時間分解ホールバーニングによる蛋白質の構造ダイナミクスの研究
時間分解ホールバーニングによる蛋白質の構造ダイナミクスの研究
批准号:
10157229
负责人:
柴田 穣
金额:
$1.15万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份:
1998
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1998 至 --
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これまで、時間分解ホールバーニング法を用いて調べてきた蛋白質構造ダイナミクスに対する理解をより深めるため、構造揺らぎに対する溶媒の効果について重点的に調べた。そのために、これまでも用いてきた試料であう亜鉛置換ミオグロビン(ZnMb)溶液において、溶媒条件を系統的に変えたときに構造揺らぎがどのように変化するかを詳細に調べた。実験結果を解析することにより以下のような結論が得られた。全ての溶媒条件のZnMb試料において、蛋白質の構造揺らぎによるホールスペクトルのピーク位置の時間発展は、著しく単一指数関数的な振る舞いからかけ離れた非指数関数的振る舞いを示した。近似的に、その時間発展は拡張指数関数(exp[-(t/T)^β]、β=0.26で表された。β=0.26という値は通常のガラス形成液体等と比べても非常に小さく、蛋白質内の揺らぎの時間スケールの幅広い分布を反映しているものと考えている。上述のような振る舞いを示さない唯一の例外は、固体フィルムにznMbをドーブした試料であった。この場合、調べられた全ての温度でホールスペクトルの時間変化は見られなかった。蛋白質を取り囲む周りの環境が固体になった場合には、蛋白質は揺らぐことができないことを非常に鮮明に示す結果である。また、遺伝子操作によりヒスチジン64をロイシンに置換した変異体試料を用いて実験行ったところ、野生種で見られるホールスペクトルの時間変化が明らかに抑えられる傾向があることが分かった。このことより、野生種で見られているスペクトルの時間変化は、ヒスチジン64の揺らぎによるものである可能性が示唆される。現在詳しい解析が進行中である。
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柴田 穣: "Conformational Fluctuation of Native-Like and Molten-Globule-Like Cytochrome c Observed by Time-Resolved Hole Burning" Biochemistry. 38. 1802-1810 (1999)
Minoru Shibata:“通过时间分辨孔燃烧观察到的类天然细胞色素 c 的构象波动”生物化学 38。1802-1810 (1999)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
柴田 穣: "Determination of Qx-and Qy-absorption bands of Zn-porphyrin derivatives contained in proteins by hole-burnig spectroscopy" Chemical Physics Letters. 284. 115-120 (1998)
Minoru Shibata:“通过烧孔光谱法测定蛋白质中所含锌卟啉衍生物的 Qx 和 Qy 吸收带”《化学物理快报》284. 115-120 (1998)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
柴田 穣: "Solvent Effects on Conformational Dynamics of Zn-Substituted Myoglobin Observed by Time-Resolved Hole-Burning Spectroscopy" Biochemistry. 38. 1789-1801 (1999)
Minoru Shibata:“通过时间分辨烧孔光谱观察溶剂对锌取代肌红蛋白构象动力学的影响”生物化学 38。1789-1801 (1999)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
栗田 厚: "Slow fluctuation in chromophtre-solvent systems observed by time-vesolved transient hole-burning spectroscopy" Journal of Lumines cence. 76&77. 295-198 (1998)
Atsushi Kurita:“通过时间分辨瞬态烧孔光谱观察到的发色溶剂系统的缓慢波动”,《发光杂志》76&77 (1998)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
柴田 穣: "Real-Time Observation of Conformational Fluctuations in Zn-Substituted Myoglobin by Time-Resolved Ticmsieut Hole-Burning Spectroscopy" Biophysical Journal.75. 521-527 (1998)
Minoru Shibata:“通过时间分辨 Ticmsieut 烧孔光谱实时观察锌取代肌红蛋白的构象波动”生物物理学杂志.75(1998)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
振電バンド観測による光合成タンパク質の1分子振動分光
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批准号:15F15032
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.47万
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财政年份:2015
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负责人:柴田 穣
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依托单位:
室温から極低温までのピコ・フェムト秒蛍光分光による光合成反応初期過程の研究
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批准号:17750010
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.43万
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财政年份:2005
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负责人:柴田 穣
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依托单位:
光合成タンパク質複合体の構造形成過程の追跡
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批准号:14780509
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2002
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负责人:柴田 穣
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依托单位:
時間分解ホールバーニング分光法を用いた蛋白質構造ダイナミクスの研究
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批准号:11780483
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1999
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负责人:柴田 穣
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依托单位:
海外基金