ゲノム刷込み領域の構造特性と疾患遺伝子の探索

基因组印迹区域的结构特征及疾病基因的寻找

• 批准号: 12024227
• 负责人: 佐々木 裕之
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: National Institute of Genetics
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12024227/
• 关键词: ゲノム刷込み; ゲノムインプリンティング; ゲノムドメイン; エンハンサー; インスレーター

ゲノム刷込み(インプリンティング)を受ける哺乳類遺伝子がゲノムの特定の場所にクラスターを形成することは、これが染色体の機能ドメインを解析するよいモデルとなることを示唆している。マウス第7染色体遠位部(7F4/F5)の刷込み領域は、糖尿病、Beckwith-Wiedemann症候群、Wilms腫瘍などの刷込み関連疾患の責任領域であるヒト第11染色体短腕(11p15.5)と相同である。ヒトの刷込み関連疾患の解析を支援するため、本年度は、このマウスの刷込みドメイン(およそ1Mbに10個余のインプリンティング遺伝子がある)の全塩基配列を佐賀医大向井ら、理研服部らと共同で決定した。ヒトの当該領域と比較した結果、例えばKvLQT1のイントロン内に進化的に保存された配列があり、それらが制御配列である可能性が示された。さらに、H19周辺の保存された配列を実際にレポーター測定法やゲルシフト法により調べ、組織特異的エンハンサーや刷込みに関わるインスレーター蛋白質の結合配列であることを報告した。また、このドメインの配列と一致するESTをBLASTを用いて検索したり、エクソン予測ソフトを行い、新規遺伝子の可能性のある配列を多数見つけた。しかし、これらの転写物の詳細な解析はこれからである。今後、同定された遺伝子や調節配列をマウス個体でノックアウトするなどにより、刷込みの制御機構やヒト刷込み疾患の発症機構を明らかにしていく予定である。

In order to understand the function of chromosomes, mammalian genes are required to form chromosomes in specific locations. The domain of responsibility for the aberrant portion of chromosome 7 (7F4/F5), diabetes mellitus, Beckwith-Wiedemann syndrome, Wilms disease, and related diseases is the same as that of chromosome 11 (11p15.5). This year, we jointly decided on the allocation of all the 10 remaining items in the list of related diseases to Saga Medical University. When comparing the results of this field, for example, KvLQT1 and KvLQT1, the probability of evolution is shown. In addition, the H19 cycle of the preservation of the protein alignment in the real time, the determination of the protein alignment in the tissue specific, the tissue specific, the determination of the protein alignment in the tissue specific, the determination of the protein alignment in the tissue specific. For example, if a BLAST is used to detect a target, it may be used to predict a target, and if a new target is used to detect a target, it may be used to detect a target. A detailed analysis of the contents of the article. In the future, the regulation of genetic diversity will be determined by the individual, the control mechanism and the disease mechanism.

项目成果

Ohno,M.: "Allele-specific detection of nascent transcripts by fluorescence in situ hybridization reveals temporal and culture-induced changes in Igf2 imprinting during pre-implantation mouse development."Genes to Cells. (印刷中). (2001)

Ohno, M.：“通过荧光原位杂交对新生转录物进行等位基因特异性检测，揭示了植入前小鼠发育过程中 Igf2 印记的时间和培养诱导的变化。”Genes to Cells（2001 年出版）。

Watanabe,T.: "Differential chromatin packaging of genomic imprinted regions between expressed and non-expressed alleles."Human Molecular Genetics. 9. 3029-3035 (2000)

Watanabe,T.：“表达和非表达等位基因之间基因组印记区域的差异染色质包装。”人类分子遗传学。

Mizuno,S.: "Expression of DNA methyltransferases DNMT 1, 3A and 3B in normal hematopoiesis and in acute and chronic myelogenous leukemia."Blood. (印刷中). (2001)

Mizuno, S.：“DNA 甲基转移酶 DNMT 1、3A 和 3B 在正常造血和急性和慢性骨髓性白血病中的表达。”血液（2001 年出版）。

Sado,T.: "Regulation of imprinted X-inactivation in mice by Tsix."Development. (印刷中). (2001)

Sado, T.：“Tsix 对小鼠印记 X 失活的调节”。开发（出版中）。

Yokomine,T.: "Sequence polymorphisms, allelic expression status and chromosomal locations of the chicken IGF2 and MPR1 genes."Cytogenetics and Cell Genetics. (印刷中). (2001)

Yokomine, T.：“鸡 IGF2 和 MPR1 基因的序列多态性、等位基因表达状态和染色体位置。”《细胞遗传学和细胞遗传学》（出版中）。