生物発光リズムデータの解析とデーターベースの構築
生物发光节律数据分析及数据库构建
基本信息
- 批准号:20016010
- 负责人:
- 金额:$ 5.25万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
- 财政年份:2008
- 资助国家:日本
- 起止时间:2008 至 2009
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
生物発光を利用して生きたままの細胞で目的遺伝子の発現をリアルタイムで測定するシステムを生物発光リアルタイム測定システムと呼ぶ。このシステムは、1) モニタリングしたい目的遺伝子のプロモーター領域の下流に、発光遺伝子(発光バクテリアやホタルのルシフェラーゼ遺伝子など)のタンパク質コード領域を組み込んだ「生物発光株」、2) 生物発光を高感度で自動測定できる「生物発光自動測定装置」、3) 測定しながら測定で得られた生物発光データをリアルタイムで解析して表示できる「生物発光自動解析プログラム」、そして、4) 測定で得られた生物発光データとその解析結果や、他のデータベース探索で得られた外部情報を整理して一括保存できる「生物発光データベース」から構成されている。我々はこれまでにこのシステムの実験室版を開発し、藍色細菌やクラミドモナス、シロイヌナズナなどの生物種で主に生物時計の研究に汎用してきた。この新規システムが生命科学分野全般で広く活用されるようにシステムの完成度を上げることが課題である。1の生物発光株に関しては、生物時計とは異なる研究分野の研究者との共同研究で藍色細菌やシロイヌナズナ、イネなどで新規の発光株を作製し、保存した。2の生物発光自動測定装置に関しては、別途予算でこれまでにない、高感度測定装置と高ハイスループット測定装置を開発することができた。また、発光測定用の生物試料を装置用に調製する装置も開発した。3では完成度の高い生物発光リズム解析プログラムを完成したが、リズム以外を目的とする一般用の解析プログラムはまだ完成することができていない。また、4のデータベースに関してもまだ今後に残された課題である。幸い2009年度後半に新たな事業に採択されたので、引き続き3と4の完成に向けて努力したい。
There is a system for measuring the expression of target genes in cells that make use of bioluminescence. 1) The target gene is the downstream gene of the target region, and the light gene is the downstream gene of the target region (light emission) the quality of the light emission field is divided into "biological light emitting plant", 2) biological light emission high sensitivity automatic measurement, 3) biological light emission automatic analysis, 3) biological light emission automatic analysis 4) The analysis results of the biological emission data obtained from the measurement and the analysis results of the biological emission data obtained from the exploration of the biological emission data include the organization of the external information and the preservation of the biological emission data. We have developed a laboratory version of this system, which is widely used in the study of biochronology of blue bacteria. This new regulation will be widely used in all areas of life sciences, and will increase the degree of completion of the system. 1. The biological development of the plant is related to the biological time, and the researchers in the research field jointly study the blue bacteria. The new development of the plant is produced and preserved. 2. Automatic measurement device for biological light emission Development of a device for preparing biological samples for luminescence measurement 3. The high degree of completion of biological light emission analysis is complete, except for general purpose analysis. 4. The problem is that Fortunately, in the second half of 2009, the new business will be launched and completed in March and April.
项目成果
期刊论文数量(27)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
The ATPase activity of KaiC
KaiC 的 ATPase 活性
- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:武藤梨沙;村上怜子;石井健太郎;宇津巻竜也;石浦正寛
- 通讯作者:石浦正寛
Direct interaction between KaiA and KaiB revealed by a site-directed spin labeling electron spin resonance analysis
- DOI:10.1111/j.1365-2443.2009.01377.x
- 发表时间:2010-03-01
- 期刊:
- 影响因子:2.1
- 作者:Mutoh, Risa;Mino, Hiroyuki;Ishiura, Masahiro
- 通讯作者:Ishiura, Masahiro
Real-time bioluminescence monitoring device for living plant
活体植物生物发光实时监测装置
- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Onai K;Ishiura M
- 通讯作者:Ishiura M
Real-time bioluminescence monitoring system
实时生物发光监测系统
- DOI:
- 发表时间:2010
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Onai K;Ishiura M
- 通讯作者:Ishiura M
生物発光リアルタイム測定システムの開発と応用-有用遺伝子の網羅的な超高速探索へ向けて-
生物发光实时测量系统的开发与应用-迈向全面超高速搜索有用基因-
- DOI:
- 发表时间:2009
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:小内清;石浦正寛
- 通讯作者:石浦正寛
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石浦 正寛其他文献
クラミドモナスの時計タンパク質ROC15の光誘導性分解に関わる遺伝子の解析
衣藻时钟蛋白 ROC15 光诱导降解相关基因分析
- DOI:
- 发表时间:
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- 作者:
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石浦 正寛
緑藻クラミドモナスの時計タンパク質ROC15の光誘導性分解に関わる遺伝子の同定
绿藻衣藻中参与光诱导时钟蛋白 ROC15 降解的基因的鉴定
- DOI:
- 发表时间:
2015 - 期刊:
- 影响因子:0
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木下 亜有美;松尾 拓哉;丹羽 由実;山野 隆志;福澤 秀哉;石浦 正寛 - 通讯作者:
石浦 正寛
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- 资助金额:
$ 5.25万 - 项目类别:
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嗜热蓝藻DNA微阵列的研制及其在生物钟研究中的应用
- 批准号:
15013223 - 财政年份:2003
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Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
生物時計装置の原子レベルでの解明
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- 批准号:
15657047 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 5.25万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
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生物钟相关分子伴侣和 ATP 依赖性蛋白酶的鉴定及其作用机制
- 批准号:
15032220 - 财政年份:2003
- 资助金额:
$ 5.25万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas