Sequenzierung des Dictyostelium Genoms

盘基网柄菌(Dictyostelialdiscoideum)、自由基盘基盘基菌(Dictyostoma Discoideum)、自由基盘基菌(Eine freilebende Amöbe)、组织模板菌(modellOrganmus für Zell-und)和维氏盘基菌(Dictyostelium Discoideum)。Das基因组为34 Mb。Zur Zeit将死于Verschiedene Organisationen Egfördert，并将死于Einem International alen Konsortium zusammengeschlossen sind。书名：The Sequenzierung and Annotation von fünf der Sechs Chromosomen ermöglicht.染色体1(5，5 Mb)和2(约8 Mb)持续das DFG-Programm“Sequenzierung Kleiner Genome”gefördert Worden，die Chromosomen 4，5 and 6 wden dch die EU，das NIH(USA)and MRC(UK)egfördert。染色体3为Bisher keinem Projekt zugeordnet。ALS Vorgehensweise wurein全染色体鸟枪法(WCS)Gewählt.Das DFG-Egförderte Projekt Hat SchrittmacherFuncktion and Chromosom 2，das MIT 8Mb Gröüte Chromosom，ist das Erste Fertiggestellte and Publizierte DictyostelialChromosom(Glöockner等人，《自然》，出版中)。ZIel Dieses Vorhabens ist，染色体3(约6Mb)fertigzustellen and zusamman MIT DEM Konsortium einen Genkatalog zu erstellen and die analytation des gesamten Genome abzuschlieüen.这是因为基因组是组织的，它的系统发育是从后向后的，而不是从后向后发生的。Diese Daten ermöglichen gesamtgenomische Vergleiche zwitchen Poplogentisch verschieden einzuordnenden Gruppen and bilden die Vorossetzung für genomweite ansätze der Funktionellen Genomellen Genom-and Proteomanalys von Dictyostelial.

Dictyostelium discoideum, eine freilebende Amöbe, ist ein Modellorganismus für zell- und entwicklungsbiologische Fragestellungen. Das Genom ist auf sechs Chromosomen verteilt und hat eine Größe von 34 Mb. Zur Zeit wird die Sequenzierung einzelner Chromosomen durch verschiedene Organisationen gefördert, die in einem internationalen Konsortium zusammengeschlossen sind. Dadurch wird die Sequenzierung und Annotation von fünf der sechs Chromosomen ermöglicht. Chromosom 1 (5,5 Mb) und 2 (ca. 8 Mb) sind durch das DFG-Programm "Sequenzierung kleiner Genome" gefördert worden, die Chromosomen 4,5 und 6 werden durch die EU, das NIH (USA) und MRC (UK) gefördert. Chromosom 3 ist bisher keinem Projekt zugeordnet. Als Vorgehensweise wurde ein whole chromosom shotgun Ansatz (WCS) gewählt. Das DFG-geförderte Projekt hat Schrittmacherfunktion und Chromosom 2, das mit 8 Mb größte Chromosom, ist das erste fertiggestellte und publizierte Dictyostelium Chromosom (Glöckner et al., Nature, in press). Ziel dieses Vorhabens ist, Chromosom 3 (ca. 6 Mb) fertigzustellen und zusammen mit dem Konsortium einen Genkatalog zu erstellen und die Analyse und Annotation des gesamten Genoms abzuschließen. Damit ist das Genom eines Organismus entschlüsselt, der phylogenetisch vor der Abzweigung der Metazoen und Pilze aber nach der Abzweigung der Pflanzen steht. Diese Daten ermöglichen gesamtgenomische Vergleiche zwischen phylogenetisch verschieden einzuordnenden Gruppen und bilden die Voraussetzung für genomweite Ansätze der funktionellen Genom- und Proteomanalyse von Dictyostelium.