ゲノムDNA CpG islandのグローバルメチレーションの解析

基因组 DNA CpG 岛的整体甲基化分析

• 批准号: 13204032
• 负责人: 藤原 浩
• 金额: $ 2.11万
• 依托单位: Niigata University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13204032/
• 关键词: DNA; メチレーション; cytosine extension assay; 全身性エリテマトーデス; 円板状エリテマトーデス; 悪性黒色腫; 皮膚筋炎; 強皮症

遺伝子変異によらない遺伝子発現制御(ebigenetics)として、近年、DNAのメチル化による転写抑制が重要視されてきている。筆者は、12年度特定領域(C)研究でアイソトープを用いない、ゲノムDNA全体のCpG island特異的なメチレーションの定量法、non-isotopic cytosine extension assayを確立し、genome DNAが10ナノグラム以下でも濃縮操作により解析可能なレベルにまで改良した。また、代表的な自己免疫性疾患である全身性エリテマトーデス(SLE)の末梢血リンパ球ゲノムDNAでは、コントロール、円板状エリテマトーデスに比べ、CpG island methylationが亢進してると考えられ、SLEのリンパ球機能異常の病態の解明にせまる可能性があると考えられた。今年度は末梢血リンパ球の表面マーカー別に解析したところ、SLEでは、主にメチレーションに異常のあるのはCD19+のBリンパ球であることがわかった。他の膠原病、強皮症、皮膚筋炎についても解析したが、末梢血リンパ球ゲノムDNAのCpG island methylationの異常は見られなかった。正常人末梢血リンパ球と皮膚細胞ではグローバルメチレーションに大きな差があることがわかった。ケラチノサイトとメラノサイトでは差がなかった。悪性黒色腫ではnon-CpG island hypomethylationがおきていることが示唆された。

Heritage 伝 sub - different に よ ら な い heritage 伝 son 発 now suppression (ebigenetics) と し て, in recent years, DNA の メ チ ル change に よ る planning write inhibit が important visual さ れ て き て い る. The author は, 12 (C) the specific areas で ア イ ソ ト ー プ を with い な い, ゲ ノ ム DNA all の CpG island specific な メ チ レ ー シ ョ ン の quantitative method, the non - isotopic cytosine extension assay を establish し, genome DNAが10ナノグラム the following で <s:1> concentration operation によ analysis may なレベ にまで にまで improve た. ま た な oneself immunity disease, representatives で あ る systemic エ リ テ マ ト ー デ ス リ の peripheral blood (SLE) ン パ ball ゲ ノ ム DNA で は, コ ン ト ロ ー ル, has drifted back towards &yen; tabular エ リ テ マ ト ー デ ス に than べ, CpG island Methylation が hyperthyroidism し て る と exam え ら れ, SLE の リ ン パ ball parafunction の pathological の interpret に せ ま る possibility が あ る と exam え ら れ た. Our リ は peripheral blood ン パ の ball surface マ ー カ ー don't に parsing し た と こ ろ, SLE で は, main に メ チ レ ー シ ョ ン に abnormal の あ る の は CD19 + B の リ ン パ ball で あ る こ と が わ か っ た. His strong の collagen disease, skin disease, skin and muscle inflammation に つ い て も parsing し た リ が, peripheral blood ン パ ball ゲ ノ ム の DNA CpG island methylation の abnormal は see ら れ な か っ た. Normal peripheral blood リ ン パ ball と skin cells で は グ ロ ー バ ル メ チ レ ー シ ョ ン に big き な poor が あ る こ と が わ か っ た. Youdaoplaceholder0 ケラチノサ トとメラノサ トで トで トで difference がな がな った った. Youdaoplaceholder0 hypomethylation of non-CpG island がお がお て る る とが とが indicates された.