アサガオゲノムの解析

牵牛花基因组分析

基本信息

批准号：
12202040
负责人：
仁田坂英二
金额：
--
依托单位：
Kyushu University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2000
资助国家：
日本
起止时间：
2000 至无数据
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12202040/
关键词：
アサガオトランスポゾン Tpn Ipomoea 連鎖地図

项目摘要

アサガオは、江戸時代後期に多くの自然突然変異体が単離され、さらに大正から昭和初期にかけて、わが国で古典遺伝学的研究が盛んに行われた。本研究の目的は今後の分子生物学的研究の基礎となるようなアサガオのゲノム解析を行うことである。我々のグループは既に、アサガオの変異の大部分は、En/Spm系のTpn1類縁のトランスポゾン(Tpn1ファミリー)の挿入によるという事を見出している。具体的には以下の項目について研究を行った。1)突然変異系統の解析・整理:500系統以上、約3000個体の系統更新・写真記録を行い、この際に各系統の突然変異形質の記録を行った。2)統合的連鎖地図の作製:約400のAFLPマーカー、表現型マーカー、クローン化された遺伝子の分子マーカーを用いて15連鎖群からなる最初のバージョンの連鎖地図を作製した。今後、AFLPマーカーを、より精度の高い、クローン化された遺伝子やESTによる共優性マーカーに切り替えていきたい。3)Tpn1ファミリーの解析:Tpn1ファミリーを含む約200クローンを制限酵素地図で分類し、現在までに24グループについて塩基配列を決定した。その結果、内部配列はアサガオの遺伝子を取り込んだ特殊な構造をしていることが明らかになった。塩基配列決定したTpnの中でtransposaseをコードしている自律型因子を同定する。4)Tpn1ファミリーを指標にした突然変異体の原因遺伝子の単離・解析:Tpnによりタグされた未知有用遺伝子を簡単に同定できる簡易トランスポゾンディスプレイ(Simplified Transposon Display;STD)法を開発し、紫地に青色の絞り花を咲かせる易変性「紫」変異purple-mutableの同定に成功した。このSTD法は非常に有効であり、今後、他の易変性を示す突然変異体に応用し原因遺伝子を単離する。4)均一化cDNAライブラリーの作製・塩基配列決定等については現在準備を行っている。

在江户时代晚期，隔离了许多晨荣耀的自然突变体，从泰沙（Taisho）时期到早期的日本，经典的遗传研究在日本进行了积极进行。这项研究的目的是对早晨荣耀进行基因组分析，这将是未来分子生物学研究的基础。我们的小组已经发现，大多数早晨的荣耀突变是由于EN/SPM系统的TPN1相关转座（TPN1家族）插入。具体而言，研究了以下项目：1）突变菌株的分析和排列：谱系更新和500多个菌株的照片和大约3,000个个体的照片，并在此时记录每个菌株的突变特性。 2）创建一个集成的链接图：使用大约400个AFLP标记，表型标记和克隆基因的分子标记生成了由15个链接组组成的第一个链接图。将来，我们希望将AFLP标记转换为由克隆基因和EST组成的更准确，更具共同的标记。 3）对TPN1家族的分析：将大约200个包含TPN1家族的克隆分类为限制图，并且迄今已确定了24组的基本序列。结果，揭示了内部序列具有特殊的结构，该结构融合了晨荣的基因。在测序的TPN中鉴定出编码转座酶的自主因子。 4）使用TPN1家族对突变体的致病基因进行隔离和分析：我们开发了一种简单的转座子显示（STD）方法，可以轻松识别用TPN标记的未知有用基因，并成功地鉴定出一种退化的“紫色”突变体紫色 - 可在紫色背景上产生蓝色的花朵。该性病方法非常有效，将应用于未来表现出变性的其他突变体以隔离因果基因。 4）目前正在制备准备和测序均质cDNA文库。