ゲノム刷込み領域の構造特性と疾患遺伝子の探索

基因组印迹区域的结构特征及疾病基因的寻找

• 批准号: 09272217
• 负责人: 佐々木 裕之
• 金额: $ 1.73万
• 依托单位: Kyushu University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 1997
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1997 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-09272217/
• 关键词: ゲノム刷り込み; インプリンティング; DNAメチル化

ゲノム刷込みを受ける遺伝子がクラスターを形成するマウス第7染色体遠位部は、インスリン依存性糖尿病、Beckwith-Wiedemann症候群、各種小児腫瘍などの責任座位を含むヒト11p15.5領域に相当する。このゲノム領域をモデルとして染色体ドメインレベルの刷込み制御機構を解明し、新たな疾患関連遺伝子を同定・解析することを目的として、以下の研究を行った。1.対象となるおよそ1Mbのマウスゲノム領域をカバーするYACクローンを整列化し、コスミドサブクローンの整列化を開始した。これまでにおよそ0.5Mbの領域をカバーするコスミドを整列化している。2.H19遺伝子と下流のL23mrp遺伝子の間に刷込みドメインの境界が存在することを報告した。つまりH19および上流の遺伝子は刷込み受けるが、L23mrpから下流の遺伝子は刷込みを受けない。そこには染色体の機能ドメインを区切るDNA配列が存在する可能性がある。3.Igf2・H19遺伝子付近に新たな転写単位が複数あることを見つけた。そのうちIgf2付近のものは刷込みを受けることが分かった。4.ヒトH19遺伝子を含むコスミドを得てその塩基配列を決定し、マウスの配列と比較検討したところ、遺伝子以外の領域に数ヵ所の保存された配列があることが分かった。これらの配列をマウスに導入したところエンハンサー活性をもつことが分かった。今後この1Mbのマウスゲノム領域の塩基配列の決定、ヒト配列との比較・CpGアイランド検索・エクソントラップ法などにより新たな遺伝子を探すとともに、種々の機能配列も同定し、ドメインレベルの刷込み機構を明らかにする予定である。

The locus of responsibility for the development of chromosome 7 is located in the region corresponding to chromosome 11p15.5 in diabetes mellitus, Beckwith-Wiedemann syndrome, and various childhood diseases. The study was carried out to clarify the mechanism of chromosome identification and identification of new disease-related genes. 1. Start of YAC alignment for image and 1Mb for image. This is a 0.5Mb domain. 2. H19 and downstream L23mrp are reported to exist in the middle of the spectrum. H19 mrp, L23mrp The possibility of DNA alignment in chromosome function is discussed. 3. Igf2·H19そのうちIgf2付近のものは刷込みを受けることが分かった。4. The H19 gene contains a number of genes, and the sequence of genes is determined. The sequence of genes is compared with the sequence of genes. The sequence of genes is determined by the sequence of genes. This is the first time I've ever seen you. In the future, 1Mb of data must be used to determine the base arrangement of the field, compare the base arrangement with the CpG base arrangement, search the base arrangement, search the base arrangement method, search the base arrangement, search the base arrangement method, search the base arrangement, search base arrangement, search base arrangement

项目成果

Hayashida,T.: "Imprinted genes are up-regulated by growth arrest in embryonic fibroblasts." Journal of Biochemistry. 122. 901-903 (1997)

Hayashida,T.：“印记基因因胚胎成纤维细胞生长停滞而上调。”

Zubair,M.: "Structure and expression of the mouse L23mrp gene downstream of the imprinted H19 gene:biallelic expression and lack of interaction with the H19 enhancers." Genomics. 45. 290-296 (1997)

Zubair,M.：“印记 H19 基因下游的小鼠 L23mrp 基因的结构和表达：双等位基因表达以及缺乏与 H19 增强子的相互作用。”

Hatano,N.: "Enhancer-dependent,locus-wide regulation of the imprinted mouse insulin-like growth factor II gene." Journal of Biochemistry. (印刷中).

Hatano, N.：“印记小鼠胰岛素样生长因子 II 基因的增强子依赖性、全基因座调节。”《生物化学杂志》（正在出版）。

Moore,T.: "Multiple imprinted sense and antisense transcripts,differential methylation and tandem repeats in a putative imprinting control region upstream of mouse Igf2." Proc.Natl.Acad.Sci.USA. 94. 12509-12514 (1997)

Moore,T.：“小鼠 Igf2 上游推定的印记控制区域中的多个印记有义和反义转录本、差异甲基化和串联重复。”

Shibata,H.: "A methylation imprint mark in the imprinted gene Grf1/Cdc25Mm locus shares a common feature with the U2afbp-rs gene:an association with a short tandem repeat and a hypermethylated region." Genomics. (印刷中).

Shibata, H.：“印记基因 Grf1/Cdc25Mm 基因座中的甲基化印记标记与 U2afbp-rs 基因具有共同特征：与短串联重复序列和高甲基化区域相关（正在出版）。”