多色蛍光標識プライマーを用いたSTR多座位同時増幅分析法による日本人起源の探究

使用多色荧光标记引物进行 STR 多位点同步扩增分析探索日本起源

• 批准号: 10115207
• 负责人: 山本 敏充
• 金额: $ 0.96万
• 依托单位: Nagoya University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
• 财政年份: 1998
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 1998 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-10115207/
• 关键词: STR; Multiplex PCR; Capillary electrophoresis; 集団遺伝学; 日本人の起源; 蛍光標識プライマー

法医学の分野で個人識別や親子鑑定に最も汎用されているSTR(Short Tandem Repeat)領域を分析するために開発されたキットであり、多色蛍光標識プライマーを用いたMultiplex-PCR法を利用して9つのローカス(D3S1358,vWA,FGA,TH01,TPOX,CSFIPO,D5S818,D13S317,D7S820)を一度に増幅・タイピングするAmpFISTR Profiler kitにより、206名の日本人血液DNA試料からデータベースの作成し、各ローカスについてのアリル頻度を算定した。このアリル頻度分布はハーディ・ワインベルグ平衡に一致しており、各ローカスのへテロ接合度は、それぞれ0.67、0.77、0.82、0.61、0.58、0.73、0.78、0.81、0.74と日本人においても非常に高い個人識別能力を有していることがわかった。この研究成果はJ.Forensic Sci.に掲載された。同様のキットであるAmpFlSTR Profiler plus kitとCofiler kitをを組み合わせて使用することにより、前述の9ローカスの他に4ローカス(D18S51,D21S11,D8S1179,D16S539)、計13STRローカスのアリル頻度を日本人207名、中国人(北京近郊)118名、ビルマ人122名から算出した。また、種々の遺伝的距離を算出する計算方法を用いて日本人と中国人とビルマ人の間の距離を計算したが、近縁性についてはっきりした結論は得られなかった。現在、連鎖解析用の蛍光標識プライマーセット(約170ローカス)の各ローカスの日本人アリル頻度をほぼ算定し終えたので、これらのローカスの中から、100ローカスほど選び、東南アジアや中国各地のDNAと日本人DNAを比較解析し、遺伝的近縁性を調べている。

Forensic science division で personal identification や paternity test に most <s:1> general application されて るSTR(Short Tandem Repeat) を analysis す る た め に open 発 さ れ た キ ッ ト で あ り, multicolor 蛍 light logo プ ラ イ マ ー を with い た Multiplex PCR method を using し て 9 つ の ロ ー カ ス (D3S1358, vWA FGA, TH01, TPOX, CSFIPO, D5S818 and D13S317, D 7 s820) を に once raised, picture タ イ ピ ン グ す る AmpFISTR Profiler kit に よ り, 206 の Japanese blood DNA sample か ら デ ー タ ベ ー ス の し, consummate the ロ ー カ ス に つ い て の ア リ ル frequency を consider し た. こ の ア リ ル frequency distribution は ハ ー デ ィ · ワ イ ン ベ ル グ balance に consistent し て お り, various ロ ー カ ス の へ テ ロ は, joint degrees そ れ ぞ れ 0.67, 0.77, 0.82, 0.61, 0.58, 0.73, 0.78, 0.81, 0.74, と Japanese に お い て も に を い personal recognition capability has very high し て い る こ Youdaoplaceholder0 った. The research results of に are published in j. forensic Sci. Youdaoplaceholder0. Youdaoplaceholder1. The same is true for キットであるAmpFlSTR Profiler plus kitとCofiler Kit を を group み close わ せ て use す る こ と に よ り aforesaid の. 9 ロ ー カ ス の he に 4 ロ ー カ ス (D18S51 D21S11, D8S1179, D16S539), 13 STR ロ ー カ ス の ア リ ル frequency を 207 Japanese, Chinese (near Beijing), 118, ビ ル マ people 122 か ら figured out Youdaoplaceholder0 た. ま た, kind of 々 の heritage 伝 distance を calculate す を る calculation method with い て Japanese と Chinese と ビ ル マ の distance between people の を computing し た が, nearly try に つ い て は っ き り し た conclusion は must ら れ な か っ た. Now, chain analytic use の 蛍 light logo プ ラ イ マ ー セ ッ ト (about 170 ロ ー カ ス) の each ロ ー カ ス の Japanese ア リ ル frequency を ほ ぼ consider し eventually え た の で, こ れ ら の ロ ー カ ス の in か ら, 100 ロ ー カ ス ほ ど び, southeast ア ジ ア や across China の DNA と Japanese DNA を comparative analytic し, but 伝 nearly try を べ Youdaoplaceholder0 て る.