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ホヤ初期胚細胞の運命決定に関与する遺伝子の機能解析

海鞘早期胚胎细胞命运决定基因的功能分析

基本信息

批准号：
15011241
负责人：
藤原滋樹
金额：
$ 1.92万
依托单位：
Kochi University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

1.計15の発生段階(受精卵、2細胞期、4細胞期、8細胞期・・・)のホヤ胚からポリ(A)^+RNAを抽出・精製し、Cy3またはCy5で標識したcDNAプローブを作製した。2.ホヤの全遺伝子の約85%に対応する2万のスポットを載せたオリゴチップを用いて、15の発生段階の胚の遺伝子発現量を解析した。各発生段階のRNA量を受精卵のサンプルと比較することによって、発生段階を通じての遺伝子発現量の増減を追跡した。競合ハイブリダイゼーション実験は全て完了し、データを99のクラスターに分類した。現在、ある程度以下の発現の増減を無視するなどというようなフィルターをかけて、できるだけ意味のあるデータを抽出できるようクラスタリング法を検討中である。オリゴチップ解析は、京大・佐藤矩行教授、北大・安住薫博士と共同で行った。またクラスタリングのアルゴリズムについては北大工学部・原口誠教授のご協力をいただいている。3.オリゴチップ解析により、8〜32細胞期までのごく初期の胚で発現が上昇する50クローンほどピックアップし、in situ解析用のRNAプローブを合成した。これまでに知られている発生制御遺伝子のほとんどは32細胞期よりも後に転写が活性化するので、今回発見した遺伝子は、モザイク発生をするホヤ胚において細胞の運命決定カスケードの最も上位で機能するzygoticな遺伝子の可能性もある。現在、これらの遺伝子のin situ解析を行っている。4.昨年度の特定領域研究の補助を受けて行ったホヤ胚レチノイン酸標的遺伝子のマイクロアレイ解析の結果については、レチノイン酸受容体・合成酵素・分解酵素の発現・機能解析と合わせて数編の論文として発表した。

1. The 15 stages of embryo development (fertilized egg, 2-cell stage, 4-cell stage, 8-cell stage) were extracted, purified, cy3-cy5-cy5-cy6-cy5-cy5 2. About 85% of the total number of genes were detected in the 20,000 pairs of genes. The amount of RNA at each developmental stage was compared with the amount of DNA at each developmental stage, and the amount of DNA at each developmental stage was tracked. The competition is over. Now, the increase in the occurrence of the following levels is ignored. The meaning of the increase is extracted. The method of analysis is discussed. Professor Yoshiyuki Sato of Peking University and Dr. Yasumi of Peking University Professor Makoto Haraguchi of the Department of Engineering of Peking University 3. RNA synthesis for analysis in situ from 8 to 32 cell stages This is because we know that there is a possibility of activation of zygotic gene in the development of zygotic gene in the 32-cell stage, but we also know that there is a possibility of activation of zygotic gene in the development of zygotic gene in the development of zygotic gene in the cell. Now, this is the first time that I've been in a position to analyze it. 4. Last year's domain-specific research was supported by the development of a novel enzyme, a synthetic enzyme, and the development of a functional enzyme.