Elucidation of the mechanisms for light-induced water-splitting and light energy utilization in photosynthesis
Elucidation of the mechanisms for light-induced water-splitting and light energy utilization in photosynthesis
批准号:
22H04916
负责人:
沈 建仁
金额:
$401.69万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Specially Promoted Research
财政年份:
2022
资助国家:
日本
项目状态:
未结题
起止时间:
2022-04-01 至 2027-03-31
中文摘要
本研究の目的は、光合成における光誘導水分解反応の機構と光エネルギーの高効率利用機構の解明である。光誘導水分解反応の機構解析では、時分割ポンプ-プローブシリアルフェムト秒X線結晶構造解析法(SFX法)を用いて、光化学系II(PSII)のマイクロ結晶に1または2閃光照射で得られたS2, S3中間状態の形成について、nsec-msecの時間範囲でデータを収集し、解析した。その結果、S3状態で新たな酸素原子(O6)が挿入される前にMn4CaO5クラスター及びその周辺で様々な構造変化が起き、特にD1-Glu189近傍で新たな酸素原子(O6*)が出現し、それがO6の前駆体であることを発見した。これらの発見は、PSIIによる水分解・酸素発生反応の機構解明に重要な意味を持っている。それらの実験結果を検証するため、高精度量子化学計算を実施するための専用計算機システムを筑波大学計算科学研究センターに設置し、MnクラスターでのCoupled Cluster(CC)計算が実行できることを確認し、まずはS1状態の計算、大規模モデル、スピン状態の検討を行った。さらに基質である水の挿入経路、産物であるプロトンの排出経路に寄与する水素結合ネットワークを理論的に検討した。プロトンの排出経路を特定するため、D1タンパク質のアミノ酸置換体を作成し、それらが水分解反応の活性に対する影響を解析した。光エネルギーの高効率利用機構の解明においては、クライオ電子顕微鏡を用いて灰色藻Cyanophora paradoxa由来光化学系I(PSI)四量体、始原的シアノバクテリアであるGloeobacter violaceusのPSI三量体構造及び珪藻由来PSII-FCPIIの高分解能構造等を解析した。また、光捕集アンテナでの励起エネルギー移動効率について、理論モデルを構築し、そのダイナミックス研究を進めた。
英文摘要
本研究の目的は、光合成における光誘導水分解反応の機構と光エネルギーの高効率利用機構の解明である。光誘導水分解反応の機構解析では、時分割ポンプ-プローブシリアルフェムト秒X線結晶構造解析法(SFX法)を用いて、光化学系II(PSII)のマイクロ結晶に1または2閃光照射で得られたS2, S3中間状態の形成について、nsec-msecの時間範囲でデータを収集し、解析した。その結果、S3状態で新たな酸素原子(O6)が挿入される前にMn4CaO5クラスター及びその周辺で様々な構造変化が起き、特にD1-Glu189近傍で新たな酸素原子(O6*)が出現し、それがO6の前駆体であることを発見した。これらの発見は、PSIIによる水分解・酸素発生反応の機構解明に重要な意味を持っている。それらの実験結果を検証するため、高精度量子化学計算を実施するための専用計算機システムを筑波大学計算科学研究センターに設置し、MnクラスターでのCoupled Cluster(CC)計算が実行できることを確認し、まずはS1状態の計算、大規模モデル、スピン状態の検討を行った。さらに基質である水の挿入経路、産物であるプロトンの排出経路に寄与する水素結合ネットワークを理論的に検討した。プロトンの排出経路を特定するため、D1タンパク質のアミノ酸置換体を作成し、それらが水分解反応の活性に対する影響を解析した。光エネルギーの高効率利用機構の解明においては、クライオ電子顕微鏡を用いて灰色藻Cyanophora paradoxa由来光化学系I(PSI)四量体、始原的シアノバクテリアであるGloeobacter violaceusのPSI三量体構造及び珪藻由来PSII-FCPIIの高分解能構造等を解析した。また、光捕集アンテナでの励起エネルギー移動効率について、理論モデルを構築し、そのダイナミックス研究を進めた。
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DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Shoji Mitsuo, Watanabe Natsuki, Hori Yuta, Furuya Kenji, Umemura Masayuki, Boero Mauro, Shigeta Yasuteru, Jian-Ren Shen, Jian-Ren Shen, Jian-Ren Shen]
通讯作者:
Jian-Ren Shen
Comprehensive Search of Stable Isomers of Alanine and Alanine Precursors in Prebiotic Syntheses
益生元合成中丙氨酸和丙氨酸前体稳定异构体的综合检索
DOI:
10.1089/ast.2022.0011
发表时间:
2022
期刊:
Astrobiology
影响因子:
4.2
作者:
[Shoji Mitsuo, Watanabe Natsuki, Hori Yuta, Furuya Kenji, Umemura Masayuki, Boero Mauro, Shigeta Yasuteru]
通讯作者:
Shigeta Yasuteru
DOI:
10.1038/s41557-022-00992-3
发表时间:
2022-07
期刊:
Nature Chemistry
影响因子:
21.8
作者:
[Xiaohong Liu;Pengcheng Liu;Hongjie Li;Zhen Xu;Lu Jia;Yangsheng Xia;Minling Yu;Wen-Yi Tang;Xiaolei Zhu;Chao Chen;Yuanlin Zhang;E. Nango;Rie Tanaka;F. Luo;Koji Kato;Y. Nakajima;Shunpei Kishi;Huaxin Yu;N. Matsubara;S. Owada;K. Tono;S. Iwata;Long-Jiang Yu;Jian-Ren Shen;Jiangyun Wang]
通讯作者:
Xiaohong Liu;Pengcheng Liu;Hongjie Li;Zhen Xu;Lu Jia;Yangsheng Xia;Minling Yu;Wen-Yi Tang;Xiaolei Zhu;Chao Chen;Yuanlin Zhang;E. Nango;Rie Tanaka;F. Luo;Koji Kato;Y. Nakajima;Shunpei Kishi;Huaxin Yu;N. Matsubara;S. Owada;K. Tono;S. Iwata;Long-Jiang Yu;Jian-Ren Shen;Jiangyun Wang
研究室ホームページ
实验室主页
DOI:
--
发表时间:
期刊:
影响因子:
--
作者:
[]
通讯作者:
DOI:
--
发表时间:
2022
期刊:
影响因子:
--
作者:
[Shoji Mitsuo, Watanabe Natsuki, Hori Yuta, Furuya Kenji, Umemura Masayuki, Boero Mauro, Shigeta Yasuteru, Jian-Ren Shen, Jian-Ren Shen]
通讯作者:
Jian-Ren Shen
共 10 条
光化学系II水分解能機構の解明
-
批准号:22H00410
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
-
资助金额:$27.46万
-
财政年份:2022
-
负责人:沈 建仁
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依托单位:
高分解能・時間分解構造解析による光化学系II水分解反応機構の解明
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批准号:17H06163
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (S)
-
资助金额:$130.96万
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财政年份:2017
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负责人:沈 建仁
-
依托单位:
光合成水分解・酸素発生反応の分子機構の解明
-
批准号:24247009
-
项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (A)
-
资助金额:$12.56万
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财政年份:2012
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负责人:沈 建仁
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依托单位:
紅藻由来光化学系II複合体の結晶化と構造解析
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批准号:23657037
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项目类别:Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research
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资助金额:$2.5万
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财政年份:2011
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负责人:沈 建仁
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依托单位:
集光性色素アンテナタンパクLHCII複合体の構造と機能
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批准号:04F04178
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项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
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资助金额:$1.54万
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财政年份:2004
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负责人:沈 建仁
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依托单位:
光化学系II酸素発生複合体の結晶化と構造解析
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批准号:11169245
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
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资助金额:$1.6万
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财政年份:1999
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负责人:沈 建仁
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依托单位:
光合成系II酸素発生膜蛋白質複合体の三次元結晶化
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批准号:07780587
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项目类别:Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
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资助金额:$0.58万
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财政年份:1995
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负责人:沈 建仁
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依托单位:
海外基金