Selective enrichment of polymorphic sequences (SEPS) for high throughput analysis of the animal genome (Selektive Anreicherung polymorpher Sequenzen für Hochdurchsatzanalyse des tierischen Genoms)

用于动物基因组高通量分析的多态序列选择性富集 (SEPS)

• 批准号: 5260017
• 负责人: Professor Dr. Heiner Niemann
• 金额: --
• 依托单位: Klinik für Gastroenterologie, Hepatologie und Endokrinologie
• 依托单位国家: 德国
• 项目类别: Research Grants
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 德国
• 起止时间: 1999-12-31 至 2005-12-31
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://gepris.dfg.de/gepris/projekt/5260017?language=en
• 关键词: Selective; enrichment; polymorphic; sequences; SEPS

Die Identifizierung von Gensequenzen, die mit genetischen Defekten bei Mensch und Tier korreliert sind, hat die Suche nach möglichst kostengünstigen und zuverlässigen Methoden zum Screenen genomischer DNA stimuliert. Neuartige Techniken für eine Hochdurchsatz-Genomanalyse (High Throughput Genomic Analysis) werden zur Zeit weltweit hochintensiv untersucht und entwickelt. Die zur Zeit verfügbaren Techniken erlauben es bereits, einzelne Nucleotid-Polymorphismen oder Sequenzänderungen (RFLPs, AFLPs) oder Polymorphismen im repetitiven Bereich (PCR basierende Mikrosatelliten bzw. Minisatelliten-Analyse) zu detektieren. Das vorgeschlagene Forschungsprojekt zielt darauf ab, diese beiden Ansätze zu integrieren und eine hocheffektive und reproduzierbare High Throughput-Technologie zur Darstellung genomischer Unterschiede zu entwickeln. Erste Daten, die in diesem Zusammenhang in unserem Labor bei der Genomanalyse domestizierter Tiere generiert werden konnten, haben die prinzipielle Durchführbarkeit dieses integrierten Ansatzes gezeigt. Die Technik basiert auf der selektiven Darstellung polymorpher repetitiver DNA-Sequenzen mit anschließender Analyse in der Kapillarelektrophorese mit Laser-induzierter Fluoreszenzdetektierung (CE-LIF). Unsere jüngsten Forschungsprojekte zielen auf die Evaluierung genetischer Variabilität in bedrohten Populationen von Haustieren in Deutschland und Rußland ab und haben bereits wertvolle Daten zur Entwicklung von Zuchtstrategien erbracht, die den Verlust genetischer Diversität bei Rassen, die als genetische Ressourcen gehalten werden, minimieren können. Eine detailierte genomische Analyse von hochbedrohten Tierpopulationen in beiden Ländern mit Hilfe der High Throughput-Technik würde erheblich präzisere Aussagen zur Diversität erlauben und dadurch nationale und internationale Programme zur Erhaltung wertvoller genetischer Ressourcen auf eine solidere wissenschaftliche Grundlage stellen können.

基因测序的鉴定，即人类和第三代遗传缺陷的鉴定，使这种方法具有最高的成本和最佳的筛选基因组DNA刺激的方法。Neuartige Techniken für eine Hochdurchsatz-Genomanalyse（高重复基因组分析）韦尔登zur Zeit weltweit hochintensiv untersucht und entwickelt.目前研究的技术主要包括核苷酸多态性或测序（RFLP，AFLP）或重复多态性（PCR baserende Mikrosatelliten bzw. Minisatelliten-Analyse）zu detektieren.这一研究项目已经完成，该项目将对遗传学研究的高效率和高重复率技术进行整合。第一个数据是，在我们的家庭劳动中，在韦尔登一般的基因分析中，原则上是在进行完整的分析。该技术基于激光诱导荧光（CE-LIF）的毛细管电泳中的自动分析的重复DNA测序的选择性多态性。我们的主要研究项目是对德国和俄罗斯的豪斯特人口的遗传变异性进行评估，并收集了一些数据，用于制定遗传多样性的战略，这些遗传资源是韦尔登最小的。Eine detailierte genomische Analyse von hochaparten Tierpopulationen in beiden Ländern mit Hilfe der High School-Technik würde erheblich aussagen zur Diversität erlauben und dadministration nationale und internationale Programme zur Erhaltung wertvoller genetischer Ressourcen auf eine solidere wissenschaftliche Grundlage stellen können.