课题基金 / 基金详情

ゲノム刷込み領域の構造特性と疾患遺伝子の探索

ゲノム刷込み領域の構造特性と疾患遺伝子の探索
基因组印迹区域的结构特征及疾病基因的寻找
批准号:
10168220
负责人:
佐々木 裕之
金额:
$2.18万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份:
1998
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1998 至 1999

项目摘要

项目成果

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中文摘要
翻译
ゲノム刷り込みを受ける遺伝子がクラスターとして存在するマウス7F4/F5領域はヒト11p15.5領域とシンテニーをなし、Beckwith-Wiedemann症候群、各種小児癌などの刷り込み関連疾患の責任座位を含んでいる。本研究では、ゲノム刷り込み領域の構造特性を明らかにし、疾患関連刷り込み遺伝子を単離するため、当該領域のゲノム解析を行っている。平成10年度はゲノム構造解析の最終段階に入り、以下の成果を得た。(i)まずマウスの当該領域およそ1MbをカバーするYAC、BAC、コスミドクローンの整列化を完成させ、その物理地図を作成した。得られた整列化BACクローンをショットガン法でシークエンスし、配列のギャップを閉じる最終作業に入った。(ii)ヒトとマウスの配列比較によりH19遺伝子の下流に合計10箇所の保存された領域を同定し、トランスジェニックマウス作成によりそのうち7つが組織特異的エンハンサーであることを示した。(iii)遺伝子のマーカーであるCpGアイランド同定する簡便な方法を開発し、この方法を当該領域に適用して、5つの新規遺伝子候補領域を同定した。今後は得られた配列情報を整理し、制御配列同定と新奇刷り込み遺伝子同定の最終作業に入る。
英文摘要
ゲノム刷り込みを受ける遺伝子がクラスターとして存在するマウス7F4/F5領域はヒト11p15.5領域とシンテニーをなし、Beckwith-Wiedemann症候群、各種小児癌などの刷り込み関連疾患の責任座位を含んでいる。本研究では、ゲノム刷り込み領域の構造特性を明らかにし、疾患関連刷り込み遺伝子を単離するため、当該領域のゲノム解析を行っている。平成10年度はゲノム構造解析の最終段階に入り、以下の成果を得た。(i)まずマウスの当該領域およそ1MbをカバーするYAC、BAC、コスミドクローンの整列化を完成させ、その物理地図を作成した。得られた整列化BACクローンをショットガン法でシークエンスし、配列のギャップを閉じる最終作業に入った。(ii)ヒトとマウスの配列比較によりH19遺伝子の下流に合計10箇所の保存された領域を同定し、トランスジェニックマウス作成によりそのうち7つが組織特異的エンハンサーであることを示した。(iii)遺伝子のマーカーであるCpGアイランド同定する簡便な方法を開発し、この方法を当該領域に適用して、5つの新規遺伝子候補領域を同定した。今後は得られた配列情報を整理し、制御配列同定と新奇刷り込み遺伝子同定の最終作業に入る。
期刊论文(1)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Kato,R.: "Quick identification and localozation of CpG islands in large genomic fragments by partial digestion with HpaII and HhaI" DNA Res.5. 287-295 (1998)
Kato,R.:“通过 HpaII 和 HhaI 部分消化,快速识别和定位大型基因组片段中的 CpG 岛”DNA Res.5。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
Effect of exercise timing on mouse intestinal microbiota and investigate mechanism
  • 批准号:
    21K17648
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
  • 资助金额:
    $1.75万
  • 财政年份:
    2021
  • 负责人:
    佐々木 裕之
  • 依托单位:
Omics approaches towards elucidation of the molecular network regulating DNA methylation in mammalian oocytes
  • 批准号:
    18H03988
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
  • 资助金额:
    $28.37万
  • 财政年份:
    2018
  • 负责人:
    佐々木 裕之
  • 依托单位:
ヒトiPS細胞作製過程におけるリプログラミング促進分子機構の解析
  • 批准号:
    14F04102
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for JSPS Fellows
  • 资助金额:
    $1.47万
  • 财政年份:
    2014
  • 负责人:
    佐々木 裕之
  • 依托单位:
脊椎動物におけるエピジェネティクス機構の比較ゲノム解析
  • 批准号:
    15011254
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
  • 资助金额:
    $3.07万
  • 财政年份:
    2003
  • 负责人:
    佐々木 裕之
  • 依托单位:
海外基金