全ゲノム情報を活用したサンゴ細菌性白化の予防診断技術と治療薬開発

利用全基因组信息进行珊瑚细菌白化的预防诊断技术和治疗药物开发

• 批准号: 17J05024
• 负责人: 高木 俊幸
• 金额: $ 7.49万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2017
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2017-04-26 至 2020-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-17J05024/
• 关键词: サンゴ; 自然免疫機構; 細菌性白化; ビブリオ; トランスクリプトーム解析

近年の研究から、水温上昇によりサンゴ免疫力が低下することや、病原細菌の毒性が強くなることで、サンゴの病気や白化が急増しているという観察例が多く報告されている。本研究では、その中でもビブリオ類が引き起こす細菌性白化に注目して、次世代シーケンサーを用いてサンゴのビブリオ感染時の遺伝子発現応答を網羅的に解析した。サンゴ細菌性白化を引き起こす病原細菌Vibrio coralliilyticus感染時特異的に発現上昇するサンゴ遺伝子群を同定するために、コユビミドリイシサンゴAcropora digitifera初期ポリプのトランスクリプトーム解析を行なった。V. coralliilyticus感染と未感染状態のサンゴの全RNA抽出・ライブラリ調製後、Hiseq4000システムでRNA-seqを行なった。クオリティの低いシーケンスデータを除去し、A. digitiferaゲノム配列へマッピングを行なった結果、平均マッピング率は約61%であった。さらに、featureCountによりマッピングされたリードのカウントを行い、約17000遺伝子の発現を確認した。V. coralliilyticus感染60分後と未感染状態の遺伝子発現量を比較解析することで、V. coralliilyticus感染時に発現変動する3667遺伝子の特定した。これらの遺伝子をタンパク質のアミノ酸配列データベースであるSwiss-Protと相同性検索した結果、2443遺伝子の機能が予測された。病原体を感知して自然免疫を作動させるToll様受容体や抗菌ペプチド様配列の発現上昇を確認し、それらの結果をもとにサンゴのV. coralliilyticusに対する免疫機構を予測した。

In recent years, we have studied the disease, the temperature of the water, the low immunity, the virulence of the pathogenic bacteria, the virulence of the pathogens, the acute albinism of the disease, the acute albinism, and the number of cases reported. In this study, we have introduced the bacterial albinism model in this study, and the next-generation virus will be used to detect the response network when it is infected by the virus infection virus. Bacterial albinism induces specific infection of pathogenic bacteria Vibrio coralliilyticus. Now, the subgroup of bacterial albinism is the same as that of other pathogens. In the early stage of Acropora digitifera, we need to determine the same number of bacteria. In the beginning of the test, we need to analyze the results. V. After coralliilyticus was infected with uninfected status, the whole RNA was pulled out of the virus, and the Hiseq4000 infection caused RNA-seq infection. The results show that the average error rate is about 61%. The results show that the average error rate is about 61%. The results show that the average error rate is about 61%. The results show that the average error rate is about 61%. The results show that the average error rate is about 61%. Please contact me, featureCount. I need to know that I am sorry. Please confirm that I am sorry. After 60 minutes of coralliilyticus infection, the number of children with uninfected status was analyzed, and 3667 children with specific infection were detected when infected with V. coralliilyticus. This is not true because of the number of errors. The results of Swiss-Prot tests are identical, and 2443 of the data can be used to determine the accuracy of the data. Pathogen-sensitive natural immune response, Toll recipient antimicrobial activity is now confirmed, and the results show that the immune system has been successfully tested by the immune mechanism of V. coralliilyticus vaccine.

项目成果

抗活性酸素剤によるサンゴ幼生の生存率の向上の実現

使用抗活性氧剂提高珊瑚幼虫的存活率

• 发表时间: 2017
• 作者: 元根啓佑，高木俊幸，油屋駿介，青木航，三浦夏子，竹山春子;長崎幸夫，新里宙也，植田充美
• 通讯作者: 長崎幸夫，新里宙也，植田充美

サンゴ共生褐虫藻の単離・培養条件の検討

珊瑚共生虫黄藻的分离培养条件研究

• 发表时间: 2018
• 作者: 元根啓佑;三浦夏子;高木俊幸;青木航;植田充美
• 通讯作者: 植田充美

サンゴから単離した共在微生物による病原菌の生育抑制機能評価

使用从珊瑚分离的共存微生物评估病原体生长抑制功能

• 发表时间: 2018
• 作者: 三浦夏子;元根啓佑;高木俊幸;植田充美
• 通讯作者: 植田充美

サンゴ共生体の保護を目指した取り組み ―抗活性酸素剤による高温ストレス下でのサンゴ幼生の生存率の向上―

旨在保护珊瑚共生体的努力 - 使用抗活性氧剂提高高温胁迫下珊瑚幼虫的存活率 -

• 发表时间: 2017
• 作者: 元根 啓佑;高木 俊幸;油屋 駿介;新里 宙也;長崎 幸夫;竹山 春子;青木 航;植田 充美
• 通讯作者: 植田 充美

Proposal toward coral reef protection from global warming: increased survival rate of redox nanoparticle-treated coral larvae under heat stress

保护珊瑚礁免受全球变暖影响的提案：氧化还原纳米粒子处理的珊瑚幼虫在热应激下的存活率提高

• 发表时间: 2017
• 作者: Keisuke Motone;Toshiyuki Takagi;Shunsuke Aburaya;Chuya Shinzato;Yukio Nagasaki;Haruko Takeyama;Wataru Aoki;Mitsuyoshi Ueda
• 通讯作者: Mitsuyoshi Ueda