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抗体ライブラリーを用いた全遺伝子産物の網羅的機能構造解析

使用抗体库对所有基因产物进行全面的功能结构分析

基本信息

批准号：
12208042
负责人：
林宣宏
金额：
--
依托单位：
Fujita Health University
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
财政年份：
2000
资助国家：
日本
起止时间：
2000 至无数据
项目状态：
已结题

项目摘要

背景と目的:バイオインフォマティックス、分子動力学シミュレーション、および黒澤らによって開発された抗体ライブラリーを用いた細胞内遺伝子産物の網羅的機能構造解析法の開発とその応用を目的とする。生体内機能性分子の標的分子認識の分子機構を抗体ライブラリーを使って網羅的に解析することで、生物の有する標的分子認識機構のインデックスを作成し、機能が未知の遺伝子産物の機能を探索できるアルゴリズムを開発する。また、その過程で得られる知見を基盤に、任意の遺伝子産物に適用可能な機能制御分子の設計アルゴリズムを開発する。検討結果:1.標的分子認識機構のデータベースの作成;これまでにステロイドやペプチド、病因性毒素、ウイルス粒子を抗原として抗体ライブラリーのスクリーニングが行われ、各抗原に対する抗体およびその遺伝子が得られている。一つの抗原に対して多種の抗体が得られるが、これら抗体遺伝子の整理、統合、データベース化を進めている。2.以下の二つの系をモデルケースとして、抗体をプローブとした生体内分子間相互作用の分子機構の解明とその制御法の開発を進めている;a)細胞内シグナル伝達系の主要因子であるカルモジュリンの翻訳後修飾依存的標的タンパク質認識の分子機構を調べ、抗体を用いてこの分子間相互作用を制御する方法の開発を進めている。b)未同定、機能未知の遺伝子産物の同定、機能解析に用いる抗体の調製方法の開発のモデルケースとして、c.elegansのカドヘリンリピートを有する遺伝子産物の推定三次元立体構造の構築を行い、ペプチド抗原の設計を行った。考察:現在構築中のデータベースを概観すると、通常の動物免疫法で得られる一群の抗体に比べて、はるかに多種および多機能の抗体が得られている事が分かった。現在、さらにデータ数を増やしつつ、全てのデータを網羅的に扱うことで新しい知識の抽出を進めている。

Background Objective: To develop and apply the molecular dynamics method for the analysis of intracellular gene products. The molecular mechanism of molecular recognition of target molecules in vivo is analyzed by antibody and detection, and the molecular recognition mechanism of biological target molecules is created by detection, detection and detection of unknown molecular products. The process is based on knowledge and the development of a functional control molecule design for any gene product. Results:1. The design of target molecular recognition mechanism; 2. The design of target molecular recognition mechanism; 3. The design of target molecular recognition mechanism; 4. The design of target molecular recognition mechanism; 5. The design of target molecular recognition mechanism; 6. The design of target molecular recognition mechanism; 7. The design of target molecular recognition mechanism; 8. The design of target molecular recognition mechanism; 7. The design of target molecular recognition mechanism; 8. The design of target molecular recognition mechanism; 9. The design of target molecular recognition mechanism; 8. The design of target molecular recognition mechanism; 9. A variety of antigen-related antibodies are collected, synthesized, and transformed into antigen-related proteins. 2. The development of methods for understanding and controlling molecular mechanisms of molecular interactions in vivo for antibody production is progressing in the following two systems: a) the development of methods for understanding and controlling molecular mechanisms of molecular interactions in vivo for antibody production is progressing in the development of methods for regulating molecular mechanisms of molecular interactions in vivo for antibody production. b) identification and development of antibody modulation methods for unidentified, functionally unknown gene products; c. construction of putative three-dimensional structures for gene products for elegans; and design of selected antigens. Investigation: In the current construction of the antibody system, the general animal immunization method has been used to obtain a group of antibodies, which are more complex and multifunctional. Now, the number of data is increasing, and the number of data is increasing.