フラビン酵素の高次構造と電子移動反応
黄素酶的高阶结构与电子转移反应
基本信息
- 批准号:10146247
- 负责人:
- 金额:$ 1.15万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
- 财政年份:1998
- 资助国家:日本
- 起止时间:1998 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
ブタ腎臓由来のD-アミノ酸酸化酵素(DAO)はD-アミノ酸を基質とし、酸化的脱アミノ反応によりイミノ酸を生成する反応を触媒する。酸化型と還元型DAOのどちらもその反応に際して、基質中間体とCT複合体を形成し、長波長部(500-700nm)に特徴的な幅広い吸収体を示す。今回真の反応中間体(紫色中間体)、還元型フラビンとプロリンのイミノ酸との複合体、の立体構造を2.5Å分解能で決定することができた。イミノ酸プロリンのLUMOとフラビン環のHOMOの相互作用について調べると、イミノ酸プロリンのN原子とフラビン環のC(4)とC(4a)原子の間およびイミノ酸プロリンのCα原子とフラビン環のN(5)原子の間にオービタルの重なりが見られた。フラビン環からイミノ酸プロリン側へこれらの相互作用を通して電子の移動が起こり、それが特徴的なCT吸収帯となって現れると考えられる。イミノ酸プロリンとD-プロリンの構造を比較すると、Cα原子の周り以外には大きな違いはないので、紫色中間体の構造から酸化型DAO・基質中間体の構造を容易に予測できる。この予測構造は、以前にo-アミノ安息香酸複合体の構造を用いて作成したモデルと同一と言えるものであった。したがって紫色中間体の構造は我々提案した2つの反応機構(EPEとイオン反応機構)を支持している。DAOの反応サイクルの中で、紫色中間体が分子状酸素により再酸化され酸化型DAOに戻る。紫色中間体とイミノ酸が遊離した還元型DAOのC(4a)の電子密度を比べると、紫色中間体の電子密度の方がより高い。このため紫色中間体の方が酸化されやすい。なぜ紫色中間体のC(4a)の電子密度が高くなるのかは明確でないが、イミノ酸のNH^+がC(4a)の上にあり、この正電荷とフラビン環の相互作用により負電荷を持つN(1)よりC(4a)に電子が移動すると考えられる。
The origin of the acid enzyme (DAO), the acid radical of the acidified enzyme, the acid radical of the acid, the acid. Acidified Dao yuan type DAOTHYDROPHOSPHATE, CT complex formation, long wave length (500-700nm) and long wavelength (500-Dao). This time, it is true that the body (purple medium), the meta-type, the acid complex, and the stereo body 2.5 can determine the decomposition of the body. This is not true because of the LUMO interaction between the HOMO and the environment. The nitrogen atom is responsible for the environmental pollution. The C (4) atom is sensitive to the C (4a) atom. The C (4a) atom is sensitive to the C α atom. The N (5) atom is responsible for the environmental pollution. The environment is in good condition. The interaction between computers and electronic devices is very important. It is necessary to use the special CT absorption system to improve the performance of the computer. It is easier to make body than that of C α atom, C α atom, acidified DAO, purple medium and acidified DNA. In the past, the compound of benzoin and benzoin acid was made and used to make the same words. We have proposed that the anti-terrorism organ (EPE counter-organization) of the Chinese people's Republic of China should support the anti-terrorism mechanism. DAO anti-acid, purple, molecular acid, reacidizing, acidified DAO. The density of Dao C (4a) is higher than that of purple and purple. The color is purple and the body is acidified. In purple, the density of electrons, the
项目成果
期刊论文数量(3)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Y.Nobe et al.: "The Novel Substrate Recognition Mechanism Utilized by Aspartate Aminotransferase of the Extreme Thermophile Thermus thermophilus HB8" J.Biol.Chem.273(45). 29554-29564 (1998)
Y.Nobe 等人:“极端嗜热栖热菌 HB8 的天冬氨酸氨基转移酶利用的新型底物识别机制”J.Biol.Chem.273(45)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
A.Okamoto et al.: "Crystal Structure of Paracoccus denitrificans Aromatic Amino Acid Amino transferase:A Substrate Recognition Site Constracted by Rearrangement of H-bond netwon" J.Mol.Biol.280(3). 443-461 (1998)
A.Okamoto 等人:“脱氮副球菌芳香氨基酸氨基转移酶的晶体结构:通过氢键网络重排构建的底物识别位点”J.Mol.Biol.280(3)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
T.Nakai et al.: "Crystallization and Preliminory X-ray Characterization of Aspartate Aminotransferase from an Extreme Thermophile,Thermus thermophilus HB8" Acta Crystallogr.D54(5). 1032-1034 (1998)
T.Nakai 等人:“来自极端嗜热菌、嗜热栖热菌 HB8 的天冬氨酸转氨酶的结晶和初步 X 射线表征”Acta Crystallogr.D54(5)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
広津 建其他文献
酢酸菌由来表在性膜タンパク質アルコール脱水素酵素の構造解析
醋杆菌表面膜蛋白乙醇脱氢酶的结构分析
- DOI:
- 发表时间:
2007 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
後藤 勝;宮原郁子;広津 建;松下一信 - 通讯作者:
松下一信
広津 建的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('広津 建', 18)}}的其他基金
フラビン酵素の高次構造と電子移動反応
黄素酶的高阶结构与电子转移反应
- 批准号:
12020249 - 财政年份:2000
- 资助金额:
$ 1.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
フラビン酵素の高次構造と電子移動反応
黄素酶的高阶结构与电子转移反应
- 批准号:
11133254 - 财政年份:1999
- 资助金额:
$ 1.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
高品質結晶によるアミノ基転移酵素の反応中間体の高分解能構造解析
使用高质量晶体对转氨酶反应中间体进行高分辨率结构分析
- 批准号:
08214212 - 财政年份:1996
- 资助金额:
$ 1.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
高品質結晶によるアミノ基転移酵素の反応中間体の高分解能構造解析
使用高质量晶体对转氨酶反应中间体进行高分辨率结构分析
- 批准号:
07224211 - 财政年份:1995
- 资助金额:
$ 1.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
高品質結晶によるアミノ基転移酵素の反応中間体の高分解能構造解析
使用高质量晶体对转氨酶反应中间体进行高分辨率结构分析
- 批准号:
06235214 - 财政年份:1994
- 资助金额:
$ 1.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
テトラアザシクロファン結晶中のカラム状包接の構造化学的研究
四氮杂环芳晶体中柱状包裹体的结构化学研究
- 批准号:
58540287 - 财政年份:1983
- 资助金额:
$ 1.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
酵素類似機能を有するシクロデキストリン誘導体の構造化学的研究
具有类酶功能的环糊精衍生物的结构化学研究
- 批准号:
56540281 - 财政年份:1981
- 资助金额:
$ 1.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
β-シクロデキストリン包接体の結晶構造解析
β-环糊精包合物的晶体结构分析
- 批准号:
X00095----564155 - 财政年份:1980
- 资助金额:
$ 1.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for General Scientific Research (D)
構造不変量の使用によるジテルペン類の結晶構造解析
使用结构不变量分析二萜的晶体结构
- 批准号:
X00095----064172 - 财政年份:1975
- 资助金额:
$ 1.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for General Scientific Research (D)
ネオペンチルグリコール(CH_3)_2C(CH_2OH)_2およびペンタグリセロールCH_3C(CH_2OH)_3のX線回析法による低温相高温相の結晶構造の解析
X射线衍射法分析新戊二醇(CH_3)_2C(CH_2OH)_2和五甘油CH_3C(CH_2OH)_3低温相和高温相的晶体结构
- 批准号:
X46210------4114 - 财政年份:1971
- 资助金额:
$ 1.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
相似海外基金
フラビン蛋白蛍光反応を用いた術中皮質神経活動リアルタイムイメージングの実現
利用黄素蛋白荧光反应实时成像术中皮质神经活动
- 批准号:
24K19523 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 1.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
フラビン誘導体の配列制御による機能性超分子・高分子の開発
通过控制黄素衍生物的序列开发功能性超分子和聚合物
- 批准号:
24K08511 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 1.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
フラビン含有酸素添加酵素の一次構造種差とヒト多型情報を活用した触媒機能予測基盤
利用含黄素加氧酶的一级结构差异和人类多态性信息预测催化功能的平台
- 批准号:
24K09896 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 1.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
糸状菌由来ビステトラヒドロフラン環構築に寄与する反復型酸素添加酵素の機能開拓
有助于丝状真菌双四氢呋喃环构建的重复加氧酶的功能发育
- 批准号:
22K06687 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 1.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
フラビン蛋白蛍光イメージング法を用いた複合性局所疼痛症候群の脊髄機序の解明
利用黄素蛋白荧光成像阐明复杂区域疼痛综合征的脊柱机制
- 批准号:
22K09019 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 1.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
活性酸素種を量産する細胞質フラビン酵素が酸素に応答する現象・機構の解明
阐明大量产生活性氧的细胞质黄素酶对氧的反应现象和机制
- 批准号:
22K05436 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 1.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
The understanding of early phase of neuropathic pain associated NO and TRPM2
早期神经病理性疼痛相关NO和TRPM2的认识
- 批准号:
22K16599 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 1.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
シアノバクテリアを用いた生物学的環境修復のための細胞内電子供給経路の機能解明
蓝藻修复生物环境的细胞内电子供应途径的功能阐明
- 批准号:
21K12288 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 1.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Study of the role of human flavin-containing monooxygenase 5 as a drug metabolizing enzyme
人含黄素单加氧酶5作为药物代谢酶的作用研究
- 批准号:
21K15320 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 1.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
マウス前庭野の同定と前庭障害後の前庭野の可塑性の評価
小鼠前庭皮层的识别及前庭损伤后前庭皮层可塑性的评价
- 批准号:
20K18244 - 财政年份:2020
- 资助金额:
$ 1.15万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists