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アサガオゲノムの解析

アサガオゲノムの解析
牵牛花基因组分析
批准号:
15011242
负责人:
仁田坂 英二
金额:
$3.14万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 --

项目摘要

项目成果

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(1)突然変異系統の解析将来的な遺伝子クローニングに向けて、交配による遺伝学的解析や、バックグラウンドの置換を立田(MAPLE)遺伝子をはじめとするいくつかの変異体について行った。このような系統は通じて挿入しているトランスポゾン(Tpn1ファミリー)の転移が促進されるため、以下のSTD法による遺伝子クローニングなどの基質にも適していることがわかった。(2)突然変異体の原因遺伝子遺伝子の解析マルバアサガオの八重咲き変異体であるfpの原因遺伝子を解析した結果、C機能MADS-box遺伝子に、近年多くの生物のゲノムに多コピー存在するHelitronと関連したトランスポゾン(Helip1)が挿入していた。体細胞内でこのHellip1が頻繁に離脱するため表現型は不安定である。これまで実際に活性のあるHelitronは知られておらず、このマルバアサガオのfp変異体はHelitronを研究する上でも非常に有効な系だと考えられる。STD法によって獅子(fe)遺伝子のクローニングに成功した。獅子遺伝子は、側生器官の裏側で発現し、背軸側の特徴を決定しているシロイヌナズナのKAN1遺伝子ともっとも高い相同性を持っており、同様の機能を持つと予想された。(3)cDNAライブラリーの作製・ESTデータベースの構築これまで作製していた蕾の均一化・完全長cDNAライブラリーについては5万クローン以上におよぶ配列を決定し、データベースを構築して他の生物種の遺伝子との相同性等の解析を行っている。このライブラリーを解析した結果、カバーしていない遺伝子があることが明らかになったため、今年度は幼植物の均一化・完全長cDNAライブラリーを作製し品質のテスト等を行った。次年度以降このクローンについても配列決定・データベース構築を行っていく予定である。
期刊论文(12)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Iida, S: "Genetic and epigenetics in flower pigmentation associated with transposable elements in morning glories"Adv.Biophysics. 38(in press). (2003)
Iida, S:“与牵牛花转座元件相关的花色素沉着的遗传和表观遗传学”Adv.Biophysicals。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Nitasaka, E.: "Insertion of an En/Spm-related transposable element into a floral homeotic gene DUPLICATED causes a double flower phenotype in the Japanese morning glory."Plant J.. 36. 522-531 (2003)
Nitasaka, E.:“将 En/Spm 相关转座元件插入重复的花同源异型基因中会导致日本牵牛花出现双花表型。”Plant J.. 36. 522-531 (2003)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Suzuki, Y.: "A dwarf mutant strain of Pharbitis nil, Uzukobito (kobito), has defective brassinosteroid biosynthesis"Plant J.. 36. 401-410 (2003)
Suzuki, Y.:“Pharbitis nil 的矮突变株 Uzukobito (kobito) 具有油菜素类固醇生物合成缺陷”Plant J.. 36. 401-410 (2003)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Hoshino, A.: "Spontaneous mutations of the flavonoid 3'-hydroxylase gene conferring reddish flowers in the three morning glory species"Plant Cell Physiol.. 44. 990-1001 (2003)
Hoshino, A.:“类黄酮 3-羟化酶基因的自发突变使三种牵牛花呈红色花朵”植物细胞生理学.. 44. 990-1001 (2003)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
6
    Mechanisms of cultivar diversification by transposons using the Japanese morning glory as a model
    • 批准号:
      22K05632
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
    • 资助金额:
      $2.66万
    • 财政年份:
      2022
    • 负责人:
      仁田坂 英二
    • 依托单位:
    転移可能な新規ヘリトロン様トランスポゾンHeliplの構造と転移機構
    • 批准号:
      18657004
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额:
      $2.11万
    • 财政年份:
      2006
    • 负责人:
      仁田坂 英二
    • 依托单位:
    アサガオゲノムの解析
    • 批准号:
      16011244
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $2.5万
    • 财政年份:
      2002
    • 负责人:
      仁田坂 英二
    • 依托单位:
    アサガオゲノムの解析
    • 批准号:
      14011236
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $2.88万
    • 财政年份:
      2002
    • 负责人:
      仁田坂 英二
    • 依托单位:
    海外基金