Elucidation of the process of aggregation by creating an in vitro enzymatic reaction scaffold
Elucidation of the process of aggregation by creating an in vitro enzymatic reaction scaffold
批准号:
22KJ3015
负责人:
廣瀬 光了 (2022-2023)
金额:
$1.41万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2023
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2023-03-08 至 2024-03-31
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英文摘要
本研究の第一目的としていた「クロロフィル生合成過程に関わる酵素の反応機構の解明」については、既に達成することができた。生体外の酵素反応だけではなく、計算科学の分野も組み合わせることで、標的酵素の反応機構(アミノ酸残基を含めた)を分子レベルで解明することができた。これらの研究成果を取りまとめ、国内の学会で2件の発表を行うことができた。さらに、その研究内容を取りまとめた論文が査読付き国際学術誌に掲載された。本研究の第二目的としていた「酵素の制御機構(生合成酵素の基質特異性から推測する反応機構や2種類以上の酵素同士の関係性)を含む生理学の解明」に努めた結果、クロロフィル色素の生合成経路に関わる酵素の反応機構を分子レベルで推定でき、国内外の学会で2件の発表を行えただけでなく、その内容の論文が査読付き国際学術誌に掲載された。また、本研究で培った技術や知識に基づいて、様々な方向性へ研究展開を行った。その結果、新規のクロロフィル(誘導体)の合成と同定を達成することができた。さらに、多数の(非)天然クロロフィル色素の微量分析を行い、分析による同定プロファイルを作成することもできた。加えて、クロロフィル代謝過程で働く重要な酵素についても新たな知見を得ることができた。以上のそれぞれの研究内容について、共著者として国内の学会発表4件に貢献できた。また、それらの研究内容を取りまとめた論文が2報、査読付き国際学術誌に掲載された。
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Predicted Structure of the BciC Enzyme Catalyzing the Removal of the C132-Methoxycarbonyl Group for Biosynthesis of Chlorosomal Chlorophylls: A Mechanism for Dual Catalytic Functions of Hydrolysis and Decarboxylation inside Its Active Site
催化去除 C132-甲氧基羰基以进行叶绿素生物合成的 BciC 酶的预测结构:其活性位点内水解和脱羧双重催化功能的机制
DOI:
10.1021/acs.biochem.2c00715
发表时间:
2023
期刊:
Biochemistry
影响因子:
2.9
作者:
[Hirose Mitsuaki, Harada Jiro, Kashiyama Yuichiro, Tamiaki Hitoshi]
通讯作者:
Tamiaki Hitoshi
3位または8位置換クロロフィル誘導体を用いた生体外でのSGR酵素反応とその基質特異性
使用3-或8-取代叶绿素衍生物的体外SGR酶反应及其底物特异性
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[佐藤颯真, 廣瀨光了, 田中亮一, 伊藤寿, 民秋均]
通讯作者:
民秋均
緑色硫黄細菌の色素合成経路ではたらくC132位メトキシカルボニル基脱離酵素BciCのAlphaFold2解析による構造解析と生化学的解析からの反応機構の検証
使用AlphaFold2分析绿硫细菌色素合成途径中作用的C132甲氧羰基消除酶BciC的结构,并从生化分析验证反应机制
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[廣瀨光了, 原田二朗, 柏山祐一郎, 民秋均]
通讯作者:
民秋均
Physico- and biochemical properties of synthetic zinc 131-(un)substituted chlorophyll-a derivatives
合成锌 131-(未)取代叶绿素-a 衍生物的物理和生化特性
DOI:
--
发表时间:
2021
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Mitsuaki Hirose, Jiro Harada, Hiroaki Maeda, Hitoshi Tamiaki]
通讯作者:
Hitoshi Tamiaki
3位のビニル基の水和を触媒するBchFとBchVによる亜鉛バクテリオクロロフィリドdとそのホモログ体の脱水反応とその応用
BchF和BchV催化3位乙烯基水合对细菌绿植酸锌d及其同系物进行脱水反应及其应用
DOI:
--
发表时间:
2023
期刊:
影响因子:
--
作者:
[廣瀨 光了, 塚谷 祐介, 原田 二朗, 民秋 均]
通讯作者:
民秋 均
共 20 条
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