遺伝子ネットワーク解明に向けた高機能性人工デコイ核酸の開発

开发高功能人工诱饵核酸以阐明基因网络

• 批准号: 16011235
• 负责人: 今西 武
• 金额: $ 2.18万
• 依托单位: Osaka University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
• 财政年份: 2004
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2004 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/en/grant/KAKENHI-PROJECT-16011235/
• 关键词: 人工核酸; デコイ法; DNA; オリゴヌクレオチド; NF-KB; アポトーシス; 遺伝子発現制御

1.人工デコイ核酸の設計と合成について(1)2'4'-BNAに加えて、最近開発に成功した3'-amino-2'-deoxy-3',4'-BNAや2',4'-BNA^<coc>のデコイ核酸への導入を行なった。(2)NF-kBに対する人工デコイ核酸の従来の標的配列に加え新たに種々のデコイ分子配列を設計し、その合成にあたった。(今西)2.人工デコイ核酸の物性評価について人工デコイ核酸の安定性をTm測定により、各種転写因子との結合親和性をゲルシフトアッセイ等により詳細に評価した。(今西、土井)3.細胞系での人工デコイ核酸の機能評価について(1)培養細胞に対し人工デコイ核酸を導入し、細胞内における各種遺伝子の発現の様子を、ディファレンシャルディスプレイ法、リアルタイムPCR法及び発現タンパク質に対する蛍光標識抗体を用い詳細に解析した。(土井)(2)上記検討にて見い出した遺伝子群を対応するアンチセンス分子などにて発現抑制し、関連遺伝しの発現レベルを解析することで、遺伝子ネットワークの詳細を検討した。(土井)(3)得られた結果をもとに遺伝子ネットワークのモデルを構築しその検証を行なった。(土井)

1. Artificial デ コ イ の design と nucleic acid synthesis に つ い て (1), 2 ', 4 '- BNA に plus え て, recently 発 に successful し た 3' - amino - 2 '- deoxy - 3', 4 '- BNA や 2', 4 '- BNA ^ < coc > の デ コ イ nucleic acid へ の import line を な っ た. (2) the NF - kB に す seaborne る artificial デ コ イ nucleic acid の 従 の mark to match column に add new た え に kind 々 の デ コ イ ligands を design し, そ の synthetic に あ た っ た. (now west) 2. Artificial デ コ イ nucleic acid の property evaluation 価 に つ い て artificial デ コ イ determination of nucleic acid の stability を Tm に よ り, all kinds of planning write factor と の combined with affinity を ゲ ル シ フ ト ア ッ セ イ etc に よ り に detailed review 価 し た. (now west, doi) 3. The cell line で の artificial デ コ イ nucleic acid の function evaluation 価 に つ い て (1) cultured cells に し seaborne artificial デ コ イ nucleic acid を import し, intracellular に お け る various legacy 伝 son の 発 is の others を, デ ィ フ ァ レ ン シ ャ ル デ ィ ス プ レ イ method, リ ア ル タ イ ム PCR method and び 発 now タ ン パ ク qualitative に す seaborne る 蛍 logo antibody を with light Youdaoplaceholder0 detailed に analysis of た. (doi) (2) written 検 please に て see い out し た heritage 伝 subgroup を 応 seaborne す る ア ン チ セ ン ス molecular な ど に て 発 し, masato now even the heritage 伝 し の 発 now レ ベ ル を parsing す る こ と で, but 伝 ネ ッ ト ワ ー ク の detailed を beg し 検 た. (doi) (3) ら れ た results を も と に posthumous son 伝 ネ ッ ト ワ ー ク の モ デ ル を build し そ の 検 line card を な っ た. (Earthen well

项目成果

2',4'-BNA derivatives bearing an unnatural nucleobase: Synthesis and application to triplex-forming oligonucleotides

带有非天然核碱基的 2,4-BNA 衍生物：三链体形成寡核苷酸的合成和应用

• 发表时间: 2004
• 期刊: Nucleic Acids Symposium Series 48
• 作者: H.Inohara;S.Obika;T.Imanishi
• 通讯作者: T.Imanishi

Synthesis and properties of a novel bridged nucleic acid analogue bearing a P3'→N5' phosphoramidate linkage, 5'-amino-3',5'-BNA

带有 P3→N5 氨基磷酸酯键的新型桥接核酸类似物 5-氨基-3,5-BNA 的合成和性质

• 发表时间: 2004
• 期刊: Nucleic Acids Symposium Series No.48
• 作者: S.Obika et al.;M.Sekiguchi et al.;M.Sekiguchi et al.
• 通讯作者: M.Sekiguchi et al.

Synthesis and conformation of a novel bridged nucleic acid having a trans-fused 3,5,8-trioxabicyclo[5.3.0]decane structure

具有转融合3,5,8-三氧杂双环[5.3.0]癸烷结构的新型桥接核酸的合成和构象

• 发表时间: 2004
• 期刊: Tetrahedron Letters 45,24
• 作者: S.Obika;T.Osaki;M.Sekiguchi;R.Somjing;Y.Harada;T.Imanishi
• 通讯作者: T.Imanishi

Adjustment of the γ dihedral angle of an oligonucleotide P3'->N5' phosphoramidate enhances its binding affinity towards complementary

调整寡核苷酸 P3->N5 氨基磷酸酯的 γ 二面角可增强其与互补物的结合亲和力

• 期刊: Angew.Chem., Int.Ed.Engl. (in press)
• 作者: S.Obika;M.Sekiguchi;R.Somjing;T.Imanishi
• 通讯作者: T.Imanishi

Synergistic Stabilization of Triplex by Combination of Comb-type Cationic Copolymer and 2'4'-BNA

梳型阳离子共聚物与 24-BNA 组合对三链体的协同稳定

• 发表时间: 2004
• 期刊: Nucleic Acids Symp.Ser. 48
• 作者: Katayama;T.;Maruyama;A.;Obika;S.;Imanishi;T.;Torigoe;H.
• 通讯作者: H.