多色蛍光標識プライマーを用いたSTR多座位同時増幅分析法による日本人起源の探究

使用多色荧光标记引物进行 STR 多位点同步扩增分析探索日本起源

基本信息

批准号：
10115207
负责人：
山本敏充
金额：
$ 0.96万
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (A)
财政年份：
1998
资助国家：
日本
起止时间：
1998 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

法医学の分野で個人識別や親子鑑定に最も汎用されているSTR(Short Tandem Repeat)領域を分析するために開発されたキットであり、多色蛍光標識プライマーを用いたMultiplex-PCR法を利用して9つのローカス(D3S1358,vWA,FGA,TH01,TPOX,CSFIPO,D5S818,D13S317,D7S820)を一度に増幅・タイピングするAmpFISTR Profiler kitにより、206名の日本人血液DNA試料からデータベースの作成し、各ローカスについてのアリル頻度を算定した。このアリル頻度分布はハーディ・ワインベルグ平衡に一致しており、各ローカスのへテロ接合度は、それぞれ0.67、0.77、0.82、0.61、0.58、0.73、0.78、0.81、0.74と日本人においても非常に高い個人識別能力を有していることがわかった。この研究成果はJ.Forensic Sci.に掲載された。同様のキットであるAmpFlSTR Profiler plus kitとCofiler kitをを組み合わせて使用することにより、前述の9ローカスの他に4ローカス(D18S51,D21S11,D8S1179,D16S539)、計13STRローカスのアリル頻度を日本人207名、中国人(北京近郊)118名、ビルマ人122名から算出した。また、種々の遺伝的距離を算出する計算方法を用いて日本人と中国人とビルマ人の間の距離を計算したが、近縁性についてはっきりした結論は得られなかった。現在、連鎖解析用の蛍光標識プライマーセット(約170ローカス)の各ローカスの日本人アリル頻度をほぼ算定し終えたので、これらのローカスの中から、100ローカスほど選び、東南アジアや中国各地のDNAと日本人DNAを比較解析し、遺伝的近縁性を調べている。

从206个日本血液DNA样本中创建了一个数据库，每个基因座的等位基因频率均使用AmpFistrioler Kit进行计算，该试剂盒使用多色荧光标记的引物使用多重PCR方法来放大并键入九个座位（D3S1358，FGA，FGA，TPGA，TPPOX，TPOX，CSFIPOX，D5S，D5S，D5S，D5S，D5S，D5S，D5S，D5S，D5S，d5s， D7S820）一次计算每个基因座的等位基因频率。该等位基因频率分布与强烈的Weinberg平衡是一致的，并且发现每个基因座的杂合子性为0.67、0.77、0.82、0.61、0.58、0.73、0.73、0.78、0.81和0.74，甚至还发现日本人具有很高的个人识别能力。这项研究发现发表在J.Forensic Sci中。通过使用类似套件的组合，AMPFLSTR Profiler Plus Kit和Cofiler Kit，除了上述9个位置，以及4个位置的等位基因频率（D18S51，D21S1111，D8S11179，D16S539），总计13个STR的位置，还计算了207个日本人，近122个burm and jij burm and jij burn and jij and jij and jij and jij and jij and jij。此外，尽管使用各种计算遗传距离的方法计算了日本，中国人和缅甸人之间的距离，但就其亲密关系而言，没有明确的结论得出明确的结论。目前，我们已经大致计算了用于连锁分析的荧光标记的引物集（约170个位置）的每个位点的日本等位基因的频率，因此我们从这些位置选择了约100个位置，并从东南亚和中国进行了相对分析的DNA来检查遗传。