各種疾患におけるゲノムDNAのグローバルメチレーションの解析

多种疾病基因组DNA整体甲基化分析

• 批准号: 12204049
• 负责人: 藤原 浩
• 金额: --
• 依托单位: Niigata University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2000
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2000 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-12204049/
• 关键词: DNA; メチレーション; cytosine extension assay; 全身性エリテマトーデス; 円板状エリテマトーデス; リンパ球

遺伝子変異によらない遺伝子発現制御(epigenetics)として、近年、DNAのメチル化による転写抑制が重要視されてきている。筆者はアイソトープを用いない、ゲノムDNA全体のCpG island特異的なメチレーションの定量法、non-isotopic cytosine extension assay(NICEA)を開発した。この方法はメチレーションの解析を安全、安価に行い、さらに微量の組織でも解析を可能にし、応用範囲を格段に広げるものである。今年度は、NICEAの感度の向上、計測を行い、代表的な自己免疫性疾患である全身性エリテマトーデス(SLE)の末梢血リンパ球からgenomic DNAを分離,CpG island特異的なメチレーションの定量を行った。その結果、1、NICEAは通常genome DNA数マイクログラムまでの範囲で定量的解析が可能である。また、genome DNAが10ナノグラム以下でも濃縮操作により解析可能であることがわかった。2、SLE、皮膚限局型エリテマトーデス(CLE)、コントロールの末梢血リンパ球から抽出したDNAを用い、NICEAを行った。BssHII/MspIではSLE-CLE間で、BssHII/HpaIIではSLE-control間で統計学的に有意差がみられた。HpaII/MspIでは、各群間に差はなかった。以上の結果から、3、NICEAは、その広い範囲での定量性から、応用範囲の広い研究法であり、また、DNA arrayによる大規模解析に移る前段階としての、スクリーニングにもなりうる。4、SLEでの解析では、コントロール、CLEに比べ、CpG island methylationが亢進してると考えられ、SLEのリンパ球機能異常の病態の解明にせまる可能性があると考えられた。

In recent years, DNA epigenetics has become an important factor in epigenetics. The author developed a non-isotopic cytosine extension assay (NICEA) using a non-isotopic cytosine extension assay (NICEA) using a non-isotopic cytosine extension assay (NICEA) and a non-isotopic cytosine extension assay (NICEA) using a CpG island-specific CpG island-specific CpG protein.このmethodはメチレーションのANALYSISをSafety、Safetyに行い、さらに Trace amount The analysis of the organization is possible, and the use of the organization is possible. This year, NICEA's Sensitivity Up, Measuring Line, Autoimmune Disease Systemic Systemic Leukemia (SLE), Peripheral Blood Genomic DNA Isolation, CpG are representative. The island's specific なメチレーションのquantitative を行った. The results, 1. NICEA usually does not allow quantitative analysis of genome DNA numbers.また、Genome DNAが10ナノグラムThe following concentration operation and analysis are possible. 2. SLE, skin-limited type CLE (CLE), CLE, peripheral blood test, DNA extraction, and NICEA. There is no statistically significant difference between BssHII/MspI and SLE-CLE, and BssHII/HpaII and SLE-control. HpaII/MspI is the same, and the difference between each group is the same. The above results are から、3、NICEAは、その広い Fan囲でのQuantitative から、応用法囲の広いResearch method であり、また、DNA Array is a large-scale analysis of the previous stage of the stage, and the スクリーニングにもなりうる. 4. SLE analysis, CLE analysis, CpG island Methylation is too high, and SLE's abnormality of globulin function is not possible.