Construction of a PAC-contig in the region of the RYRl gene on SSC6q1.2

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In dem Projekt soll ein "P1 derived artificial chromosome" (PAC) Contig von der Region SSC6q1.2 erzeugt werden. In dieser chromosomalen Region befindet sich beim Schwein mit dem RYR1 Gen der Genort für die maligne Hyperthermie (MH), die zu Streßanfälligkeit führt. Eng gekoppelt mit der Streßanfälligkeit werden auch günstige Merkmale wie starke Bemuskelung und hoher Magerfleischanteil vererbt. Trotz weltweiter, intensiver Forschungsaktivität ist bis heute nicht klar, ob die ursächliche Mutation für die Streßanfälligkeit im RYR1 Gen gleichzeitig auch für den positiven Effekt auf die Fleischleistung verantwortlich ist, oder ob dieser Effekt von einer zweiten Mutation in einem eng benachbarten Gen verursacht wird. Die Klonierung dieser genomischen Region als PAC-Contig ist ein wichtiger Schritt auf dem Weg zur DNA-Sequenz der codierenden Bereiche dieser chromosomalen Region. Diese Daten wären eine Grundvoraussetzung für die systematische Mutationsanalyse, die nötig ist, um tatsächlich die funktionellen Polymorphismen aufzuspüren, die für die beobachteten phänotypischen Effekte auf die Fleischleistung verantwortlich sind. Weiterhin würde ein solcher PAC-Contig eine wesentlich genauere Integration der existierenden physikalischen und genetischen Karten ermöglichen.