光化学系II酸素発生複合体の結晶化と構造解析
光化学系II酸素発生複合体の結晶化と構造解析
批准号:
11169245
负责人:
沈 建仁
金额:
$1.6万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份:
1999
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
1999 至 2000
中文摘要
光化学系II複合体は、14種の膜貫通サブユニットと3種の膜表在性サブユニットを含む、分子量320kDaの超分子複合体である。系II複合体の結晶構造解析を行うため、約35種の重原子同型誘導体を作製し、SPring-8のBL41XU,BL45PXにて、100K,X線波長1.0Åにてデータ収集・分析を行った。その結果、Ta_6Br_<14>の誘導体と母結晶の差パターソン関数から有意な差が得られ、分解能6.0Åでの初期位相を得ることができ、それに基づき光化学系II複合体の初期電子密度図を得た。しかし、多くの誘導体については、母結晶との差パターソン関数において、ノイズレベルが高いため重原子位置を決定することができなかった。これは、重原子ソーキング操作による結晶の同型性の変化が原因と考え、同型性保持に適したソーキング条件(それぞれの重原子の濃度、ソーキング時間)を検討し、その確立を行った。一方、光化学系II複合体には、4原子マンガンからなるクラスターと、3原子以上の鉄が含まれているので、マンガンと鉄のMADデータを収集した。マンガンのMADデータから有意なピークが得られ、それを用いた位相改良を試みている。鉄については、解析可能なデータを得ることができなかった。構造解析と並行して、より分解能の高い結晶作成を試み、サンプルバッチ・結晶化条件の違いにより、最高3.1Åの回折点を与える結晶を得ることができた。
英文摘要
光化学系II複合体は、14種の膜貫通サブユニットと3種の膜表在性サブユニットを含む、分子量320kDaの超分子複合体である。系II複合体の結晶構造解析を行うため、約35種の重原子同型誘導体を作製し、SPring-8のBL41XU,BL45PXにて、100K,X線波長1.0Åにてデータ収集・分析を行った。その結果、Ta_6Br_<14>の誘導体と母結晶の差パターソン関数から有意な差が得られ、分解能6.0Åでの初期位相を得ることができ、それに基づき光化学系II複合体の初期電子密度図を得た。しかし、多くの誘導体については、母結晶との差パターソン関数において、ノイズレベルが高いため重原子位置を決定することができなかった。これは、重原子ソーキング操作による結晶の同型性の変化が原因と考え、同型性保持に適したソーキング条件(それぞれの重原子の濃度、ソーキング時間)を検討し、その確立を行った。一方、光化学系II複合体には、4原子マンガンからなるクラスターと、3原子以上の鉄が含まれているので、マンガンと鉄のMADデータを収集した。マンガンのMADデータから有意なピークが得られ、それを用いた位相改良を試みている。鉄については、解析可能なデータを得ることができなかった。構造解析と並行して、より分解能の高い結晶作成を試み、サンプルバッチ・結晶化条件の違いにより、最高3.1Åの回折点を与える結晶を得ることができた。
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Enami I.,Yoshihara S.,Tohri A.,Okumura A.,Ohta H.,Shen J.-R.: "Cross-reconstitution of various extrinsic proteins and photosystem II complexes from cyanobacteria, red algae and higher plants."Plant Cell Physiol.. 41・12. 1354-1364 (2000)
Enami I.、Yoshihara S.、Tohri A.、Okumura A.、Ohta H.、Shen J.-R.:“来自蓝藻、红藻和高等植物的各种外在蛋白和光系统 II 复合物的交叉重建。”植物细胞生理学.. 41・12. (2000)
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Ohta H., et al.: "Cloning, expression of the psbU gene, and functional studies of the recombinant 12-kDa protein of photosystem II from a red alga Cyanidium caldarium"Biochem.Biophys.Res.Comm.. 260・1. 245-250 (1999)
Ohta H.等:“来自红藻Cyanidium caldarium的光系统II的重组12-kDa蛋白的克隆、表达和功能研究”Biochem.Biophys.Res.Comm.. 260・1。 245-250 (1999)
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Al-Khaldi,S.,Coker,J.,Shen,J.-R.,R.L.Burnap: "Characterization of site-directed mutations in the manganese-stabilizing protein of Synechocystis sp. PCC 6803 unable to grow photoauto-trophically in the absence of cytochrome c-550."Plant Mol.Biol.. 43. 33-4
Al-Khaldi,S.,Coker,J.,Shen,J.-R.,R.L.Burnap:“集胞藻属 PCC 6803 的锰稳定蛋白定点突变的特征。PCC 6803 无法在
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
Shen J.-R., Kamiya N.: "Crystallization and the crystal properties of the oxygen-evolving photosystem II from Synechococcus vulcanus"Biochemistry. 39・48. 14739-14744 (2000)
Shen J.-R.,Kamiya N.:“聚球藻释氧光系统 II 的结晶和晶体特性”生物化学 39・48(2000)。
DOI:
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发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
光化学系II水分解能機構の解明
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批准号:22H00410
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$27.46万
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财政年份:2022
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负责人:沈 建仁
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依托单位:
Elucidation of the mechanisms for light-induced water-splitting and light energy utilization in photosynthesis
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批准号:22H04916
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项目类别:Grant-in-Aid for Specially Promoted Research
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资助金额:$401.69万
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财政年份:2022
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负责人:沈 建仁
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依托单位:
高分解能・時間分解構造解析による光化学系II水分解反応機構の解明
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批准号:17H06163
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
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资助金额:$130.96万
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财政年份:2017
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负责人:沈 建仁
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依托单位:
光合成水分解・酸素発生反応の分子機構の解明
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批准号:24247009
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
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资助金额:$12.56万
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财政年份:2012
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负责人:沈 建仁
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依托单位:
紅藻由来光化学系II複合体の結晶化と構造解析
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批准号:23657037
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.5万
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财政年份:2011
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负责人:沈 建仁
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依托单位:
集光性色素アンテナタンパクLHCII複合体の構造と機能
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批准号:04F04178
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2004
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负责人:沈 建仁
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依托单位:
光合成系II酸素発生膜蛋白質複合体の三次元結晶化
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批准号:07780587
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1995
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负责人:沈 建仁
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依托单位:
海外基金