ホヤ初期胚細胞の運命決定に関与する遺伝子の機能解析

海鞘早期胚胎细胞命运决定基因的功能分析

• 批准号: 14011235
• 负责人: 藤原 滋樹
• 金额: $ 1.92万
• 依托单位: Kochi University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2002 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-14011235/
• 关键词: ホヤ; EST解析; レチノイン酸; マイクロアレイ; 脊索動物; 進化; 遺伝子発現; 細胞分化

(1)カタユウレイボヤ卵割期のEST解析によって得られたcDNAの大規模in situ解析を進めた。In situデータはwebサイト(http://ghost.zool.kyoto-u.ac.jp/indexrl.html)にuploadした。昨年度までに得られたものに加えて、さらに多数の割球特異的なcDNAを同定した。(2)割球特異的mRNAをコードする数十のcDNAについて、RNAiやアンチセンスS-オリゴによる機能阻害実験、他の遺伝子のエンハンサーにcDNAを連結して胚に導入し異所的に発現させる実験などを行った。当初、エレクトロポレーションによる遺伝子導入を試みていたが、最近は顕微注入による導入に変更し、データを集めているところである。(3)カタユウレイボヤの9287遺伝子のcDNAを載せたマイクロアレイを作製した(クローンの取得については京大・佐藤矩行教授、アレイ作製と解析は遺伝研・五條堀孝教授と中澤真澄博士のご協力をいただいた)。(4)マイクロアレイを利用して、レチノイン酸標的遺伝子の探索を行った。アレイ解析によりレチノイン酸による発現調節を受けることが予想された約100の遺伝子についてin situ解析を行い、レチノイン酸処理胚における空間的発現の変化を記載した。胚におけるレチノイン酸標的遺伝子は脊椎動物でも行われておらず、今回の解析では多数の新規標的遺伝子を発見できた。この結果はwebサイト(http://www.kochi-u.ac.jp/~tatataa/RA/RA-targets.html)で公開しており、論文も投稿中である。我々の得たデータは、今後他の脊索動物において行われる同様の研究にとってスタンダードとなることが期待される。また、レチノイン酸による発生制御は脊索動物特有のメカニズムなので、本研究は脊索動物の進化を考察する上で重要である。

(1)The EST analysis of the gene in the early stage of the genome was carried out on a large scale. In situデータはwebサイト(http://ghost.zool.kyoto-u.ac.jp/indexrl.html)にuploadした。Most of the cDNA fragments were identified in the same way. (2)Tens of cDNAs are linked to the expression of specific mRNA, RNAi and RNA, and the expression of cDNA is linked to the expression of specific mRNA. At the beginning, the introduction of the gene was tested, and recently, the introduction of the gene was tested, and the gene was tested. (3)9287 gene cDNA was obtained by Keida Sato, Professor Takashi Gojō, and Dr. Masumi Nakazawa. (4)The exploration of genetic resources in the use of natural resources About 100 samples were analyzed in situ, and the occurrence of space was recorded. In the past, most of the new target genes have been discovered in vertebrates. The results of this paper are published in the web (http://www.kochi-u.ac.jp/<$tatata/RA/RA-targets. html). We are looking forward to the study of chordates in the future. This study is important for investigating the evolution of chordates.

项目成果

Fujiwara, S.: "Acquisition of retinoic acid signaling pathway and innovation of the chordate body plan"Zoological Science. (印刷中). (2003)

Fujiwara, S.：“视黄酸信号通路的获取和脊索动物身体计划的创新”动物学科学（2003 年）。

藤原滋樹: "ホヤのRNAiプロトコル"細胞工学. 21. 771-777 (2002)

Shigeki Fujiwara：“海鞘的 RNAi 方案”《细胞工程》21. 771-777 (2002)。

藤原滋樹: "カタユウレイボヤ初期胚の遺伝子発現プロファイル"生化学. (印刷中). (2003)

Shigeki Fujiwara：“海鞘早期胚胎的基因表达谱”生物化学（印刷中）。

Fujiwara, S.: "Gene expression profiles in Ciona intestinalis cleavage-stage embryos"Mechanisms of Development. 112. 115-127 (2002)

Fujiwara, S.：“玻璃海鞘卵裂期胚胎的基因表达谱”发育机制。

Nagatomo, K.: "Retinoic acid affects gene expression and morphogenesis without upregulating the retinoic acid receptor in the ascidian Ciona intestinalis."Mechanisms of Development. 120. 363-372 (2003)

Nagatomo, K.：“视黄酸影响基因表达和形态发生，而不上调海鞘海鞘中的视黄酸受体。”发育机制。