アサガオゲノムの解析

牵牛花基因组分析

基本信息

批准号：
15011242
负责人：
仁田坂英二
金额：
$ 3.14万
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-15011242/
关键词：
アサガオトランスポゾン Tpn1ファミリー Ipomoea ESTデータベース

项目摘要

(1)突然変異系統の解析将来的な遺伝子クローニングに向けて、交配による遺伝学的解析や、バックグラウンドの置換を立田(MAPLE)遺伝子をはじめとするいくつかの変異体について行った。このような系統は通じて挿入しているトランスポゾン(Tpn1ファミリー)の転移が促進されるため、以下のSTD法による遺伝子クローニングなどの基質にも適していることがわかった。(2)突然変異体の原因遺伝子遺伝子の解析マルバアサガオの八重咲き変異体であるfpの原因遺伝子を解析した結果、C機能MADS-box遺伝子に、近年多くの生物のゲノムに多コピー存在するHelitronと関連したトランスポゾン(Helip1)が挿入していた。体細胞内でこのHellip1が頻繁に離脱するため表現型は不安定である。これまで実際に活性のあるHelitronは知られておらず、このマルバアサガオのfp変異体はHelitronを研究する上でも非常に有効な系だと考えられる。STD法によって獅子(fe)遺伝子のクローニングに成功した。獅子遺伝子は、側生器官の裏側で発現し、背軸側の特徴を決定しているシロイヌナズナのKAN1遺伝子ともっとも高い相同性を持っており、同様の機能を持つと予想された。(3)cDNAライブラリーの作製・ESTデータベースの構築これまで作製していた蕾の均一化・完全長cDNAライブラリーについては5万クローン以上におよぶ配列を決定し、データベースを構築して他の生物種の遺伝子との相同性等の解析を行っている。このライブラリーを解析した結果、カバーしていない遺伝子があることが明らかになったため、今年度は幼植物の均一化・完全長cDNAライブラリーを作製し品質のテスト等を行った。次年度以降このクローンについても配列決定・データベース構築を行っていく予定である。

（1）对未来基因克隆的准备突变线的分析，通过交配进行遗传分析，并在包括Tatsuta（Tatsuta（Maple）基因）的几个突变体上进行了背景替代。由于这样的线促进了插入的转座子（TPN1家族）的转移，因此已发现它适用于通过以下STD方法进行基因克隆之类的底物。（2）分析图库画廊中一种双束缚突变体的突变体的致病基因基因的分析表明，近年来，与Helitron相关的转座子（Helip1）近年来已经存在于许多拷贝中的许多拷贝中。由于在体细胞内经常退出地狱，该表型是不稳定的。到目前为止，尚无实际的主动螺旋子众所周知，sl子的FP突变体被认为是研究螺旋子的非常有效的系统。使用STD方法成功克隆了狮子（Fe）基因。狮子基因在外侧器官后面表达，与拟南芥Kan1基因具有最高的同源性，该基因决定其腹部轴向特征，并有望具有相似的功能。（3）创建cDNA库/EST数据库的构建迄今为止已经生产的芽和全长cDNA库的均质化已被对50,000多个克隆进行了测序，并且该数据库构建以与其他物种的基因分析同源性。对该库的分析表明，没有覆盖的基因，因此今年我们创建了一个均质的幼苗基于植物的全长cDNA库，并测试了其质量。从明年开始，我们计划还计划并为此克隆构建数据库。