アサガオゲノムの解析

牵牛花基因组分析

• 批准号: 16011244
• 负责人: 仁田坂 英二
• 金额: $ 2.5万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2002
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2002 至 2004
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16011244/
• 关键词: アサガオ; トランスポゾン; Ipomoea; ESTデータベース; 形態形成

突然変異系統の解析:将来的な遺伝子クローニングに向けて、交配による遺伝学的解析や、バックグラウンドの置換をmaple(立田)やclavated(吹詰)をはじめとするいくつかの変異体について行った。また、EMSによる突然変異誘発系統や、Tpnトランスポゾンの転移が活性化しているが野生型の表現型を示す系統の作製など、新規突然変異誘発に向けての様々な準備を行った。突然変異体の原因遺伝子遺伝子の解析:前年度、向背軸形成に関わる、アサガオのFE(FEATHERD ;獅子)遺伝子の単離に成功し、より詳細な解析を行った。現在維持されている強いfe系統を野生型と交配して分離実験を行ったところ、弱いものから元の系統同様に強い変異体、またその中間型が分離した。この分離比から、葉と花に関わる主要な修飾変異がそれぞれ1つ存在すると推定した。また、他の実験植物で明らかになっている向背軸の形成に関与する遺伝子のfe変異体における転写量を解析したところ、CRC(CRABS CROW)転写量が顕著に減少していたため、修飾変異の1つがこのCRCに対応する可能性があると考えて、引き続き解析を行っている。雄しべが花弁に転換するpt(petaloid ;八重咲)変異体と、強い生殖器官の花被への変換を示すdp(duplicated; 牡丹)変異体と交配実験を行った結果、ptは弱いDP遺伝子の対立遺伝子であることが明らかになり、突然変異遺伝子の構造を解析した結果、完全な形のTpn109トランスポゾンがDP遺伝子の第2イントロンに挿入しており、これが離脱する際にまわりのゲノムを欠失させることで、強いdp変異体が生成したことが明らかになった。マルバアサガオの八重咲き変異体であるfpの原因遺伝子に挿入していた新規トランスポゾンである、Hellip1の転移活性を調べるため、シロイヌナズナに導入して転移活性を調べた。cDNAライブラリーの作製・ESTデータベースの構築:これまで作製していた蕾の均一化・完全長cDNAライブラリーの配列を解析した結果、カバーしていない遺伝子があることが明らかになったため、幼植物の均一化・完全長cDNAライブラリーを作製した。今後小原先生との共同研究で、この末端配列の解析を行う予定である。

Analysis of sudden change system: future genetic analysis, mating analysis, genetic analysis, genetic replacement, maple(field), claved (question), reverse, middle and different genetic analysis. In addition, the system of mutation induction of EMS, Tpn mutation and its activation in wild type phenotype are prepared for mutation induction of EMS. Analysis of the cause of sudden change of genetic inheritance: previous year, the formation of the dorsal axis, the failure of FE(FEATHERD ; LION) genetic inheritance, the success of the failure, detailed analysis of the line. Now maintain the strong fe system, wild type mating, weak fe system identity, strong fe system identity, intermediate fe system isolation. The separation ratio of leaves and flowers is mainly modified and different from each other. The analysis of the amount of CRC (CRABS CROW) content is related to the formation of the dorsal axis of other plants, and the analysis of the amount of CRC(CRABS CROW) content is related to the reduction of CRC content. The male and female are the first to change their minds.(petaloid ; octal) variant, strong, genital organs, perianth, change, dp (duplicated; Peony) heterosexual mating results, pt weak DP vector pairs, pt weak DP vector pairs, pt weak Strong dp is generated. The reason for this is that Hellip1 has a higher activity than the other two. Construction of cDNA sequence: Homogenization of bud, complete length cDNA sequence analysis, Homogenization of young plant, complete length cDNA sequence analysis. In the future, Mr. Ohara will jointly study the analysis of the terminal arrangement.

项目成果

Spontaneous mutations of the flavonoid 3′-hydroxylase gene conferring reddish flowers in the three morning glory species

• DOI: 10.1093/pcp/pcg143
• 发表时间: 2003-10-01
• 期刊: PLANT AND CELL PHYSIOLOGY
• 影响因子: 4.9
• 作者: Hoshino, A;Morita, Y;Iida, S
• 通讯作者: Iida, S

A dwarf mutant strain of Pharbitis nil, Uzukobito (kobito), has defective brassinosteroid biosynthesis.

• DOI: 10.1046/j.1365-313x.2003.01887.x
• 发表时间: 2003-11
• 期刊: The Plant journal : for cell and molecular biology
• 作者: Yoshihito Suzuki;K. Saso;S. Fujioka;S. Yoshida;E. Nitasaka;S. Nagata;H. Nagasawa;S. Takatsuto;I. Yamaguchi

Characterization of Tpn1 family in the Japanese morning glory:: En/Spm-related transposable elements capturing host genes

• DOI: 10.1093/pcp/pch109
• 发表时间: 2004-07-01
• 期刊: PLANT AND CELL PHYSIOLOGY
• 影响因子: 4.9
• 作者: Kawasaki, S;Nitasaka, E
• 通讯作者: Nitasaka, E

A novel microsatellite locus isolated from an AFLP fragment in the mangrove species Kandelia obovata (Rhizophoraceae).

从红树种秋茄（红树科）的 AFLP 片段中分离出的一个新的微卫星位点。

• 发表时间: 2005
• 期刊: J Plant Res. 118
• 作者: Harada K;Okaura T;Giang LH;Huan NV;Iwasaki M;Nitasaka E.
• 通讯作者: Nitasaka E.

An intragenic tandem duplication in a transcriptional regulatory gene for anthocyanin biosynthesis confers pale-colored flowers and seeds with fine spots in Ipomoea tricolor

• DOI: 10.1111/j.1365-313x.2004.02098.x
• 发表时间: 2004-06-01
• 期刊: PLANT JOURNAL
• 影响因子: 7.2
• 作者: Park, KI;Choi, JD;Iida, S
• 通讯作者: Iida, S