多色蛍光標識プライマーを用いたSTR多座位同時増幅分析法による日本人起源の探究

使用多色荧光标记引物进行 STR 多位点同步扩增分析探索日本起源

• 批准号: 12012204
• 负责人: 山本 敏充
• 金额: $ 0.96万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12012204/
• 关键词: STR; Multiplex PCR; Capillary electrophoresis; 集団遺伝学; 日本人の起源; 蛍光標識プライマー

法医学の分野では、DNAによる個人識別や親子鑑定などのため、STR(Short Tandem Repeat)領域が最も汎用されている。これらを分析するために、多色蛍光標識プライマーを用いたMultiplex-PCR法を利用して開発されたキット(AmpFlSTR Profiler plus kitとCofiler kit)を用いて、13のローカス(D3S1358,vWA,FGA,TH01,TPOX,CSF1PO,D18S51,D21S11,D8S1179,D16S539,D5S818,D13S317,D7S820)が簡便に増幅・タイピングできる。この2つのキットを利用して計13STRローカスのアレル頻度を中国人5集団(陜西省108名、江蘇省119名、福建省116名、湖南省105名、広東省111名)及びタイ人(バンコク市183名)で算出した。昨年度までに各ローカスのアレル頻度を算出した日本人2集団(本土及び琉球)、韓国人(ソウル市)、中国人(北京市近郊)、ミャンマー人(ヤンゴン市)を含めた計11集団で、アレル頻度が比較的安定するといわれている100以上のサンプル数を用いて、計1493サンプルをタイピングした。この13ローカスのSTRのアレル頻度分布から遺伝距離DAを算出し、近隣結合法により系統樹を作成した。本土日本人と沖縄日本人で1つ、中国の北中部である北京市近郊、陜西省と江蘇省の集団で1つ、中国の南部である福建省、湖南省と広東省の集団で1つ、ビルマ人とタイ人で1つの同じクラスターを形成し、そのtopologyは現在の地理的分布をよく反映していた。

Forensic medicine is divided into three fields: DNA identification, paternity test, STR(Short Tandem Repeat). Multiplex-PCR was developed using AmpFlSTR Profiler plus kit and Cofiler kit (D3S1358,vWA,FGA, TH01,TPOX,CSF1PO,D18S51,D21S11,D8S1179,D16S539,D5S818,D13S317, D7S 820). The STR was calculated using a total of 13STR frequencies from 5 groups of China people (108 in Shaanxi Province, 119 in Jiangsu Province, 116 in Fujian Province, 105 in Hunan Province, 111 in Guangdong Province) and 183 in Kuoke City. In the past year, the frequency of loss of each category was calculated. Japanese 2 groups (local and Ryukyu), Korean (Seoul City), China (suburbs of Beijing City), and Japanese (Seoul City) included 11 groups, and the frequency of loss was compared. The distribution of STR frequencies in the 13-channel system is calculated by using the nearest neighbor association method. The native Japanese people are the same as the Japanese people in the suburbs of Beijing, Shaanxi Province, Jiangsu Province, Fujian Province, Hunan Province, and East China Province. The topology reflects the geographical distribution of the present.

项目成果

T.Yoshimoto: "A new triplex STR system without irregular alleles by silver staining and its potential application to forensic analvsis."J.Forensic Sci.. 46(in press). (2001)

T.Yoshimoto：“一种通过银染色去除不规则等位基因的新三链 STR 系统及其在法医分析中的潜在应用。”J.Forensic Sc​​i.. 46（印刷中）。

M.Tanaka: "Usefulness of a toothbrush as a source of evidential DNA for typing."J.Forensic Sci.. 45(3). 674-676 (2000)

M.Tanaka：“牙刷作为打字证据 DNA 来源的有用性。”J.Forensic Sc​​i. 45(3)。

T.Yamamoto: "The application of minisatellite variant repeat mapping by PCR (MVR-PCR) in a paternity case showing false exclusion due to STR mutation."J.Forensic Sci.. 46(in press). (2001)

T.Yamamoto：“通过 PCR (MVR-PCR) 进行小卫星变异重复定位在亲子鉴定案例中的应用，显示由于 STR 突变导致的错误排除。”J.Forensic Sc​​i.. 46（印刷中）。