质的方法。

DOI：
发表时间：
2004
期刊：
Tanpakushitsu Kakusan Koso. 49(11)
影响因子：
0
作者：
Kurihara N;Reddy SV;Araki N;Ishizuka S;Ozono K;Cornish J;Cundy T;Singer FR;Roadman GD.;Araki N^*.
通讯作者：
Araki N^*.

「in vitroラベル法」オンラインLC-MS法による発現プロファイル解析

使用“体外标记法”在线LC-MS方法进行表达谱分析