Sequenzierung des Dictyostelium Genoms

Dictyosteobacterdiscoideum，eine freilebende Amöbe，ist ein Modellorganismus für策尔- und entwicklungsbiologische Fragestellungen.基因组是一个由34 Mb组成的染色体组。在一个国际性的会议上，我们将通过一个新的组织对一个染色体进行测序。我们将对染色体片段进行测序和注释。染色体1（5，5 Mb）和2（约8 Mb）是通过DFG-100“小基因组测序”完成的，4、5和6号染色体是通过欧盟、NIH（美国）和MRC（英国）完成的。3号染色体不是一个好项目。所有的前武器都是一个完整的染色体霰弹枪（WCS）。Das DFG-geförderte Projekt hat Schrittmacherfunktion und Chromosom 2，das mit 8 Mb größte Chromosom，ist das erste fertigestellte und dictyosteoblastoma Chromosom（Glöckner et al.，Nature，in press）. Ziel dieses Vorhabens ist，Chromosom 3（ca. 6 Mb）通过对已知基因组的分析和注释，对已知基因组进行测序和注释。Damit is das Genom eines Organismus entschlüsselt，der phylogenetisch vor der Abzweigung der Metazoen and Pilze aber nach der Abzweigung der Pflanzen steht.该数据收集的基因组学数据可用于对Dictyosteoblasts的功能基因组和蛋白质组分析的Voraussetzung für genomweite Ansätze。

Dictyostelium discoideum, eine freilebende Amöbe, ist ein Modellorganismus für zell- und entwicklungsbiologische Fragestellungen. Das Genom ist auf sechs Chromosomen verteilt und hat eine Größe von 34 Mb. Zur Zeit wird die Sequenzierung einzelner Chromosomen durch verschiedene Organisationen gefördert, die in einem internationalen Konsortium zusammengeschlossen sind. Dadurch wird die Sequenzierung und Annotation von fünf der sechs Chromosomen ermöglicht. Chromosom 1 (5,5 Mb) und 2 (ca. 8 Mb) sind durch das DFG-Programm "Sequenzierung kleiner Genome" gefördert worden, die Chromosomen 4,5 und 6 werden durch die EU, das NIH (USA) und MRC (UK) gefördert. Chromosom 3 ist bisher keinem Projekt zugeordnet. Als Vorgehensweise wurde ein whole chromosom shotgun Ansatz (WCS) gewählt. Das DFG-geförderte Projekt hat Schrittmacherfunktion und Chromosom 2, das mit 8 Mb größte Chromosom, ist das erste fertiggestellte und publizierte Dictyostelium Chromosom (Glöckner et al., Nature, in press). Ziel dieses Vorhabens ist, Chromosom 3 (ca. 6 Mb) fertigzustellen und zusammen mit dem Konsortium einen Genkatalog zu erstellen und die Analyse und Annotation des gesamten Genoms abzuschließen. Damit ist das Genom eines Organismus entschlüsselt, der phylogenetisch vor der Abzweigung der Metazoen und Pilze aber nach der Abzweigung der Pflanzen steht. Diese Daten ermöglichen gesamtgenomische Vergleiche zwischen phylogenetisch verschieden einzuordnenden Gruppen und bilden die Voraussetzung für genomweite Ansätze der funktionellen Genom- und Proteomanalyse von Dictyostelium.