病原細菌のゲノム進化におけるレトロンとインテグロンの役割

逆转录子和整合子在病原菌基因组进化中的作用

• 批准号: 16013236
• 负责人: 島本 整
• 金额: $ 3.2万
• 依托单位: Hiroshima University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16013236/
• 关键词: レトロン; インテグロン; SXT element; 腸管侵入性大腸菌; 病原性大腸菌; サルモネラ; 薬剤耐性

本研究は,転移性遺伝因子と考えられているレトロンとインテグロンが病原細菌のゲノム進化にどのような役割を果たしているのかを明らかにすることを目的としている。流行性コレラの原因となるVibrio cholerae O1/O139株(コレラ菌)には普遍的にレトロンが存在しているのに対して,コレラを引き起こさないnon-O1/non-O139株では一部の例外を除いてレトロンが存在しておらず,レトロン領域にゲノム構造の多様性が認められた。さらに例外的にnon-O1/non-O139株で発見されたレトロンでは,レトロン領域の前後で数多くの変異が見つかっており,ゲノムのレトロン領域の多様性が明らかになった。一方,V.cholerae,病原性大腸菌(enterotoxigenic Escherlchia coli ETEC),腸管侵入性大腸菌(enteroinvasive E.coil, EIEC), Salmonellaなどから数多くのインテグロンを検出し,インテグロン内の遺伝子カセット(薬剤耐性遺伝子)の構造解析を行った。その結果,これまでに知られていなかった新たな遺伝子を複数発見し,同じ細菌種内でもインテグロンによるゲノム構造の違いを示すことができた。特に,サルモネラでは,新たな遺伝子構成のクラス2インテグロンを発見した。さらに,これまでV.choleraeにおいてのみ存在が報告されていた接合伝達性トランスポゾンの一種であるSXT elementをV.fluvialisで発見し,詳しい解析を行った。SXT elementには複数の薬剤耐性遺伝子が含まれており,細菌の多剤耐性の伝播に関与していると考えられており,V.cholerae以外の多種の細菌で発見された意義は大きい。

In this study, transmissibility factors were tested. The pathogen was not detected. The pathogen was improved. The results showed that there was no significant difference between the results of this study. The causes of epidemic diseases include Vibrio cholerae O1/O139 strains (bacteria), which are common in the world. In addition to the exception of the prevalence of non-O1/non-O139 strains, which are common in the world, there is an exception, except that there is a disease in the field. For the exception of the non-O1/non-O139, you can see that the number of areas in the field is different, the number of areas in the field is different, and the number of areas is different. On one side, V.cholerae, pathogen enterotoxigenic Escherlchia coli ETEC, enteroinvasive E.coil, EIEC, Salmonella infection were more frequently detected and analyzed. According to the results, please know that there is a significant difference in the number of new messages. Please see the copy number, which is the same as that of the bacteria. In this case, please tell me that the new one is not in the first place, so that I can see you in the first place. There are reports, reports, contacts, sex, SXT element, V.fluvialis, see, parse, and parse. SXT element multiplicative endurance test contains microbes, multiple endurance tests, and multiple endurance tests. Other than V.cholerae, it means a lot of bacteria.

项目成果

Complex Formation between a Putative 66-Residue Thumb Domain of Bacterial Reverse Transcriptase RT-Ec86 and the Primer Recognition RNA*

• DOI: 10.1074/jbc.m408462200
• 发表时间: 2004-12
• 期刊: Journal of Biological Chemistry
• 影响因子: 4.8
• 作者: M. Inouye;Haiping Ke;Ariko Yashio;K. Yamanaka;H. Nariya;T. Shimamoto;S. Inouye

Molecular characterization of integrons in non-typhoid Salmonella serovars isolated in Japan:: description of an unusual class 2 integron

• DOI: 10.1093/jac/dkh534
• 发表时间: 2005-03-01
• 期刊: JOURNAL OF ANTIMICROBIAL CHEMOTHERAPY
• 影响因子: 5.2
• 作者: Ahmed, AM;Nakano, H;Shimamoto, T
• 通讯作者: Shimamoto, T

A variant type of Vibrio cholerae SXT element in a multidrug-resistant strain of Vibrio fluvialis

• DOI: 10.1016/j.femsle.2004.11.012
• 发表时间: 2005-01-15
• 期刊: FEMS MICROBIOLOGY LETTERS
• 影响因子: 2.1
• 作者: Ahmed, AM;Shinoda, S;Shimamoto, T
• 通讯作者: Shimamoto, T

Plasmid-encoded class 1 integron carrying sat, phosphoserine phosphatase gene and aadA2 from enterotoxigenic Escherichia coli O159 in Japan

质粒编码的 1 类整合子，携带来自日本产肠毒素大肠杆菌 O159 的 sat、磷酸丝氨酸磷酸酶基因和 aadA2

• 发表时间: 2004
• 期刊: FEMS Microbiology Letters 235
• 作者: Okuda;K.;Hayashi;H.;Nishiyama;Y.;Ashraf M.Ahmed
• 通讯作者: Ashraf M.Ahmed

Molecular characterization of a multidrug-resistant strain of enteroinvasive Escherichia coli O164 isolated in Japan

• DOI: 10.1099/jmm.0.45908-0
• 发表时间: 2005-03-01
• 期刊: JOURNAL OF MEDICAL MICROBIOLOGY
• 影响因子: 3
• 作者: Ahmed, AM;Miyoshi, S;Shimamoto, T
• 通讯作者: Shimamoto, T