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ヒトゲノムにおけるMINK/CHRNEエクソンオーバーラッピングの進化的研究

人类基因组中 MINK/CHRNE 外显子重叠的进化研究

基本信息

批准号：
12202020
负责人：
楠見明弘
金额：
--
依托单位：
Nagoya University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2000
资助国家：
日本
起止时间：
2000 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

我々は、近年、MAPキナーゼ経路の上流で働く新規キナーゼ、MINKをクローン化した。これをヒトゲノム上でマッピングしたところ、第17染色体上でアセチルコリン受容体εサブユニット(AChRε)をコードするCHRNE遺伝子座と表裏でオーバーラップしていた。明確な機能を持つ蛋白質をコードする遺伝子が、エクソン同士でオーバーラップするという例は、哺乳類ゲノムでは極めて稀である。一方、様々な種のゲノムで調べた結果、MINK/CHRNE遺伝子座のオーバーラップは霊長類への進化以降に起こった出来事であることがわかった。オーバーラップの形成過程を調べるために、我々は様々な哺乳類ゲノムにおけるMINK/CHRNE遺伝子座領域の構造を比較検討した。結果、ラビット、鯨、牛、羊、鹿、新世界ザル、ヒト上科ゲノムなど数多くの哺乳類においてエクソンオーバーラッピングが起こっていた。しかし、マウス、犬、馬、豚、原猿、旧世界ザルゲノムではオーバーラップしていなかった。この結果は、このオーバーラップの原因ははAChRε遺伝子のポリA付加シグナル崩壊による3'UTRの伸長であること、哺乳類進化の過程で少なくとも5系統(そのうち2系統が霊長類進化過程)で、独立にオーバーラップが起こっていることを示している。

I 々は, in recent years, MAPキナーゼ経路の上で働く新码キナーゼ, MINKをクローン化した.これをヒトゲノム上でマッピングしたところ、でアセチルコリンReceiver εサブ on chromosome 17ユニット (AChRε) をコードするCHRNE 伝子曰でオーバーラップしていた. Clarify the function of the protein and maintain itーバーラップするという Example は, mammal ゲノムでは extremely めて thin である. One side, 様々なkind of のゲノムで tune べた results, MINK/CHRNE 伝子杝のオThe ーバーラップは霊length type への evolves and the にrise こった comes out であることがわかった.オーバーラップの Formation process を Adjustment べるために、我々は様々な Mammal type ゲノムにおけるMINK/CHRNE 伝子杝 Area の Structure を検椘した. Result, ラビット, whale, cow, sheep, deer, new world ザル, ヒト上科ゲノムなどThe number of mammals is very high.しかし, マウス, dog, horse, dolphin, original ape, old world ザルゲノムではオーバーラップしていなかった.このRESULTは、このオーバーラップのREASONははAChRε伝子のポリA Pay plus シグナル壊による3'UTRのStretching であること, Breastfeeding The process of evolution of the class is でなくとも5 system (そのうち2 system and the class is long) Cheng) で, independent にオーバーラップが出こっていることをshow している.