アサガオゲノムの解析

牵牛花基因组分析

• 批准号: 16011244
• 负责人: 仁田坂 英二
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2002 至 2004
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16011244/
• 关键词: アサガオ; トランスポゾン; Ipomoea; ESTデータベース; 形態形成

突然変異系統の解析:将来的な遺伝子クローニングに向けて、交配による遺伝学的解析や、バックグラウンドの置換をmaple(立田)やclavated(吹詰)をはじめとするいくつかの変異体について行った。また、EMSによる突然変異誘発系統や、Tpnトランスポゾンの転移が活性化しているが野生型の表現型を示す系統の作製など、新規突然変異誘発に向けての様々な準備を行った。突然変異体の原因遺伝子遺伝子の解析:前年度、向背軸形成に関わる、アサガオのFE(FEATHERD ;獅子)遺伝子の単離に成功し、より詳細な解析を行った。現在維持されている強いfe系統を野生型と交配して分離実験を行ったところ、弱いものから元の系統同様に強い変異体、またその中間型が分離した。この分離比から、葉と花に関わる主要な修飾変異がそれぞれ1つ存在すると推定した。また、他の実験植物で明らかになっている向背軸の形成に関与する遺伝子のfe変異体における転写量を解析したところ、CRC(CRABS CROW)転写量が顕著に減少していたため、修飾変異の1つがこのCRCに対応する可能性があると考えて、引き続き解析を行っている。雄しべが花弁に転換するpt(petaloid ;八重咲)変異体と、強い生殖器官の花被への変換を示すdp(duplicated; 牡丹)変異体と交配実験を行った結果、ptは弱いDP遺伝子の対立遺伝子であることが明らかになり、突然変異遺伝子の構造を解析した結果、完全な形のTpn109トランスポゾンがDP遺伝子の第2イントロンに挿入しており、これが離脱する際にまわりのゲノムを欠失させることで、強いdp変異体が生成したことが明らかになった。マルバアサガオの八重咲き変異体であるfpの原因遺伝子に挿入していた新規トランスポゾンである、Hellip1の転移活性を調べるため、シロイヌナズナに導入して転移活性を調べた。cDNAライブラリーの作製・ESTデータベースの構築:これまで作製していた蕾の均一化・完全長cDNAライブラリーの配列を解析した結果、カバーしていない遺伝子があることが明らかになったため、幼植物の均一化・完全長cDNAライブラリーを作製した。今後小原先生との共同研究で、この末端配列の解析を行う予定である。

突变线的分析：对于未来的基因克隆，对包括枫木和claved的几个突变体进行了交配和背景替代的遗传分析。此外，为新的诱变做出了各种准备，包括通过EMS创建诱变以及激活TPN转座转移但表现出野生型表型的菌株的产生。分析突变体的基因：在上一年，我们成功地分离了与腹部轴形成有关的晨荣耀的Fe（狮子）基因，并进行了更详细的分析。当我们通过将当前维持的强大FE线与野生型配对进行分离实验时，我们发现弱的实验与强突变体分开，如原始线和中间线。该分离比表明叶子和花朵中涉及一个主要的修饰突变。此外，当我们分析与腹部轴形成的基因的Fe突变体中的转录量（在其他实验植物中已经揭示出来时，CRC中的转录量（Crabs Crow）中的转录量显着降低，因此我们继续分析结果，认为其中一个改良的突变可能与此CRC相对应。我们使用PT（叶柄）突变体进行了交配实验，该突变体将雄蕊转化为花瓣和DP（重复的）突变体，该突变体显示了强大的生殖器官向花盖的转化，并且揭示了PT是弱DP基因的等位基因，并发现了完整的DP基因，并分析了TP的二次插入TP的结构。 DP基因，当撤回该基因时，会产生强大的DP突变体。为了调查Hellip1的转移活性，Hellip1是一种新型的转座子，被插入了Glogital FP的基因，该基因是画廊画廊中的一个双束缚突变体，我们将其引入了拟南芥中，以研究其转移活性。 cDNA文库的制备和EST数据库的构建：芽同质化的序列和全长cDNA文库的分析，该序列始于现在，这些cDNA文库现在揭示了尚未覆盖的基因，因此我们创建了一个均质化和全长cDNA库。将来，我们计划与Ohara教授合作分析这个终端序列。

项目成果

Insertion of an En/Spm-related transposable element into a floral homeotic gene DUPLICATED causes a double flower phenotype in the Japanese morning glory.

• DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01896.x
• 发表时间: 2003-11
• 期刊: The Plant journal : for cell and molecular biology
• 作者: E. Nitasaka

A dwarf mutant strain of Pharbitis nil, Uzukobito (kobito), has defective brassinosteroid biosynthesis.

• DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01887.x
• 发表时间: 2003-11
• 期刊: The Plant journal : for cell and molecular biology
• 作者: Yoshihito Suzuki;K. Saso;S. Fujioka;S. Yoshida;E. Nitasaka;S. Nagata;H. Nagasawa;S. Takatsuto;I. Yamaguchi