Molecular studies of mammalian evolution around Wallacea

华莱士周围哺乳动物进化的分子研究

• 批准号: 21KK0130
• 负责人: 今井 啓雄
• 金额: $ 12.31万
• 依托单位: Kyoto University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Fund for the Promotion of Joint International Research (Fostering Joint International Research (B))
• 财政年份: 2021
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2021-10-07 至 2025-03-31
• 项目状态: 未结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-21KK0130/
• 关键词: 味覚; 毛色

今井と寺井、糸井川は、研究員のYanと共に2022年10月にインドネシアを訪問し、ボゴール農科大学でRNA抽出とライブラリ作成の系の構築を行った。特に糸井川とYanは、ボゴール農大にてRNA抽出システムの構築並びに抽出方法の最適化を実施した。スラウェシ島南東部にてM. ochreataとM. brunnescensのサンプリングを行った。また、糸井川は公共データベースに登録されている全ゲノムアセンブリから有袋類MC1R配列を取得し、PCR増幅用のプライマーを設計した。また同手法と設計したプライマー配列をインドネシア側の研究者・学生に共有した。辻は2023年2-3月にインドネシアを訪問し、１）ボゴール農科大学との共同研究、２）西ジャワ州パガンダラン自然保護区でのジャワルトン、カニクイザルの調査並びに研究連絡、３）西ジャワ州テラガワルナ自然保護区でのカニクイザルの調査と研究連絡を行った。これらの海外での活動をもとに、帰国後は合成DNAライブラリについてexon capturingを行い、exon領域だけを抽出した。すべてのライブラリの配列を均等に決定できるように混合し、Illumina社のHiseqXシークエンサーにより配列を合計120 Gb決定した。決定した配列をアカゲザルの参照ゲノム配列にマッピングし、スラウェシマカクのexon由来の配列の比率を算出した。その結果マカク由来の配列は70-90%とexon由来の配列が濃縮されていることが確認された。実際の配列の総量は、個体ごとに7 -13 Gb であり、カバレージ(exon配列を何回決定したかの指標)を求めると40-60xとなり、解析に十分な量の配列が決定されていることが確認できた。

Imai Terai, Itogawa, Yan, a researcher, visited the University of Agricultural Sciences in October 2022 to construct a system for RNA extraction and extraction. In particular, the construction of RNA extraction systems and the optimization of extraction methods were carried out. South and East of the island. ochreataとM. Brunnescens's All of the above are required to be registered in the public domain. For example, the MC1R is configured to be registered in the public domain. The same method and design are shared by researchers and students at the University of Illinois. February-March, 2023:1) Joint research of agricultural university; 2) Investigation and research contact of western state nature reserve; 3) Investigation and research contact of western state nature reserve This is the first time that we've ever had a chance to do this. In addition, the total number of pixels in the array is 120 Gb, which is determined by the HiseqX of Illumina. Determine the allocation ratio of the reference group. The result is that the original arrangement is 70-90% and the original arrangement is concentrated. The total amount of the actual arrangement is 7 - 13 Gb, the individual is 7 - 13 Gb, the individual is 7 - 13 Gb, and the individual is 7 - 13 Gb.

项目成果

Case report of infantcide by a wild long-tailed macaque (Macaca fascicularis)

野生长尾猕猴杀婴事件报告

• 发表时间: 2021
• 期刊: Philippine J. Sci. 151
• 作者: Widayati K.A.;Noerwana O.;Fauzi R.M.;Tsuji Y.
• 通讯作者: Tsuji Y.

Effects of food availability and its seasonal changes on the dietary habits of wild silvery lutungs (Trachypithecus cristatus) in a coastal forest in west Sumatra, Indonesia

印度尼西亚苏门答腊岛西部沿海森林中食物供应及其季节变化对野生银鸫（Trachypithecus cristatus）饮食习惯的影响

• DOI: 10.1163/14219980-20210703
• 发表时间: 2022
• 期刊: Folia Primatologica
• 影响因子: 1.9
• 作者: Akbar Muhammad Azhari;Rizaldi;Perwitasari-Farajallah Dyah;Tsuji Yamato
• 通讯作者: Tsuji Yamato

Seasonal changes in dietary compositions of the Malayan flying lemur (Galeopterus variegatus) with reference to food availability

马来亚飞狐猴（Galeopterus variegatus）膳食成分随食物供应量的季节性变化

• DOI: 10.1007/s13364-022-00658-y
• 发表时间: 2022
• 期刊: Mammal Research
• 影响因子: 1.5
• 作者: Takatsuki Seiki;Tsuji Yamato;Prayitno Bambang;Widayati Kanthi Arum;Suryobroto Bambang
• 通讯作者: Suryobroto Bambang

Evolution of the primate glutamate taste sensor from a nucleotide sensor

• DOI: 10.1016/j.cub.2021.08.002
• 发表时间: 2021-08
• 期刊: Current Biology
• 影响因子: 9.2
• 作者: Yasuka Toda;T. Hayakawa;Akihiro Itoigawa;Yosuke Kurihara;Tomoya Nakagita;Masahiro Hayashi;R. Ashino-

卵生哺乳類における苦味受容体の機能多様性と進化.

卵生哺乳动物苦味受体的功能多样性和进化。

• 发表时间: 2022
• 作者: 糸井川壮大;早川卓志;Zhou Y;Manning AD;Zhang G;Grutzner F;今井啓雄.
• 通讯作者: 今井啓雄.