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糖タンパク質の構造グライコミクスを展開するためのデータベースの拡張と応用

糖タンパク質の構造グライコミクスを展開するためのデータベースの拡張と応用
糖蛋白结构糖组学开发的数据库扩展和应用
批准号:
16014221
负责人:
加藤 晃一
金额:
$1.47万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份:
2004
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2004 至 --

项目摘要

项目成果

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(1)糖鎖データの拡張これまでの糖鎖構造データベースは、硫酸化糖鎖に関する情報を含んでいなかった。これは、硫酸化糖鎖が天然には微量にしか存在しないために、構造解析が困難であったことによる。そこで、硫酸基転移酵素の遺伝子を導入した動物細胞株を用いて硫酸化糖鎖の大量発現を行い、多次元HPLC法と質量分析法により、それらの構造解析を行った。これによって硫酸化糖鎖の構造データベースを構築することが可能となった。(2)GALAXYを利用した糖鎖プロファイリングGALAXYに搭載している糖鎖構造データベースを利用して、様々な自己免疫疾患における免疫グロブリンの糖鎖プロファイルデータの収集、種々の宿主において発現したインフルエンザウイルスや寄生虫表面の糖鎖プロファイリングを行った。(3)NMRによる糖鎖とレクチンの相互作用解析糖タンパク質の細胞内運命(フォールディング、輸送、分解)を決定する様々なレクチンによる糖鎖認識メカニズムをNMRを用いて研究した。特に、安定同位体標識を施した糖ペプチドをリガンドとして用いることにより、ユビキチンリガーゼSCF^<Fbs1>の標的糖タンパク質の認識メカニズムを原子レベルで明らかにすることに成功した。(4)安定同位体標識糖鎖を利用した質量分析糖鎖は独特な分岐構造を有するなどの理由により数多くの異性体が存在するため、質量分析を利用した構造解析が困難である。最近、MS/MSにおけるフラグメンテーションの様式の違いを利用して糖鎖の異性体を識別しようという試みが行われてきている。そのためには、フラグメンテーションパターンに差異が生じる所以を探求することが重要である。我々は、特定の分岐の非還元末端を安定同位体で標識した種々の糖鎖アイソトポマーを用いて、分岐構造の開裂様式を解析した。この方法を用いることによって分岐構造を有する糖鎖のグルコシド結合における開裂のしやすさの違いなどを系統的に解析することが可能となった。
期刊论文(12)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Temperature-dependent isologous Fab-Fab interaction that mediates cryocrystallization of a monoclonal immunoglobulin G
介导单克隆免疫球蛋白 G 冷冻结晶的温度依赖性同源 Fab-Fab 相互作用
DOI: --
发表时间: 2004
期刊: Mol.Immunol. 41
影响因子: --
作者: [Yoshihiko Tashima, et al., K.Kato et al., 坂田絵理ら, H.Yagi et al.]
通讯作者: H.Yagi et al.
ユビキチンリガーゼの機能発現の構造的基盤
泛素连接酶功能表达的结构基础
DOI: --
发表时间: 2004
期刊: 細胞工学 23
影响因子: --
作者: [Yoshihiko Tashima, et al., K.Kato et al., 坂田絵理ら]
通讯作者: 坂田絵理ら
DOI: 10.1016/j.febslet.2004.07.073
发表时间: 2004-08-27
期刊: FEBS LETTERS
影响因子: 3.5
作者: [Suzuki, M, Kurimoto, E, Kato, K]
通讯作者: Kato, K
Discrimination of isomeric fragment ions observed in tandem mass spectra of biantennary oligosaccharides by use of selective isotope labeling
利用选择性同位素标记区分双触角寡糖串联质谱中观察到的异构片段离子
DOI: --
发表时间: 2004
期刊: J.Mass Spectrom.Soc.Japan 52
影响因子: --
作者: [Yoshihiko Tashima, et al., K.Kato et al.]
通讯作者: K.Kato et al.
6
    糖タンパク質の動的3次元構造の設計原理の解明とバイオ医薬への応用
    • 批准号:
      24H00599
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
    • 资助金额:
      $30.87万
    • 财政年份:
      2024
    • 负责人:
      加藤 晃一
    • 依托单位:
    機関リポジトリのデモサイトによる利用教育の検証
    • 批准号:
      22907037
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Encouragement of Scientists
    • 资助金额:
      $0.36万
    • 财政年份:
      2010
    • 负责人:
      加藤 晃一
    • 依托单位:
    構造生物学的アプローチによる小胞体関連分解装置の分子認識と作動機構の解明
    味覚修飾タンパク質クルクリンの機能発現メカニズムの解明とその応用
    • 批准号:
      17651126
    • 项目类别:
      Grant-in-Aid for Exploratory Research
    • 资助金额:
      $1.98万
    • 财政年份:
      2005
    • 负责人:
      加藤 晃一
    • 依托单位:
    海外基金