アサガオゲノムの解析

牵牛花基因组分析

• 批准号: 12202040
• 负责人: 仁田坂 英二
• 金额: --
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12202040/
• 关键词: アサガオ; トランスポゾン; Tpn; Ipomoea; 連鎖地図

アサガオは、江戸時代後期に多くの自然突然変異体が単離され、さらに大正から昭和初期にかけて、わが国で古典遺伝学的研究が盛んに行われた。本研究の目的は今後の分子生物学的研究の基礎となるようなアサガオのゲノム解析を行うことである。我々のグループは既に、アサガオの変異の大部分は、En/Spm系のTpn1類縁のトランスポゾン(Tpn1ファミリー)の挿入によるという事を見出している。具体的には以下の項目について研究を行った。1)突然変異系統の解析・整理:500系統以上、約3000個体の系統更新・写真記録を行い、この際に各系統の突然変異形質の記録を行った。2)統合的連鎖地図の作製:約400のAFLPマーカー、表現型マーカー、クローン化された遺伝子の分子マーカーを用いて15連鎖群からなる最初のバージョンの連鎖地図を作製した。今後、AFLPマーカーを、より精度の高い、クローン化された遺伝子やESTによる共優性マーカーに切り替えていきたい。3)Tpn1ファミリーの解析:Tpn1ファミリーを含む約200クローンを制限酵素地図で分類し、現在までに24グループについて塩基配列を決定した。その結果、内部配列はアサガオの遺伝子を取り込んだ特殊な構造をしていることが明らかになった。塩基配列決定したTpnの中でtransposaseをコードしている自律型因子を同定する。4)Tpn1ファミリーを指標にした突然変異体の原因遺伝子の単離・解析:Tpnによりタグされた未知有用遺伝子を簡単に同定できる簡易トランスポゾンディスプレイ(Simplified Transposon Display;STD)法を開発し、紫地に青色の絞り花を咲かせる易変性「紫」変異purple-mutableの同定に成功した。このSTD法は非常に有効であり、今後、他の易変性を示す突然変異体に応用し原因遺伝子を単離する。4)均一化cDNAライブラリーの作製・塩基配列決定等については現在準備を行っている。

ア サ ガ オ は, jiang opens late age more than に く の natural suddenly - variant が 単 from さ れ, さ ら に dazheng か ら showa early に か け て, わ が countries で classical heritage 伝 learning research が sheng ん に line わ れ た. The purpose of this study is to provide a <s:1> foundation for future research in <s:1> molecular biology となるようなアサガ となるようなアサガ ゲノム ゲノム analysis を lines う とである とである とである. I 々 の グ ル ー プ は に, ア サ ガ オ の - most different の は, En/Spm is の Tpn1 class try の ト ラ ン ス ポ ゾ ン (Tpn1 フ ァ ミ リ ー) の scions into に よ る と い を う things show the し て い る. The specific に に is the following に project に に て て て research を line った. 1) Analysis and organization of sudden abnormal systems: over 500 systems, approximately 3,000 individual <s:1> system updates · photo records を lines を, <s:1> interに に records of sudden abnormal substances in each system を lines った. 2) integration of chain 図 の cropping: about 400 の markers マ ー カ ー, phenotype マ ー カ ー, ク ロ ー ン change さ れ た posthumous son 伝 の molecular マ ー カ ー を with い て 15 linkage group か ら な る initially の バ ー ジ ョ ン の chain to 図 を cropping し た. In the future, markers マ ー カ ー を, よ り high precision の い, ク ロ ー ン change さ れ た heritage 伝 son や EST に よ る total optimum マ ー カ ー に り cutting for え て い き た い. 3) Tpn1 フ ァ ミ リ ー の analytic: Tpn1 フ ァ ミ リ ー を contains about 200 of む ク ロ ー ン limitations を enzymes to 図 で classification し, now ま で に 24 グ ル ー プ に つ い て salt base with column を decided し た. そ の results, internal match column は ア サ ガ オ の posthumous son 伝 を take り 込 ん だ な special tectonic を し て い る こ と が Ming ら か に な っ た. The basic coordination determines that the でtransposaseをコ ド ド <s:1> て る る る る る self-regulating factors in the <s:1> たTpn <s:1> are the same as する. 4) Tpn1 フ ァ ミ リ ー を index に し た suddenly - cause of allograft の survived 伝 の 単 from parsing: Tpn に よ り タ グ さ れ た unknown useful legacy 伝 son を Jane 単 に with fixed で き る simple ト ラ ン ス ポ ゾ ン デ ィ ス プ レ イ (Simplified Transposon Display; The STD) method を develops を, purple ground に cyan <s:1> twisted <s:1> flower を saki せる variability "purple" variable purple-mutable <s:1> fixed に success た た. The <s:1> STD method する is very に effective であ, in the future, his <s:1> variability を shows す sudden mutants に応 are separated from する by <s:1> reasons. 4) Homogenize the cDNAラ ブラリ ブラリ ブラリ ブラリ for sample preparation, and determine the base arrangement, etc. Youdaoplaceholder2 る て て て now prepare を rows って る る る.

项目成果

仁田坂英二: "伝統の朝顔III-芽生えから開花まで"国立歴史民俗博物館 編. 80 (2000)

日本国立历史博物馆编《传统牵牛花III-从萌芽到开花》80（2000）。

仁田坂英二: "伝統の朝顔III-作り手の世界"国立歴史民俗博物館 編. 80 (2000)

Eiji Nitazaka：“传统牵牛花 III - 制造者的世界”，日本国立历史博物馆，编辑 80（2000）。

A.Hoshino,Y.Johzuka-Hisatomi and S.Iida: "Gene duplication and mobile genetic elements in the morning glories."Gene. (in press). (2001)

A.Hoshino、Y.Johzuka-Hisatomi 和 S.Iida：“牵牛花中的基因复制和移动遗传元件。”基因。

仁田坂英二: "アサガオの系統保存"ライフサイエンスのための系統保存とデータバンク(中辻憲夫編、共立出版). 63-67 (2000)

Eiji Nittasaka：“牵牛花谱系保存”生命科学谱系保存和数据库（中辻纪夫编辑，共立出版社）63-67（2000）。

T.Shiraiwa,E.Nitasaka and T.Yamazaki: "Geko, a novel gene involved in olfaction in Drosophila melanogaster"J.Neurogenet.. 14. 145-164 (2000)

T.Shiraiwa、E.Nitasaka 和 T.Yamazaki：“Geko，一种参与果蝇嗅觉的新基因”J.Neurogenet.. 14. 145-164 (2000)