転移可能な新規ヘリトロン様トランスポゾンHeliplの構造と転移機構

一种新型可易位的类Helitron转座子Helipl的结构和转座机制

• 批准号: 18657004
• 负责人: 仁田坂 英二
• 金额: $ 2.11万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 2006
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2006 至 2007
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-18657004/
• 关键词: トランスポゾン; ヘリトロン; アサガオ

ヘリトロン(Helitron)は近年のゲノム研究の進展に伴い、高等生物ゲノムの数パーセントを占めるほど多数存在することが明らかになったトランスポゾンである。しかし、これまでヘリトロンの挿入突然変異体についてはトウモロコシ等、数えるほどしか見つかっておらず転移活性のあるものは知られていない。我々が見いだしたマルバアサガオのFP遺伝子(C機能MADS-box遺伝子)に挿入していたHeliplは稀に体細胞復帰変異を起こすため、この系を用いてヘリトロンの自律性因子を含む構造と、その転移機構を明らかにすることを目的として研究を行っている。マルバアサガオのコスミドベクターライブラリーから得られたヘリトロン間で内部にコードされている遺伝子の構造や塩基配列の違いを解析した。その結果、fp遺伝子に挿入しているHeliplは自律性因子の可能性があることが示されたため、アグロバクテリウムを介した形質転換によってシロイヌナズナに導入し、その転移活性を解析した。導入したHeliplの両側を挟むようなプライマーを用いて、離脱した部位の塩基配列を解析したところ、マルバアサガオ中で見られるような、野生型のゲノム配列には復帰しておらず、数塩基の欠失が見られた。これは独立の復帰クローンにおいて共通に見られたため、何らかの機構が介在する可能性が考えられた。マルバアサガオにおけるHeliplの離脱はもとのゲノム配列と全く同じように離脱するが、独立の復帰イベントに由来する複数のクローンについて、離脱部位の周囲の配列を調べたところ、多くの点塩基置換が導入されていた。これはHeliplが離脱した部位に起こる2重鎖切断を宿主が修復する際に行う誤りがちな修復に由来すると考えられた。今回Helipl自体が自律性かどうかの確証は得ることができなかったが、Hellplファミリーは唯一の転移可能なヘリトロンとして今後のトランスポゾン研究への利用が期待される。

ヘ リ ト ロ ン (Helitron) は recent の ゲ ノ ム research の に い, higher biological ゲ ノ ム の number パ ー セ ン ト を of め る ほ ど most existing す る こ と が Ming ら か に な っ た ト ラ ン ス ポ ゾ ン で あ る. し か し, こ れ ま で ヘ リ ト ロ ン の scions into sudden variations variants に つ い て は ト ウ モ ロ コ シ, etc, several え る ほ ど し か see つ か っ て お ら ず move planning activity の あ る も の は know ら れ て い な い. See my 々 が い だ し た マ ル バ ア サ ガ オ の FP heritage 伝 child (C function by MADS - box heritage 伝) に scions into し て い た Helipl は dilute に cells after 帰 - different を up こ す た め, こ の is を with い て ヘ リ ト ロ ン の self-discipline factor を と む structure, そ の planning move organization を Ming ら か に す る こ と を purpose と し を line っ て research て い Youdaoplaceholder0. マ ル バ ア サ ガ オ の コ ス ミ ド ベ ク タ ー ラ イ ブ ラ リ ー か ら have ら れ た ヘ リ ト ロ ン で between internal に コ ー ド さ れ て い る posthumous son 伝 の tectonic や salt base with column の violations い を parsing し た. そ の results, fp but 伝 に scions into し て い る Helipl は self-discipline factor の possibility が あ る こ と が shown さ れ た た め, ア グ ロ バ ク テ リ ウ ム を interface し た form quality planning in に よ っ て シ ロ イ ヌ ナ ズ ナ に import し, そ の planning move active を parsing し た. Import し た Helipl の struck side を carry む よ う な プ ラ イ マ ー を with い て, from し た parts の salt base with column を parsing し た と こ ろ, マ ル バ ア サ ガ オ で seen ら れ る よ う な, wild type の ゲ ノ ム match column に は complex 帰 し て お ら ず, several salt base の owe lost が see ら れ た. こ れ は independent の complex 帰 ク ロ ー ン に お い て に see common ら れ た た め, ら か の が interface in す る possibility が exam え ら れ た. マ ル バ ア サ ガ オ に お け る Helipl の is to take off the は も と の ゲ ノ ム match column と full く じ with よ う に off from す る が, independent の 帰 イ ベ ン ト に origin す る plural の ク ロ ー ン に つ い て の weeks, from parts 囲 の match column を adjustable べ た と こ ろ, multiple く の salt base displacement が import さ れ て い た. こ れ は Helipl が from し off back に た こ る 2 heavy lock cut を host が repair す る international line に う mistakenly り が ち な repair に origin す る と exam え ら れ た. Today back to Helipl autologous が self-discipline か ど う か の corroborate は must る こ と が で き な か っ た が, Hellpl フ ァ ミ リ ー は only の planning move may な ヘ リ ト ロ ン と し て in future の ト ラ ン ス ポ ゾ ン research へ の using が expect さ れ る.

项目成果

アサガオにおいて向背軸形成に関与し葉や花の形態を決定するDELICATE遺伝子の解析

DELICATE 基因的分析，该基因参与牵牛花的近轴形成并决定叶和花的形态

• 发表时间: 2007
• 作者: 黒木 理恵;仁田坂 英二
• 通讯作者: 仁田坂 英二

アサガオ

喇叭花

• 发表时间: 2006
• 期刊: 遺伝 60(5)
• 作者: Morita Y;Saitoh M;Hoshino A;Nitasaka E;Iida S;仁田坂英二
• 通讯作者: 仁田坂英二

トランスポゾンによって誘発されたアサガオの有用形質

转座子诱导的牵牛花的有用性状

• 发表时间: 2007
• 作者: 横山 講平;仁田坂 英二;仁田坂 英二
• 通讯作者: 仁田坂 英二

アサガオのTpnトランスポゾンにおける自律性因子とTpnA1との関係

牵牛花Tpn转座子自主因子与TpnA1的关系

• 发表时间: 2007
• 作者: 横山 講平;仁田坂 英二
• 通讯作者: 仁田坂 英二

変化アサガオにおける花・葉型の多様性

不同牵牛花的花和叶类型的多样性

• 发表时间: 2006
• 期刊: バイオサイエンスとインダストリー 68(8)
• 作者: Morita Y;Saitoh M;Hoshino A;Nitasaka E;Iida S;仁田坂英二;仁田坂英二
• 通讯作者: 仁田坂英二