超機能性合成オリゴヌクレオチドによる特定遺伝子の転写制御法の開発

使用超功能合成寡核苷酸开发特定基因的转录控制方法

• 批准号: 11877395
• 负责人: 今西 武
• 金额: $ 1.41万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Exploratory Research
• 财政年份: 1999
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1999 至 2000
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-11877395/
• 关键词: ヌクレオシド; オリゴヌクレオシド; アンチジーン; アンチセンス; BNA; コンホメーション; 三重鎖核酸; オリゴヌクレオチド; アナンチセンス; C-ヌクレオシド

一般に、三重鎖核酸の形成は標的二重鎖DNAがホモプリン-ホモピリミジン配列の場合に限定され、これがアンチジーン法の一般化・実用化を大きく妨げている.申請者らは、これまでにアンチジーン法によるDNAレベルでの遺伝子発現制御に向けた新しい核酸類縁体2'-O,4'-C-methylene bridged nucleic acid(2',4'-BNA)の合成に成功している。今回、このBNAの標的DNAに対する三重鎖形成能を詳細に評価したところ、BNAが極めて高い三重鎖形成能を有すること、その三重鎖形成は配列特異的であること等の興味深い知見が得られた。さらに、このBNAに新たな核酸塩基を導入し、これまでは極めて困難とされてきたCG塩基対をHoogsteen型水素結合にて認識可能かどうかという点について検討を進めた。合成した新規BNA類縁体については、各種スペクトル解析(NMR、X線結晶解析)によって、その糖部立体配座が厳密にN型に固定化されていることを確認した。さらに、これら新規BNA類はアミダイト化した後、DNA合成機を用いオリゴヌクレオチドへ導入した。新規BNAを含むオリゴヌクレオチド類について、その三重鎖形成能をTm測定により評価したところ、三重鎖形成が困難であるとされている中性条件下においても、CG塩基対を極めて効果的に認識し、安定な三重鎖核酸を形成し得ることを見出した。本結果は今後のアンチジーン法の開発研究にとって非常に重要な意味を持つものである。

General に, triple lock の nucleic acid to form double lock は target DNA が ホ モ プ リ ン - ホ モ ピ リ ミ ジ ン match column の occasions に qualified さ れ, こ れ が ア ン チ ジ ー の ン method of generalization, be with the を big き く hinder げ て い る. Applicants ら は, こ れ ま で に ア ン チ ジ ー ン method に よ る DNA レ ベ ル で の posthumous son 伝 発 now suppression に to け た new し い nucleic acid class try body 2 '- O, 4' - C - methylene bridged nucleic acid (2 ', 4 '- BNA) の synthetic に successful し て い る. Today, back こ の BNA の target DNA に す seaborne る triple lock can form を に detailed review 価 し た と こ ろ, BNA が extremely め て high い triple lock can form を す る こ と, そ の triple lock form は match column specific で あ る こ と の tumblers deep い knowledge such as が must ら れ た. さ ら に, こ の BNA に new た な nucleic acid salt base を import し, こ れ ま で は extremely め て difficult と さ れ て き た CG salt base を seaborne Hoogsteen type water element combination に て understanding might か ど う か と い う point に つ い て beg を 検 into め た. Synthetic し た new rules BNA class try body に つ い て は, various ス ペ ク ト ル parsing (NMR, X-ray crystal analysis) に よ っ て, そ の sugar ministry stereo match a が 厳 dense に n-type に immobilized さ れ て い る こ と を confirm し た. さ ら に, こ れ ら new rules BNA class は ア ミ ダ イ ト change し た, DNA synthesis machine after を with い オ リ ゴ ヌ ク レ オ チ ド へ import し た. Contains new rules BNA を む オ リ ゴ ヌ ク レ オ チ ド class に つ い て, そ の triple lock forming can measure を Tm に よ り review 価 し た と こ ろ, triple lock forming が difficult で あ る と さ れ て い る neutral condition に お い て も, CG salt base を seaborne め て unseen fruit に know し, settle な triple lock nucleic acid を form し る こ と を shows し た. This result は future の ア ン チ ジ ー の open 発 ン method research に と っ て very important な に mean を hold つ も の で あ る.

项目成果

S. Obika, Y. Hari, T. Sugimoto, M. Sekiguchi and T. Imanishi: "Triplex-forming enhancement with high sequence selectivity by single 2'-O,4'-C-methylene bridged nucleic acid (2',4'-BNA) modification"Tetrahedron Lett.. 41-46. 8923-8927 (2000)

S. Obika、Y. Hari、T. Sugimoto、M. Sekiguchi 和 T. Imanishi：“通过单个 2-O,4-C-亚甲基桥接核酸 (2,4

S.Obika: "Triplex Formation by an Oligonucleotide Containing Conformationally Locked C-Nucleoside, 5-(2-O,4-C-Methylene-β-D-ribofuranosyl)oxazole"Tetrahedron Lett.. 41・2. 221-224 (2000)

S.Obika：“含有构象锁定 C 核苷的寡核苷酸形成三链体，5-(2-O,4-C-亚甲基-β-D-呋喃核糖基)恶唑”Tetrahedron Lett.. 41・2。 2000)

S.Obika: "Synthesis of Conformationally Locked C-Nucleosides Having a 2,5 Dioxabicyclo[2.2.1]heptane Ring System"Tetrahedron Lett.. 41・2. 215-219 (2000)

S. Obika：“具有 2,5 二氧杂双环[2.2.1]庚烷环系统的构象锁定 C-核苷的合成”Tetrahedron Lett.. 41・2 (2000)。

S. Obika, Y. Hari, M. Sekiguchi and T. Imanishi: "Synthesis and triplex-forming ability of conformationally, locked oligonucleotides containing unnatural nucleobases: Efficient recognition of a C-G interruption"Nucleic Acids Symp. Ser.. 44. 131-132 (2000)

S. Obika、Y. Hari、M. Sekiguchi 和 T. Imanishi：“包含非天然核碱基的构象锁定寡核苷酸的合成和三链体形成能力：C-G 中断的有效识别”核酸症状。