転移可能な新規ヘリトロン様トランスポゾンHeliplの構造と転移機構

一种新型可易位的类Helitron转座子Helipl的结构和转座机制

基本信息

  • 批准号:
    18657004
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.11万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Exploratory Research
  • 财政年份:
    2006
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2006 至 2007
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

ヘリトロン(Helitron)は近年のゲノム研究の進展に伴い、高等生物ゲノムの数パーセントを占めるほど多数存在することが明らかになったトランスポゾンである。しかし、これまでヘリトロンの挿入突然変異体についてはトウモロコシ等、数えるほどしか見つかっておらず転移活性のあるものは知られていない。我々が見いだしたマルバアサガオのFP遺伝子(C機能MADS-box遺伝子)に挿入していたHeliplは稀に体細胞復帰変異を起こすため、この系を用いてヘリトロンの自律性因子を含む構造と、その転移機構を明らかにすることを目的として研究を行っている。マルバアサガオのコスミドベクターライブラリーから得られたヘリトロン間で内部にコードされている遺伝子の構造や塩基配列の違いを解析した。その結果、fp遺伝子に挿入しているHeliplは自律性因子の可能性があることが示されたため、アグロバクテリウムを介した形質転換によってシロイヌナズナに導入し、その転移活性を解析した。導入したHeliplの両側を挟むようなプライマーを用いて、離脱した部位の塩基配列を解析したところ、マルバアサガオ中で見られるような、野生型のゲノム配列には復帰しておらず、数塩基の欠失が見られた。これは独立の復帰クローンにおいて共通に見られたため、何らかの機構が介在する可能性が考えられた。マルバアサガオにおけるHeliplの離脱はもとのゲノム配列と全く同じように離脱するが、独立の復帰イベントに由来する複数のクローンについて、離脱部位の周囲の配列を調べたところ、多くの点塩基置換が導入されていた。これはHeliplが離脱した部位に起こる2重鎖切断を宿主が修復する際に行う誤りがちな修復に由来すると考えられた。今回Helipl自体が自律性かどうかの確証は得ることができなかったが、Hellplファミリーは唯一の転移可能なヘリトロンとして今後のトランスポゾン研究への利用が期待される。
ヘ リ ト ロ ン (Helitron) は recent の ゲ ノ ム research の に い, higher biological ゲ ノ ム の number パ ー セ ン ト を of め る ほ ど most existing す る こ と が Ming ら か に な っ た ト ラ ン ス ポ ゾ ン で あ る. し か し, こ れ ま で ヘ リ ト ロ ン の scions into sudden variations variants に つ い て は ト ウ モ ロ コ シ, etc, several え る ほ ど し か see つ か っ て お ら ず move planning activity の あ る も の は know ら れ て い な い. See my 々 が い だ し た マ ル バ ア サ ガ オ の FP heritage 伝 child (C function by MADS - box heritage 伝) に scions into し て い た Helipl は dilute に cells after 帰 - different を up こ す た め, こ の is を with い て ヘ リ ト ロ ン の self-discipline factor を と む structure, そ の planning move organization を Ming ら か に す る こ と を purpose と し を line っ て research て い Youdaoplaceholder0. マ ル バ ア サ ガ オ の コ ス ミ ド ベ ク タ ー ラ イ ブ ラ リ ー か ら have ら れ た ヘ リ ト ロ ン で between internal に コ ー ド さ れ て い る posthumous son 伝 の tectonic や salt base with column の violations い を parsing し た. そ の results, fp but 伝 に scions into し て い る Helipl は self-discipline factor の possibility が あ る こ と が shown さ れ た た め, ア グ ロ バ ク テ リ ウ ム を interface し た form quality planning in に よ っ て シ ロ イ ヌ ナ ズ ナ に import し, そ の planning move active を parsing し た. Import し た Helipl の struck side を carry む よ う な プ ラ イ マ ー を with い て, from し た parts の salt base with column を parsing し た と こ ろ, マ ル バ ア サ ガ オ で seen ら れ る よ う な, wild type の ゲ ノ ム match column に は complex 帰 し て お ら ず, several salt base の owe lost が see ら れ た. こ れ は independent の complex 帰 ク ロ ー ン に お い て に see common ら れ た た め, ら か の が interface in す る possibility が exam え ら れ た. マ ル バ ア サ ガ オ に お け る Helipl の is to take off the は も と の ゲ ノ ム match column と full く じ with よ う に off from す る が, independent の 帰 イ ベ ン ト に origin す る plural の ク ロ ー ン に つ い て の weeks, from parts 囲 の match column を adjustable べ た と こ ろ, multiple く の salt base displacement が import さ れ て い た. こ れ は Helipl が from し off back に た こ る 2 heavy lock cut を host が repair す る international line に う mistakenly り が ち な repair に origin す る と exam え ら れ た. Today back to Helipl autologous が self-discipline か ど う か の corroborate は must る こ と が で き な か っ た が, Hellpl フ ァ ミ リ ー は only の planning move may な ヘ リ ト ロ ン と し て in future の ト ラ ン ス ポ ゾ ン research へ の using が expect さ れ る.

项目成果

期刊论文数量(25)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
アサガオにおいて向背軸形成に関与し葉や花の形態を決定するDELICATE遺伝子の解析
DELICATE 基因的分析,该基因参与牵牛花的近轴形成并决定叶和花的形态
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    黒木 理恵;仁田坂 英二
  • 通讯作者:
    仁田坂 英二
アサガオ
喇叭花
  • DOI:
  • 发表时间:
    2006
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Morita Y;Saitoh M;Hoshino A;Nitasaka E;Iida S;仁田坂英二
  • 通讯作者:
    仁田坂英二
トランスポゾンによって誘発されたアサガオの有用形質
转座子诱导的牵牛花的有用性状
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    横山 講平;仁田坂 英二;仁田坂 英二
  • 通讯作者:
    仁田坂 英二
アサガオのTpnトランスポゾンにおける自律性因子とTpnA1との関係
牵牛花Tpn转座子自主因子与TpnA1的关系
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    横山 講平;仁田坂 英二
  • 通讯作者:
    仁田坂 英二
変化アサガオにおける花・葉型の多様性
不同牵牛花的花和叶类型的多样性
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仁田坂 英二其他文献

Evolutionary Developmental Biology of Nonflowering Land Plants.
非开花陆地植物的进化发育生物学。
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    平本 哲也;仁田坂 英二;仁田坂 英二(一部の執筆を担当);Stefan A. Rensing;Kaoru Suzuki;Tomoaki Nishiyama
  • 通讯作者:
    Tomoaki Nishiyama
シロイヌナズナDNAポリメラーゼIホモログ遺伝子の色素体・ミトコンドリア両ゲノム複製への関与
拟南芥 DNA 聚合酶 I 同源基因参与质体和线粒体基因组复制
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    平本 哲也;仁田坂 英二;仁田坂 英二(一部の執筆を担当);Stefan A. Rensing;Kaoru Suzuki;Tomoaki Nishiyama;Takumi Nishiuchi;西山 智明;山口 和男
  • 通讯作者:
    山口 和男
新たなステージに入ったアサガオ研究、高精度なゲノム解読と幻の黄色いアサガオの再現
牵牛花研究进入新阶段,高精度基因组解码再现幻黄牵牛花
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    星野 敦;仁田坂 英二;Vasanthan JAYAKUMAR;榊原 康文
  • 通讯作者:
    榊原 康文
受けつがれる伝統のアサガオ研究―ゲノム解読にもとづく大航海時代の幕開け
传承下来的牵牛花研究传统:基于基因组解码的发现时代的曙光
  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    星野 敦;仁田坂 英二;Vasanthan JAYAKUMAR;榊原 康文;中川彩美・高橋広夫・Simon Vial-Pradel・小島晶子・町田泰則・町田千代子;星野敦
  • 通讯作者:
    星野敦
アサガオにおける葉の翼片形成に関与する丸葉遺伝子の解析
牵牛花叶翅形成相关圆叶基因分析
  • DOI:
  • 发表时间:
    2018
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    岡本歩,星野敦;福多賢太郎;野口英樹;田中啓介;乗越亮;仁田坂 英二
  • 通讯作者:
    仁田坂 英二

仁田坂 英二的其他文献

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  • DOI:
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
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  • 通讯作者:
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Mechanisms of cultivar diversification by transposons using the Japanese morning glory as a model
以日本牵牛花为模型的转座子品种多样化机制
  • 批准号:
    22K05632
  • 财政年份:
    2022
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
アサガオゲノムの解析
牵牛花基因组分析
  • 批准号:
    15011242
  • 财政年份:
    2003
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
アサガオゲノムの解析
牵牛花基因组分析
  • 批准号:
    16011244
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
アサガオゲノムの解析
牵牛花基因组分析
  • 批准号:
    14011236
  • 财政年份:
    2002
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
アサガオゲノムの解析
牵牛花基因组分析
  • 批准号:
    13202050
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
アサガオにおける形態形成突然変異体の解析
牵牛花形态发生突变体分析
  • 批准号:
    13017216
  • 财政年份:
    2001
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
アサガオゲノムの解析
牵牛花基因组分析
  • 批准号:
    12202040
  • 财政年份:
    2000
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
アサガオにおける花の形態形成遺伝子のクローニング
牵牛花花形态发生基因的克隆
  • 批准号:
    11163220
  • 财政年份:
    1999
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
アサガオの形態形成突然変異体の解析
牵牛花形态发生突变体分析
  • 批准号:
    12037215
  • 财政年份:
    1998
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
アサガオにおける花の形態形成遺伝子のクローニング
牵牛花花形态发生基因的克隆
  • 批准号:
    10182222
  • 财政年份:
    1998
  • 资助金额:
    $ 2.11万
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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作者:{{ showInfoDetail.author }}

知道了