タンパク質社会における糖鎖の機能解明を目指したNMR構造生物学

核磁共振结构生物学旨在阐明糖链在蛋白质社会中的功能

基本信息

  • 批准号:
    15032249
  • 负责人:
  • 金额:
    $ 2.62万
  • 依托单位:
  • 依托单位国家:
    日本
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 财政年份:
    2003
  • 资助国家:
    日本
  • 起止时间:
    2003 至 2004
  • 项目状态:
    已结题

项目摘要

1.糖鎖ライブラリーの構築糖タンパク質の高次構造解析を行うにあたっては、あらかじめそのグライコフォームを把握しておく必要がある。私たちは、500種類に及ぶN型糖鎖の多次元HPLCデータベースをもとにWEBアプリケーション"GALAXY"(http://www.glycoanalysis.info/)を構築している。これを用いることにより、異性体の識別を含めた糖鎖構造の同定および分子・組織・細胞レベルでの糖鎖プロファイリングを簡便に行うことが可能としている。また、多次元HPLC法を利用して構築された糖鎖ライブラリーは、糖鎖の構造・機能解析を系統的に行うための強力なツールとなる。例えば、高マンノース型糖鎖のライブラリーを利用したフロンタルアフィニティークロマトグラフィー解析によってカーゴレセプターVIP36の糖鎖認識の特異性を明らかにした。2.細胞内レクチンのNMR構造生物学NMRを利用して糖タンパク質の細胞内運命を決定する種々の細胞内レクチン(分子シャペロン、カーゴレセプター、ユビキチンリガーゼ)の分子認識様式を明らかにした。3.分子シャペロンのNMR構造生物学研究NMRを利用して様々なシャペロンの高次構造・ダイナミクス・分子間相互作用を解析した。例えば、プロテインジスルフィドイソメラーゼについては、これまで報告されていないb'ドメインおよびa'ドメインの三次元構造をNMRを利用して決定するとともに、基質認識部位の同定と酸化還元に伴うドメイン間相互作用の変化を捉えることに成功した。また、選択的な安定同位体標識を利用して古細菌のプレフォルディンとシャペロニンとの相互作用を解析した。
1. The analysis of high-order structure of sugar chain and its construction is necessary. A multiplex HPLC system for the determination of 500-type and N-type glycans was constructed using the website "GALAXY"(http://www.glycoanalysis.info/). The identification of heteromorphic species includes the identification of glycophagous structures, molecular tissues, and cellular structures. The method of HPLC with multiple elements is used to construct and analyze the sugar chain. For example, the specificity of sugar lock understanding in the analysis of the high-sugar-lock type sugar lock is clearly demonstrated by the use of the high-sugar-lock type sugar lock. 2. Molecular recognition of intracellular proteins (molecules, molecules, 3. Molecular structural biology studies by NMR. Analysis of molecular interactions by NMR. For example, NMR was used to determine the isostatic acidification of matrix recognition sites and the interaction between them. Analysis of interaction between archaea and stable isotope markers

项目成果

期刊论文数量(16)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
N.Takahashi, K.Kato: "GALAXY (Glycoanalysis by the three axes of MS and chromatography) : a Web application that assists structural analyses of N-glycans"Trends Glycosci.Glycotech.. 15. 235-251 (2003)
N.Takahashi、K.Kato:“GALAXY(通过 MS 和色谱三轴进行糖分析):辅助 N-聚糖结构分析的 Web 应用程序”Trends Glycosci.Glycotech.. 15. 235-251 (2003)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
ユビキチンリガーゼの機能発現の構造的基盤
泛素连接酶功能表达的结构基础
  • DOI:
  • 发表时间:
    2004
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Yoshihiko Tashima;et al.;K.Kato et al.;坂田絵理ら
  • 通讯作者:
    坂田絵理ら
Recombinant curculin heterodimer, exhibits taste-modifying and sweet-tasting activities
  • DOI:
    10.1016/j.febslet.2004.07.073
  • 发表时间:
    2004-08-27
  • 期刊:
  • 影响因子:
    3.5
  • 作者:
    Suzuki, M;Kurimoto, E;Kato, K
  • 通讯作者:
    Kato, K
山口芳樹, 加藤晃一: "レクチンによる糖鎖認識の構造生物学"生化学. (印刷中). (2004)
Yoshiki Yamaguchi、Koichi Kato:“凝集素识别聚糖的结构生物学”生物化学(出版中)。
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
高橋禮子ら: "多次元HPLC法のグライコミクス解析への展開"蛋白質 核酸 酵素. 48. 1412-1418 (2003)
Reiko Takahashi 等人:“糖组分析多维 HPLC 方法的开发”蛋白质核酸酶 48. 1412-1418 (2003)
  • DOI:
  • 发表时间:
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
  • 通讯作者:
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加藤 晃一其他文献

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  • DOI:
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    北島 健;佐藤 ちひろ;門松 健治;加藤 晃一;中野 博文ほか29名
  • 通讯作者:
    中野 博文ほか29名
プロテアソームアッセンブリーシャペロンの古細菌ホモログPbaAの高次構造多型
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2017
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    矢木-内海 真穂;Arunima Sikdar;佐藤 匡史;加藤 晃一
  • 通讯作者:
    加藤 晃一
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2013
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    小川 光貴;河合 崇生;堺谷 祐太;矢木 宏和;加藤 晃一;古川 鋼一;岡島 徹也
  • 通讯作者:
    岡島 徹也
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  • DOI:
  • 发表时间:
    2016
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    堀場 早紀;加子 夏未;宮崎 剛亜;加藤 竜也;近藤 幸子;加藤 晃一;矢木 宏和;朴 龍洙;山崎友裕
  • 通讯作者:
    山崎友裕
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  • 发表时间:
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  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    黒地孝;河本忠幸;Takashi Kurochi;Tadayuki Koumoto;黒地 孝;河本 忠幸;加藤晃一;Junichi Hino;Koichi Kato;加藤 晃一;日野順市
  • 通讯作者:
    日野順市

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    $ 2.62万
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