プルキンエ細胞の分割されたトランスラトームのデジタル表現プロファイリング

浦肯野细胞分段翻译组的数字表达谱

• 批准号: 13F03704
• 负责人: PLESSY Charles
• 金额: $ 1.47万
• 依托单位: The Institute of Physical and Chemical Research
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for JSPS Fellows
• 财政年份: 2013
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2013-04-01 至 2015-03-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13F03704/
• 关键词: CAGE; プルキンエ細胞; CAGEscan; リボソーム・キャプチャー; トランスクリプトーム; トランストラトーム; ncRNA; library preparation; sequencing; immunofluorescence; mass-spectrometry; sample preparation

私たちはプルキンエ細胞内に存在するRNAを研究した。当該細胞は脳内の小脳と 呼ばれる部位に見られる神経細胞で、その役割の１つは体の動き を制御するこ とである。そのため、また、プルキンエ細胞は大型の細胞で発見しやすいことか ら、脳の可塑性を解明するための数々の研究の対象と なってきた。プルキンエ 細胞のシナプス内にリボソームが存在することが報告されたことを受け、当プロ ジェクトでは、これらのリボソームに関連 するRNAの特徴付けと定量化を目指し た。これらのリボソームがシナプス可塑性を制御するタンパク質の生成あるいは 翻訳自体に関連している可 能性があるためである。私たちは理化学研究所脳科学総合研究センターLauney研究ユニットとの共同研究 により、リボソーム・キャプチャーと呼ばれる方法を用いて プルキンエ細胞内 のリボソームを選択的に標識化し、これらのリボソームと結合したRNAを収集し た。そして、収集したRNAを理化学研究所ラ イフサイエンス技術基盤研究セン ターが開発したCAGEscan法を用いて解析し、RNAの転写開始点を同定、その量を 計測し、構造の特性を 明らかにした。この方法により私たちはプルキンエ細胞 のための新たなRNAマーカーを発見し、当該リボソームと同時精製されたことか ら翻訳の 制御にかかわっている可能性のあるノンコーディングRNAを同定。この 研究結果は『Genome Research』誌に発表した（Kratz et al. , 2014）。

The study of RNA in cells When the cell is in the middle of the cell, the cell is in the middle of the cell, and the cell is in the middle of the cell. The study of cell plasticity in large cells The characteristics of RNA associated with the presence of a protein in a cell are quantified. This is the first time I've ever seen a woman. Research Institute of Physical Chemistry, Institute of Scientific Research, Institute of Launey Research, Institute of Scientific Research The research of RNA technology base plate was carried out by the Institute of Chemical Physics, and the analysis of RNA was carried out by CAGEscan method. The starting point of RNA writing was determined, the quantity of RNA was measured, and the characteristics of structure were clarified. The method is simple and easy to use. The method is simple and easy to use. The results of this study are consistent with the findings of Genome Research (Kratz et al. , 2014).

项目成果

Digital expression profiling of the compartmentalized translatome of Purkinje neurons.

Purkinje神经元的分室翻译组的数字表达分析。

• DOI: 10.1101/gr.164095.113
• 发表时间: 2014-08
• 期刊: Genome research
• 影响因子: 7
• 作者: Kratz A;Beguin P;Kaneko M;Chimura T;Suzuki AM;Matsunaga A;Kato S;Bertin N;Lassmann T;Vigot R;Carninci P;Plessy C;Launey T
• 通讯作者: Launey T

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