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植物の高次生命現象における小胞輸送の機能解析

植物の高次生命現象における小胞輸送の機能解析
植物高等生命现象中囊泡运输的功能分析
批准号:
15031228
负责人:
上田 貴志
金额:
$3.58万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2004

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项目成果

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Rab GTPaseは,GTP型とGDP型の構造変換を通し,輸送小胞が標的膜へと輸送される際の分子スイッチとして機能している.一般的に,GTPを加水分解しGDP型となったRab GTPaseは,再びGTP型へと活性化され,次のGTPase cycleをまわることになるが,この際のヌクレオチド交換反応には,GDP/GTP交換因子(GEF)と呼ばれる分子が必要であることが知られている.そこで,シロイヌナズナにおけるRab5グループの機能を明らかにするため,まずRab5のGEFの機能解析を試みた.他の生物において,Rab5のGEFはVps9 domainと呼ばれる保存された構造を持つことが報告されている.シロイヌナズナゲノム中でVps9 domainを有するタンパク質を探索したところ,Vps9 domainを有するタンパク質をコードする二つの遺伝子が見いだされた.そのうち,発現が確認された一つの遺伝子(AtVps9a)をクローニングし,精製タンパク質を用いてAra7に対するGEF活性を測定したところ,非常に強いGEF活性が検出された.また,in vitroでのpull-down assayにより,AtVps9がAra6,Ara7,Rha1の全てと結合することも明らかとなった.このことから,シロイヌナズナのRab5関連タンパク質は,その構造上の特異性に反し,いずれの分子もが同一のGEFにより制御されていることが示唆された.これが事実であれば,AtVPS9遺伝子が破壊された植物においては,Rab5グループの全ての分子が不活化していると考えられ,この変異体を解析することにより,植物におけるRab5グループの機能をその総和として解析することが可能であると期待される.現在この変異体の解析を進めているが,予備的な解析において胚発生のかなり初期より細胞形態に異常が見られることから,この遺伝子産物が発生の初期から必須の働きを担っているものと予測される.今後の生化学的,遺伝学的解析を通して,AtVps9の機能をさらに明らかに出来るものと期待している.atvps9変異体の解析に加え,各rab5変異体の解析も順調に進行している.既にara6,rha1変異体については戻し交雑を終え,2重変異体の作出も完了している.
期刊论文(7)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
DOI: 10.1016/j.ejcb.2004.12.029
发表时间: 2005-07
期刊: European journal of cell biology
影响因子: 6.6
作者: [Boris Voigt;A. Timmers;J. Šamaj;A. Hlavacka;T. Ueda;M. Preuss;E. Nielsen;J. Mathur;N. Emans;H. Stenmark;A. Nakano;F. Baluška;D. Menzel]
通讯作者: Boris Voigt;A. Timmers;J. Šamaj;A. Hlavacka;T. Ueda;M. Preuss;E. Nielsen;J. Mathur;N. Emans;H. Stenmark;A. Nakano;F. Baluška;D. Menzel
DOI: 10.1111/j.1365-313x.2004.02249.x
发表时间: 2004-12-01
期刊: PLANT JOURNAL
影响因子: 7.2
作者: [Ueda, T, Uemura, T, Nakano, A]
通讯作者: Nakano, A
DOI: 10.1242/dev.01716
发表时间: 2005-04-01
期刊: DEVELOPMENT
影响因子: 4.6
作者: [Koizumi, K, Naramoto, S, Fukuda, H]
通讯作者: Fukuda, H
Grebe M. et al.: "Arabidopsis sterol endocytosis involves actin-mediated trafficking via ARA6-positive early endosomes"Curr.Biol.. 13. 1378-1387 (2003)
Grebe M. 等人:“拟南芥甾醇内吞作用涉及通过 ARA6 阳性早期内体进行肌动蛋白介导的运输”Curr.Biol.. 13. 1378-1387 (2003)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
6
    膜交通経路多様化機構の進化細胞生物学的研究
    • 批准号:
      24K02050
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.81万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      上田 貴志
    • 依托单位:
    液胞は植物膜交通経路のデッドエンドか ー液胞からのタンパク質回収機構の解明ー
    • 批准号:
      23KF0078
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for JSPS Fellows
    • 资助金额:
      $1.28万
    • 财政年份:
      2023
    • 负责人:
      上田 貴志
    • 依托单位:
    植物細胞に残る未知の膜交通経路 ~液胞からの逆行輸送機構の解明~
    • 批准号:
      21H02515
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
    • 资助金额:
      $11.15万
    • 财政年份:
      2021
    • 负责人:
      上田 貴志
    • 依托单位:
    可視化とオルガネラ機能解析から探る植物の機能発現メカニズム
    • 批准号:
      20061009
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
    • 资助金额:
      $1.66万
    • 财政年份:
      2008
    • 负责人:
      上田 貴志
    • 依托单位:
    国内基金
    海外基金
    CapZβ在早期内体成熟中的功能及分子机制研究
    • 批准号:
      32070702
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      58.0万元
    • 批准年份:
      2020
    • 负责人:
      岳剑波
    • 依托单位:
    活细胞高分辨率成像解析clathrin介导的内吞囊泡形成早期内体的分子机制
    Vici综合症蛋白EPG5协同调控内吞运输和自噬通路的机制研究
    NRT1.1磷酸化修饰调控植物侧根发育的分子细胞学机制研究
    • 批准号:
      31871424
    • 项目类别:
      面上项目
    • 资助金额:
      59.0万元
    • 批准年份:
      2018
    • 负责人:
      单晓昳
    • 依托单位: