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抗体ライブラリーを用いた生体分子の標的認識の分子機構データベースの構築

利用抗体库构建生物分子靶点识别的分子机制数据库

基本信息

批准号：
16014224
负责人：
林宣宏
金额：
$ 3.58万
依托单位：
Fujita Health University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
财政年份：
2004
资助国家：
日本
起止时间：
2004 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

抗体の標的分子認識の分子機構を抗体ライブラリーを使って網羅的に扱って、生物が有している標的分子の認識機構を総括的に解析し、生命分子の有する標的分子認識機構のデータベースを作成する。最初の段階では[エピトープ]-[抗体の抗原認識部位のアミノ酸配列]相関データベースの構築を進める。ある程度データが蓄積されれば、機能が未知の遺伝子産物に対する抗体の抗原認識部位のアミノ酸配列から、当該データベースの検索によりその機能が未知の遺伝子産物が関わっている相互作用を抽出することができる。"[抗体]-[抗原]データベース"、"[抗体]-[エピトープ]データベース"、"[抗体機能部位]-[エピトープ]データベース"の段階的構築を進めている。"[抗体]-[抗原]データベース"の構築は順調に進んでおり、既に約6,000個の抗体遺伝子の登録を終えている。また、いくつかの抗体に対して、抗原に対する結合定数とそのエピトープの決定を体系的に行った。その結果、免疫系は、最初は認識があいまいで抗原特異性がオーバーラップする抗体群(naive repertory)をあらかじめ準備していて、何かしらの抗原が侵入してきたときには、一気に特定の抗体の抗原特異性をあげてそれに対処するというようにして、分子認識のあいまいな抗体と厳密な抗体を巧妙に使い分けていることが分子レベルで解ってきた。最初は標的認識があいまいな抗体の標的認識特異性を、生体がどのように高めているのかを学ぶことは、免疫学の見地からのみならず、バイオナノプローブの標的認識装置を設計するうえで大変に有効である。さらに、当初、仮定したように、naive repertoryから得られた抗体により、抗原と構造が似ている他の分子を捕まえることに成功した。

The molecular mechanism of antibody target molecule recognition includes the analysis of molecular mechanism of biological target molecule recognition and the preparation of molecular mechanism of biological target molecule recognition. The first stage is to construct the antibody antigen recognition site. The level of accumulation, function and interaction of unknown gene products in antibody antigen recognition sites are discussed. "[Antibody]-[Antigen],""[Antibody]-[$>],""[Antibody Functional Site]-[$>]" "[Antibody]-[Antigen]" is constructed in sequence, and about 6,000 antibody fragments are registered. The number of binding proteins and the number of binding proteins determined by the system are determined. As a result, the immune system initially recognized the antigen specificity of the antibody group (naive repertory), prepared for the antigen invasion, and identified the antigen specificity of the specific antibody. The initial recognition of the target, the specificity of the recognition of the target, the biological recognition, the immunological recognition, the recognition of the target, and the design of the target recognition device. In the beginning, the original repertory was obtained, and the antigen structure was successfully captured.