HIV感染免疫担当細胞の包括的遺伝子発現解析

HIV感染的免疫活性细胞的综合基因表达分析

• 批准号: 13226022
• 负责人: 橋本 真一
• 金额: --
• 依托单位: The University of Tokyo
• 依托单位国家: 日本
• 项目类别: Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas (C)
• 财政年份: 2001
• 资助国家: 日本
• 起止时间: 2001 至 无数据
• 项目状态: 已结题
• 来源: https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-13226022/
• 关键词: 遺伝子発現; SAGE; 抗原提示細胞; HIV

感染症においてAIDSは現在世界的に観て最も深刻な感染症の一つである。原因ウイルスであるHIV (human immunodeficiency virus)の感染に伴う病態、AIDSへの進行機序を解明し、新たなAIDS予防/治療法を確立することは全人類的な課題と言える。これまで、HIV感染に伴い出現する様々な病態、血液/免疫異常を説明すべくin vitroにてHIV感染させたヒトT,マクロファージにおけるサイトカイン産生異常、転写関連遺伝子の発現上昇など知られているが、未だに、HIV(R5,X4,R5X4)をin vitroで感染したマクロファージ、樹状細胞における包括的遺伝子発現検索の仕事がなされていない。本研究では、まずHIV(R5,X4,R5X4)をin vitroで感染させたマクロファージ、樹状細胞の刺激/未刺激状態でのserial analysis of gene expression (SAGE)法を用いた遺伝子発現プロファイルの決定とHIV感染に伴う異常発現遺伝子の同定を目的とする。我々は現在まで、血液細胞を中心に遺伝子を解析し、それぞれの血液細胞特異的な遺伝子の発現を検討している。今後、SAGE法にによるデータをもとにHIV感染病態モニタリング用DNAマイクロアレイチップを作成し、国際共同研究によりウガンダから提供されたHIV感染者(AIDS発症、未発症群)の血液細胞のtotal RNAを用いて遺伝子発現パターンを解析し、様々なHIV感染病態とリンクする遺伝子群を同定する。今年度はマクロファージ指向性HIV(R5)をin vitroで樹状細胞に4日間処理し、LPSを加え24時間後の成熟樹状細胞おける遺伝子発現をSAGE法により行った。約9,000の転写産物について解析を行った結果、HIV未処理成熟樹状細胞の遺伝子発現パターンと非常に良く類似していた。このことは、HIV(R5)が樹状細胞への感染効率がきわめて低いため、遺伝子発現への影響が低かった為と考えられる。今後、さらに転写産物のシークエンスをし、解析精度を高めるとともに、マクロファージについても解析をすすめる。また、HIV感染細胞の包括的遺伝子解析結果と比較検討するため各種白血球(NK,ランゲルハンス様細胞の包括的遺伝子解析も同時に行った。

艾滋病是当今世界上最严重的传染病之一，目前是世界上最严重的传染病。可以说，阐明与因果病毒（HIV），向艾滋病进展的机理以及建立新的艾滋病预防/治疗方法相关的病理是人类范围的挑战。迄今为止，众所周知，众所周知，HIV感染发生的各种病理，人T和巨噬细胞中的细胞因子异常的产生以及感染了HIV体外感染的巨噬细胞以及转录相关基因的表达增加，但在巨噬细胞和树突状细胞中尚无全面的基因表达搜索，并在HIV中感染了HIV（R5，x4，x4，x4，r5x4，r5x4）中，在VITRO中进行了感染。在这项研究中，我们旨在首先使用巨噬细胞的刺激/未刺激状态和被HIV感染的树突状细胞（R5，X4，R5X4）的刺激/未刺激状态中的基因表达方法（SAGE）方法确定基因表达谱，并确定与HIV感染相关的异常表达基因。迄今为止，我们已经在血细胞中分析了基因，并研究了每个血细胞特异性基因的表达。将来，我们将创建一个基于数据基于数据的数据来监测HIV感染病理学的DNA微阵列芯片，并使用HIV感染个体的血细胞总RNA（在乌干达，Unonset，Unonset Group）通过国际协作研究和鉴定与各种HIV感染疗法的基因组分析基因表达模式。今年，在体外用巨噬细胞指导的HIV（R5）处理树突状细胞4天，并在将LPS添加到SAGE方法后24小时在成熟的树突状细胞中进行基因表达。对大约9,000份转录本的分析表明，未经治疗的HIV未治疗的成熟树突状细胞中的基因表达模式非常相似。这被认为是因为HIV（R5）对树突状细胞的感染效率非常低，因此对基因表达的影响很低。将来，我们将进一步对转录本进行测序以提高分析的准确性，还将促进对巨噬细胞的分析。此外，还同时进行了各种白细胞（NK和Langerhans样细胞）的综合遗传分析，以比较和检查HIV感染细胞的综合遗传分析的结果。