プルキンエ細胞の分割されたトランスラトームのデジタル表現プロファイリング

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私たちはプルキンエ細胞内に存在するRNAを研究した。当該細胞は脳内の小脳と 呼ばれる部位に見られる神経細胞で、その役割の１つは体の動き を制御するこ とである。そのため、また、プルキンエ細胞は大型の細胞で発見しやすいことか ら、脳の可塑性を解明するための数々の研究の対象と なってきた。プルキンエ 細胞のシナプス内にリボソームが存在することが報告されたことを受け、当プロ ジェクトでは、これらのリボソームに関連 するRNAの特徴付けと定量化を目指し た。これらのリボソームがシナプス可塑性を制御するタンパク質の生成あるいは 翻訳自体に関連している可 能性があるためである。私たちは理化学研究所脳科学総合研究センターLauney研究ユニットとの共同研究 により、リボソーム・キャプチャーと呼ばれる方法を用いて プルキンエ細胞内 のリボソームを選択的に標識化し、これらのリボソームと結合したRNAを収集し た。そして、収集したRNAを理化学研究所ラ イフサイエンス技術基盤研究セン ターが開発したCAGEscan法を用いて解析し、RNAの転写開始点を同定、その量を 計測し、構造の特性を 明らかにした。この方法により私たちはプルキンエ細胞 のための新たなRNAマーカーを発見し、当該リボソームと同時精製されたことか ら翻訳の 制御にかかわっている可能性のあるノンコーディングRNAを同定。この 研究結果は『Genome Research』誌に発表した（Kratz et al. , 2014）。