Rasterkraftmikroskopische Charakterisierung von Proteinkomplexen der DNA-Reparatur

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Im geplanten Projekt sollen Proteinkomplexe der DNA-Reparatur mit Hilfe der Rasterkraftmikroskopie (SFM) abgebildet werden. An einer definiert geschädigten Modell-DNA, die eine singuläre Cisplatin-Modifikation trägt, sollen Komplexe der Nukleotid-Exzisionsreparatur des Menschen schrittweise rekonstituiert und mit der SFM charakterisiert werden. Wir erwarten neue Informationen zur Architektur der Komplexe (Topologie und Krümmung der gebundenen DNA, Größe, Spezifität und Polarität der Komplexe) und wir wollen die Methodik zur SFM-Abbildung von Protein-DNA-Komplexen in wässrigem Medium weiterentwickeln und verbessern. Unter diesen Aspekten sollen auch quervernetzte Protein-DNA-Komplexe untersucht werden. Ferner sollen verschiedene funktionelle Zustände der Nukleotid-Exzisionsreparatur mikroskopisch charakterisiert werden.