抗体ライブラリーを用いた全遺伝子産物の網羅的機能構造解析

使用抗体库对所有基因产物进行全面的功能结构分析

• 批准号: 13208033
• 负责人: 林 宣宏
• 金额: $ 4.16万
• 依托单位: Fujita Health University
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13208033/
• 关键词: 抗体; ドラツグデザイン; バイオインフォマティツクス; 遺伝子機能解析; タンパク質間相互作用; 標的分子認識機構; データベース; 分子生物学

抗体には多種多様な抗原を漏れなく認識するものが必ず含まれているので、抗原-抗体相互作用のレパートリーの中には、生物が有している標的分子認識のほとんど総てが含まれていると考えられる。生体内の機能性分子の標的分子認識の分子機構を抗体ライブラリーを使って網羅的に解析することで、生物の有する標的分子認識機構のインデックスを作成し、それを用いて抗体をプローブとして用いる、機能が未知の遺伝子産物の機能を探索できるストラテジーの開発を行う。また、抗体の抗原認識の分子機構の網羅的解析から得られる知見を基盤に、任意の遺伝子産物に適用可能な抗体分子をプロトタイプとしてする機能制御分子のドラッグデザインアルゴリズムの開発を目的としている。"[抗体]-[抗原]データベース"、"[抗体]-[エピトープ]データベース"、"[抗体機能部位]-[エピトープ]データベース"の構築は順調に進んでおり、28種類の抗原に対する572個の抗体遺伝子の登録を終えている。現在も複数の抗原に対する抗体のスクリーニングは進行中であり、今後も登録データ数を増やしていく予定である。さらに特筆すべきは、抗原(プロテインキナーゼの一種)の機能を調節する抗体が、当該研究で使用している抗体のスクリーニング法で得られたことである(投稿準備中)。このことは、抗体をプロトタイプとして使用するドラッグデザインの第一歩である。"[抗体]-[エピトープ]データベース"の構築に関してはいくつかの抗体-抗原のセットを選択して、エピトープマッピングを開始している。また、"[抗体機能部位]-[エピトープ]データベース"の構築において必須となる、抗体遺伝子からの抗体分子の立体構造モデリングおよび機能部位抽出のために、当該分野の専家との共同研究を模索中である。

由于抗体始终包含那些无一例外地识别多种抗原的抗体，因此人们认为抗原抗体相互作用的曲目几乎包含生物体所具有的几乎所有靶分子识别。通过全面分析使用抗体库在体内对靶分子识别靶分子识别的分子机制，创建了生物体拥有的靶分子识别机制的索引，并使用抗体作为探针，这种抗体作为探针，这种策略允许开发一种可以与已知产品一起搜索GENEE功能的策略。此外，基于从对抗体抗原识别的分子机制获得的发现，其目的是开发一种用于功能控制分子的药物设计算法，该算法可以使用可以应用于任何基因产物的抗体分子，以将任何基因产物应用于任何基因产物。 “抗体” - [抗原]数据库的构建，“抗体] - [表位]数据库”和“ [抗体功能位点] - [表位]数据库”正在顺利进行，572种针对28种抗原类型的抗原类型的抗体基因已完成。筛查针对多种抗原的抗体仍在进行中，我们计划继续增加注册数据的数量。更值得注意的是，通过研究中使用的抗体的筛选方法获得了调节抗原功能（一种蛋白激酶）的抗体（准备发布）。这是使用抗体作为原型的药物设计的第一步。为了构建“抗体 - ePitope数据库”，已经选择了几种抗体 - 抗原集以启动表位映射。此外，我们正在寻求与艺术专业人员合作，以从抗体基因中构象建模和功能部位提取抗体分子的功能部位提取，这对于建立“ [抗体功能位点] - [表位]数据库”。

项目成果

Hayashi, N., Ito, Y., Jinbo, Y., Shibata, T., Izumi, Y., Matsushima, N., Titani, K.: "Novel myristoylation-directed protein-protein interaction between calmodul in and neuron-specific protein CAP-23/NAP-22"Proceedings of the 4th International conference o

Hayashi, N.、Ito, Y.、Jinbo, Y.、Shibata, T.、Izumi, Y.、Matsushima, N.、Titani, K.：“钙调素与神经元之间新型肉豆蔻酰化导向的蛋白质-蛋白质相互作用

Hayashi, N., Ito, Y., Shibata, T., Izumi, Y., Matsushima, N., Titani, K.: "NMR an d small angle X-ray scattering investigations of the myristoylation directed protein ミ protein interaction between neuron-specific protein CAP-43/NA -22 and calmodulin"Prote

Hayashi, N.、Ito, Y.、Shibata, T.、Izumi, Y.、Matsushima, N.、Titani, K.：“NMR 和小角 X 射线散射研究肉豆蔻酰化定向神经元特异性之间的蛋白质相互作用CAP-43/NA -22 蛋白和钙调蛋白"Prote

Hayashi, N., Matsubara, M., Jinbo, Y., Titani, K., Izumi, Y., Matsusliima, N.: "Nef of human inununodeficiency virus type 1 (HIV-1) interacts directly with calcium-bound calmodul in"Protein Science. 11. 529-537 (2001)

Hayashi, N.、Matsubara, M.、Jinbo, Y.、Titani, K.、Izumi, Y.、Matsusliima, N.：“人类免疫缺陷病毒 1 型 (HIV-1) 的 Nef 直接与钙结合钙调蛋白相互作用