免疫逃避型変異を有するSARS-CoV-2のウイルス学的特徴の解明

阐明带有免疫逃逸突变的 SARS-CoV-2 病毒学特征

• 批准号: 22KJ3221
• 负责人: 山本 真也
• 金额: $ 0.58万
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2023
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2023-03-08 至 2024-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-22KJ3221/
• 关键词: SARS-CoV-2; COVID-19; 中和抗体; アミノ酸変異

世界的流行を起こした新型コロナウイルス感染症　(Coronavirus disease 2019 : COVID-19 )は、Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) によって引き起こされる呼吸器感染症である。SARS-CoV-2は感染・増殖を繰り返す中で、ウイルスゲノムに塩基変異を蓄積しながら流行を続けている。スパイクタンパク質、特にS1領域は感染やワクチンによって誘導される中和抗体の主要な標的部位であり、スパイクタンパク質に導入されたアミノ酸変異の一部が抗原性変化に寄与することが知られている。しかしながらウイルスの抗原性変化に寄与するアミノ変異の出現機序については未解明の部分が多く、これら抗原性変化に寄与するアミノ酸変異の同定・解明が今後のワクチン開発において重要な知見となる。東京大学医科学研究所の研究用微生物安全委員会で、研究内容の審議・承認を受け研究を実施した。臨床分離株をSARS-CoV-2感染後もしくはワクチン接種後血漿の存在下で継代を繰り返すことで、抗原性変化を有する株の取得を試みた。30～50回の継代の結果、スパイクタンパク質に多様なアミノ酸変異を有する株を多数獲得したが、オミクロン株の様に多数の塩基変異を蓄積した株は確認されなかった。抗原性変化に関与するアミノ酸変異は、S1領域のN-terminal domain （NTD）領域やReceptor binding domain (RBD) 領域のみでなく、S2領域においても起こることを明らかにした。また、今回獲得した抗原性変異株の感染・ワクチン接種後血漿の中和活性からのエスケープの程度は検体間で異なり、ヒトにより抗体認識する主なエピトープが異なることが示唆された。

2019年冠状病毒病：引起全球大流行的Covid-19是由严重的急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-COV-2）引起的呼吸道感染。随着SARS-COV-2继续扩散，随着它继续扩散，它会积累病毒基因组中的碱基突变。尖峰蛋白，尤其是S1区域，是由感染或疫苗诱导的中和抗体的主要靶位部位，众所周知，引入峰值蛋白引入的一些氨基酸突变有助于抗原性变化。然而，关于氨基突变的出现机制有许多未知数，导致病毒的抗原变化，以及导致抗原变化的氨基酸突变的鉴定和阐明对未来的疫苗发展至关重要。这项研究是在东京大学医学科学研究所的研究微生物安全委员会审议并批准研究内容后进行的。我们试图通过在SARS-COV-2感染后重复通过临床分离株或疫苗接种后血浆中的血浆来获得抗原变化的菌株。经过30-50段后，获取了许多具有多种氨基酸突变的菌株，但没有证实积累大量碱基突变（例如Omicron菌株）的菌株。我们发现，参与抗原变化的氨基酸突变不仅发生在S1区域的N末端结构域（NTD）和受体结合结构域（RBD）区域，而且还存在于S2区域。此外，从感染和疫苗接种后血浆中和血浆中和血浆活性的抗原突变体中和抗原突变体的中和活性的程度有所不同，这表明人类在识别抗体的主要表位中有所不同。