チンパンジーゲノムに関する連携的研究のための基盤整備

黑猩猩基因组合作研究的基础设施开发

• 批准号: 12202013
• 负责人: 平井 百樹
• 金额: --
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12202013/
• 关键词: チンパンジー; 比較ゲノム; 染色体; 遺伝子; cDNAライブラリー

ヒトの全ゲノムの塩基配列概要が公表されたことにより、最も近縁のチンパンジーのゲノムとの比較研究が、ヒトの生物学的特性や進化を探るために、いよいよ具体的に推進されるべき時期にきた。私どもは、今後のチンパンジー・ゲノム科学推進のための基盤を構築することをこの1年間の目的とした。具体的には、国内での連携的研究のため方策の検討と、遺伝子ならびに染色体に関するヒトとの比較データの蓄積の2項目に重点を置いて研究した。1.国内で研究用のチンパンジーを保有する施設との協力体制を確立し、研究試料採取ならびに管理についての指針を検討すした。2.進化における染色体再配列部位の解析のモデルとして、チンパンジー型2染色体の直列融合により生じたヒト2番染色体q13領域の詳細な解析を行った。3.三和化学研究所熊本霊長類センター(肥田宗友)、東大医科学研究所菅野研究室ならびに感染症研究所遺伝子資源室(橋本雄之室長)との共同で、オリゴキャッピング法を用いてチンパンジーの皮膚組織より完全長を高率に含むcDNAライブラリーを作製した。ランダムに単離した約1850クローンについて、5'末端側からワンパスシークエンスを行い、ESTs(expressed sequence tags)を得た。そしてクラスタリングならびにホモロジー検索を行ない解析した。これらのデータベースは、2001年4月より公開予定である。ヒトと相同の遺伝子についてNCBI ntデータ(ヒト)に対して比較した結果、ホモロジーはUTRで98.6%、CDRで99.4%であった。mRNAの構造の種差が示唆されるものについては全長シークエンシングを行い、ギャップや組換えを検出した。新規遺伝子のESTsと考えられるクローンも見い出したので、全長cDNAの解析を進めている。これらの遺伝子の機能解析を進めることにより、両種間の違いが解明できることを期待している。

A summary of the basic arrangements of the two species is presented in this paper. A comparative study of the biological characteristics and evolution of the species is carried out. The purpose of the project is to promote the scientific development of the project in the future The specific research on the linkage between China and other countries focuses on the research of two items: the research on the strategy, the research on the gene, the research on the relationship between the chromosome and the accumulation of the comparative data. 1. To establish a cooperative system for research and development, and to examine the guidelines for research and development sample adoption and management 2. Analysis of chromosome rearrangement site in evolution and analysis of chromosome q13 domain in detail 3. Miwa Institute of Chemical Sciences Kumamoto long class (Mitada Munetomo), Kanno Research Institute of Infectious Diseases, National Institute of Medical Sciences, Tokyo University (Hashimoto Yukio) and the joint use of the method of skin tissue complete length, high rate, including cDNA translation. From the top to the bottom, about 1850 minutes, 5'-end, ESTs(expressed sequence tags) were obtained. All right, so let's get this over with. April, 2001. Compared with the results of NCBI nt analysis, UTR was 98.6% and CDR was 99.4%. The structure of mRNA is expressed in different ways, such as in full length, in combination with in combination. New cDNA ESTs and Analysis of Full-length cDNA The analysis of the function of the gene is advanced, and the difference between species is explained.

项目成果

肥田宗友: "霊長類の完全長cDNAライブラリーの作製と解析"霊長類研究. 16. 95-110 (2000)

Munetomo Hida：“全长灵长类 cDNA 文库的制备和分析”灵长类研究 16. 95-110 (2000)。

Kasai, F.: "Comparative FISH mapping of ancestral fusion point of human chromosome 2"Chromosome Research. 8. 727-735 (2000)

Kasai, F.：“人类 2 号染色体祖先融合点的 FISH 比较图谱”染色体研究。

数藤由美子: "ヒトと類人猿の染色体レベルの違い"蛋白質 核酸 酵素. 45(16). 30-37 (2000)

Yumiko Kazuto：“人类和类人猿之间染色体水平的差异”蛋白质核酸酶 45(16)。