多色蛍光標識プライマーを用いたSTR多座位同時増幅分析法による日本人起源の探究

使用多色荧光标记引物进行 STR 多位点同步扩增分析探索日本起源

• 批准号: 11112207
• 负责人: 山本 敏充
• 金额: $ 0.77万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 1999
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1999 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-11112207/
• 关键词: STR; Multiplex PCR; Capillary electrophoresis; 集団遺伝学; 日本人の起源; 蛍光標識プライマー

ヒトゲノムDNAの中で、STR(Short Tandem Repeat)領域は法医学の分野で個人識別や親子鑑定に最も汎用されている。多色蛍光標識プライマーを用いたMultiplex-PCR法を利用して、このSTRを分析するために開発されたAmpFlSTR Profiler plus及びCofilerキットを用いて、計13STRローカス(D3S1358,vWA,FGA,D18S51,D21S11,D8S1179,D5S818,D13S317,D7S820,D16S539,TH01,TPOX,CSF1PO)を同時増幅・タイピングすることにより、207名の日本人血液DNA試料からデータベースを作成し、各ローカスについてのアリル頻度を算定した。このアリル頻度分布はハーディ・ワインベルグ平衡に一致しており、各ローカスのヘテロ接合度は、0.67〜0.85と日本人においても非常に高い個人識別能力を有していることがわかった。この研究成果は、第18回国際法医血液遺伝学会で発表された。また、日本の近縁集団である琉球人194名、中国人(北京近郊)118名、韓国人110名、ビルマ人122名からも同様にアリル頻度を算出した。この頻度分布から種々の遺伝的距離を算出する計算方法を用いて、これらのヒト集団の系統樹を作成したが、その近縁性についてはっきりした結論は得られなかった。この研究成果の一部は、「日本人の起源」に関する国際シンポジウムで発表された。現在、この方法で、日本近縁ヒト集団のアリル頻度を調べるとともに、より正確な系統樹を得るために、連鎖解析用の蛍光標識プライマーセット(168ローカス)の中から、100ローカスほど選び、東南アジアや中国各地のDNAについて比較解析し、遺伝的近縁性を調べている。

The field of DNA and STR(Short Tandem Repeat) is the most widely used field in forensic medicine, including personal identification and paternity testing. Multiplex-PCR is used to detect and analyze the STR profiles of AmpFlSTR Profiler plus and Cofilter.(D3S1358,vWA,FGA,D18S51,D21S11,D8S1179,D5S818,D13S317, D7S 820,D16S539, TH01,TPOX,CSF1PO). The frequency distribution of this phenomenon is consistent with that of the Japanese. The degree of cohesion of each phenomenon is 0.67 ~ 0.85. The Japanese have a very high personal identification ability. The results of this research are the 18th International Society for Forensic Hematology. 194 Ryukyans, 118 China (Beijing suburbs), 110 Koreans, 122 Japanese The method of calculating the distance between the frequency distribution and the genetic diversity is used to construct the phylogenetic tree of the genetic diversity. One part of the research results is related to the international research on the origin of Japanese people. Now, this method is used to adjust the frequency of DNA loss in Japan's recent population, to obtain the correct phylogenetic tree, to adjust the genetic linkage of light markers (168), to select 100 genes, to compare and analyze DNA loss in Southeast China, and to adjust the proximity of genes.

项目成果

T. Kojima: "Tetrameric short tandem repeat(STR) system D15S233(wg1d1) : Sequencing and frequency data in the Japanese and Chinese populations"Legal Medicine. 1(3). 119-126 (1999)

T. Kojima：“四聚体短串联重复序列 (STR) 系统 D15S233(wg1d1)：日本和中国人群的测序和频率数据”法律医学。

M. Mizutani: "Evaluation of two new STR loci 9q2h2 and wg3f12 in a Japanese population"Legal Medicine. 1(1). 25-28 (1999)

M. Mizutani：“日本人群中两个新 STR 位点 9q2h2 和 wg3f12 的评估”法律医学。