多因子疾患発現機構解明のための混合遺伝モデルによる複数QTL解析法の開発
使用混合遗传模型开发多QTL分析方法以阐明多因素疾病表达机制
基本信息
- 批准号:13204044
- 负责人:
- 金额:$ 3.2万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
- 财政年份:2001
- 资助国家:日本
- 起止时间:2001 至 无数据
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
1)シミュレーション実験の中で、F2の個体数、QTL分散の大きさおよびQTLの組み合わせを変化させてデータを発生し、解析を行った。その結果、F2個体が1,000頭の場合、主効果に関しては2〜3%以上、エピスタシス効果については、4%以上の寄与のある効果の検出が可能であり、F2個体が200頭の場合でも、主効果に関して10%以上、エピスタシス効果に関して15〜20%以上の寄与の効果を検出できることが分かった。また、近交系間F2ラットのデータを分析した結果、インターバルマッピング法で検出されなかったQTLおよびQTL間のエピスタシスが検出され、MC-IM法の有効性が示された。2)ポリジーン効果ならびに環境効果を取り上げた混合遺伝モデルによる多因子疾患発現機構解明のための新たなQTL解析法の開発に対して、Metropolis-Hastings(MH)アルゴリズムおよびリバーシブルジャンプマルコフ連鎖モンテカルロ(RJMCMC)を用いたベイズ推定法に基づく手法を開発した。この方法により、想定したQTLの数、また各々のもつ効果の大きさ、染色体上の位置がいずれも偏りなく推定可能であることがシミュレーション実験によって示された。また、ポリジーン分散および環境分散についてもほぼ真値通りの結果が得られた。
1) the number of F2 individuals, the number of F2 individuals, and the number of QTL distributors in the system, the number of F2 individuals, the number of F2 The results showed that the results of F2, F2, The results of F2, inbred lines, F2, inbred lines, and inbred lines. 2) based on the results of the environmental study, the multi-factor disease detection system was established. The new QTL analysis method, Metropolis-Hastings (MH), is used to analyze the health problems. The RJMCMC method is based on the presumption method. The method, the number of QTL, the number of errors, the location of the chromosome, the deviation of the chromosome, the presumption that it is possible, the number of errors, the number of data, the location of the chromosome, the location of the chromosome, the bias of the chromosome, the presumption of the possibility, the location of the chromosome, the deviation of the chromosome, and the presumption that it is possible to show that it is possible. The results showed that the results of the experiment were satisfactory.
项目成果
期刊论文数量(7)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Tanomura, H.: "Detection of a quantitative trait locus for intramuscular fat accumulation using the OLETF rat"J. Vet. Med. Sci.. (in press).
Tanomura, H.:“使用 OLETF 大鼠检测肌内脂肪积累的数量性状位点”J.
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Umezu, Y.: "Detection of rat model useful for genetic analysis of intramuscular fat accumulation"J. Anim. Genet.. 29. 3-10 (2001)
Umezu, Y.:“检测可用于肌内脂肪积累遗传分析的大鼠模型”J.
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
動物遺伝育種シンポジウム組織委員会(編集): "動物遺伝育種学事典"株式会社 朝倉書店. 636 (2001)
动物遗传育种研讨会组委会(主编):《动物遗传育种百科全书》朝仓书店636(2001)
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Taniguchi, Y.: "Analysis of expressed sequence tags from a cDNA library of somatic nuclear transfer-derived cloned bovine whole fetus"Anim. Genet.. 32. 1-6 (2001)
Taniguchi, Y.:“体细胞核移植衍生的克隆牛完整胎儿 cDNA 文库中表达序列标签的分析”Anim。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Minoshima, Y.: "Molecular cloning, expression analysis, promoter characterization, and chromosomal localization of the bovine PREF1 gene"Anim. Genet.. 32. 333-339 (2001)
Minoshima, Y.:“牛 PREF1 基因的分子克隆、表达分析、启动子表征和染色体定位”Anim。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ journalArticles.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ monograph.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ sciAawards.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ conferencePapers.updateTime }}
{{ item.title }}
- 作者:
{{ item.author }}
数据更新时间:{{ patent.updateTime }}
佐々木 義之其他文献
佐々木 義之的其他文献
{{
item.title }}
{{ item.translation_title }}
- DOI:
{{ item.doi }} - 发表时间:
{{ item.publish_year }} - 期刊:
- 影响因子:{{ item.factor }}
- 作者:
{{ item.authors }} - 通讯作者:
{{ item.author }}
{{ truncateString('佐々木 義之', 18)}}的其他基金
家畜モデル動物を用いた量的経済形質原因遺伝子同定のためのゲノムシフト戦略の確立
建立基因组转移策略,利用家畜模型动物鉴定负责数量经济性状的基因
- 批准号:
14656114 - 财政年份:2002
- 资助金额:
$ 3.2万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
動物体内における脂肪分布の制御に関与する遺伝子群の解明
阐明参与控制动物体内脂肪分布的基因
- 批准号:
12876067 - 财政年份:2000
- 资助金额:
$ 3.2万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Exploratory Research
多因子疾患発現機構解明のための混合遺伝モデルによる複数QTL解析法の開発
使用混合遗传模型开发多QTL分析方法以阐明多因素疾病表达机制
- 批准号:
12204064 - 财政年份:2000
- 资助金额:
$ 3.2万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
画像解析情報により推定した肉牛の枝肉構成に関する遺伝性
使用图像分析信息估计肉牛胴体成分的遗传力
- 批准号:
96F00314 - 财政年份:1998
- 资助金额:
$ 3.2万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
有用動物資源の創出と保存
有用动物资源的创造和保护
- 批准号:
10896009 - 财政年份:1998
- 资助金额:
$ 3.2万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
コンピューターシミュレーションによる種雄牛評価法の最適化に関するシステム論的研究
利用计算机模拟优化公牛评价方法的系统研究
- 批准号:
58560265 - 财政年份:1983
- 资助金额:
$ 3.2万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for General Scientific Research (C)
肉用種種雄牛の現場後代検定システム確立に関する研究
肉牛种公牛现场后代检测系统的建立研究
- 批准号:
56860015 - 财政年份:1981
- 资助金额:
$ 3.2万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Developmental Scientific Research
コルチゾールあるいはコルチコステロンの注射が血液中酸好性白血球数および血清蛋白成分に及ぼす影響
注射皮质醇或皮质酮对血液嗜酸性白细胞计数和血清蛋白成分的影响
- 批准号:
X46210------6186 - 财政年份:1971
- 资助金额:
$ 3.2万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Encouragement of Young Scientists (A)
相似国自然基金
地被菊花期性状QTL精细定位与候选基因挖掘
- 批准号:2025JJ60184
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
基于QTL定位和多组学分析挖掘调控莲藕粉脆质地关键基因
- 批准号:JCZRQN202501129
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
水稻耐寒QTL基因OsCTS11的克隆与分子机制解析
- 批准号:QN25C130017
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
玉米籽粒蛋白质含量主效QTL-qTPC1的克隆、功能分析及其育种价值研究
- 批准号:2025JJ50165
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
低镉QTL-qCd2.2的遗传解析及其互斥连锁簇改造
- 批准号:2025JJ60174
- 批准年份:2025
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
水稻幼苗期耐盐主效 QTL qSR12 的功能分析
与耐盐机理研究
- 批准号:Q24C060008
- 批准年份:2024
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
控制甘蓝型油菜叶原基间隔的主效QTL qPlastochron.A02图位克隆及功能验证
- 批准号:
- 批准年份:2024
- 资助金额:30 万元
- 项目类别:青年科学基金项目
棉花陆海渐渗系纤维长度稳定QTL qGbFL-A09-1的精细定位及候选
基因鉴定
- 批准号:
- 批准年份:2024
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
猪12号染色体影响初生重主效QTL的分子遗传机理解析
- 批准号:
- 批准年份:2024
- 资助金额:15.0 万元
- 项目类别:省市级项目
普通小麦苗期抗寒QTL qCRSS-7D的精细定位及候选基因分析
- 批准号:
- 批准年份:2024
- 资助金额:0.0 万元
- 项目类别:省市级项目
相似海外基金
トウガラシ種なし交雑集団から見出した新規の果実大型化QTLの実体解明
阐明辣椒无籽杂交群体中果实大小的新 QTL
- 批准号:
24K08894 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.2万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
ミカン亜科植物由来天然物のQTL/GWAS解析による生合成因子解明と生理活性評価
通过芸香科植物天然产物的QTL/GWAS分析阐明生物合成因子并评价生理活性
- 批准号:
24K01750 - 财政年份:2024
- 资助金额:
$ 3.2万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
アンバランスなデータにおける環境変動を考慮したQTL検出法の開発
不平衡数据中考虑环境变化的QTL检测方法开发
- 批准号:
23K05178 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 3.2万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Development of the evaluation method for the field resistance to Citrus melanose using AI technology and identification the QTL region related to the resistance.
利用人工智能技术开发柑橘黑素糖田间抗性评价方法并鉴定与抗性相关的QTL区域。
- 批准号:
23K05217 - 财政年份:2023
- 资助金额:
$ 3.2万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
新規ゲノムワイドQTL解析手法による免疫障害性疾患の病態解明および治療法の創出
使用新型全基因组 QTL 分析方法阐明免疫性疾病的病理学并创建治疗方法
- 批准号:
22K16356 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 3.2万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Early-Career Scientists
Tracing the origin of morphological change in tooth class during human evolution ~ QTL analysis with Suncus murinus ~
追踪人类进化过程中齿类形态变化的起源〜用Suncus murinus进行QTL分析〜
- 批准号:
22K06416 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 3.2万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
RESEARCH-PGR: QTL Analyses Identify Genetic Components Regulating the Interactions between Plants, Pathogens and the Environment in the Face of Climate Change
研究-PGR:QTL 分析识别在气候变化下调节植物、病原体和环境之间相互作用的遗传成分
- 批准号:
2210293 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 3.2万 - 项目类别:
Standard Grant
Identification de QTL influençant la floraison chez le fraisier (Fragaria ananassa) à jours courts
影响草莓 (Fragaria ananassa) 开花的 QTL 鉴定
- 批准号:
576705-2022 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 3.2万 - 项目类别:
Alexander Graham Bell Canada Graduate Scholarships - Master's
ダイズの着生根粒菌種を制御するQTLの同定と農業形質への影響
控制大豆附生根瘤菌种类的QTL鉴定及其对农艺性状的影响
- 批准号:
22K05571 - 财政年份:2022
- 资助金额:
$ 3.2万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
Mathematical Modeling to Evaluate Environmental Responsiveness of multiple QTL for flowering time Using Dual-NAM Population
使用双 NAM 群体评估多个 QTL 对开花时间的环境响应性的数学模型
- 批准号:
21K05522 - 财政年份:2021
- 资助金额:
$ 3.2万 - 项目类别:
Grant-in-Aid for Scientific Research (C)