课题基金 / 基金详情

受容体タンパク質の活性化に対する振動エネルギー移動の理論的研究

受容体タンパク質の活性化に対する振動エネルギー移動の理論的研究
受体蛋白激活振动能量传递的理论研究
批准号:
02J00230
负责人:
久保 稔
金额:
$1.28万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2002
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2002 至 2003

项目摘要

项目成果

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1.受容体内振動エネルギー移動の分子動力学シミュレーショングルタミン酸受容体はリガンド誘導型イオンチャネルであり,脳の神経伝達に関与している.リガンドの結合は受容体リガンド結合部位のArg485側鎖を振動励起することが,昨年度の研究から明らかにされている.次のステップとして,Arg485の振動励起に対してsensitiveに応答する部位を分子動力学計算によって明らかにした.Arg485の振動励起エネルギーの約40%が,0.5ピコ秒以内にLys730に移動した後,主鎖に沿ってJヘリックスへと移動して,数ピコ秒でJヘリックスにサブÅの原子変位を与えた.Jヘリックスはサブユニット間の会合部位に位置している.膜貫通部位の構造が解明されていないため,その後のダイナミクスを調べることは不可能であったが,アセチルコリン受容体(神経伝達に関わる他のリガンド誘導型イオンチャネル)ではサブユニットの回転がチャネルを活性化していることが最近明らかにされた.グルタミン酸受容体でもサブユニット間に与える摂動がサブユニット間の運動のトリガーとなって,チャネルの活性に関与している可能性がある.2.モデル化合物を用いた反応と振動のカップリングの実験的検証タンパク質の振動ダイナミクスが反応や機能に関与していることを実験的に調べるために,よりシンプルな光合成モデル化合物ポルフィリン-フェロセン結合系の光電子移動を時間分解蛍光up-conversion測定およびpump-probe過渡吸収測定によって調べた.ポルフィリン-フェロセン結合系をS_2状態へ励起すると,50フェムト秒でS_1状態へ緩和した後,110フェムト秒でフェロセンからポルフィリンへ電子移動が起こることが明らかにされた.生体分子に匹敵するこの超高速電子移動は溶媒の極性に依存しなかった.pump-probe信号にはコヒーレントな振動ダイナミクスが振動成分として観測され,その振動の位相は電子移動に伴ってシフトすることもつきとめた.モデル化合物においては分子振動が反応とカップルしていることが明らかにされた.
期刊论文(5)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
久保稔: "Picosecond dynamics of the glutamate receptor in response to agonist-induced vibrational excitation"Proteins : Struct., Funct., and Bioinform.. 54. 231-236 (2004)
Minoru Kubo:“谷氨酸受体的皮秒动力学响应激动剂诱导的振动激发”蛋白质:结构、功能和生物信息.. 54. 231-236 (2004)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
久保稔: "Agonist-specific vibrational excitation of glutamate receptor"J.Mol.Struct.(Theochem). 639. 117-128 (2003)
Minoru Kubo:“谷氨酸受体激动剂特异性振动激发”J.Mol.Struct.(Theochem) 639. 117-128 (2003)。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
小田井圭: "Theoretical Research on Structures of γ-aminobutyric Acid and Glutamic Acid in Aqueous Conditions"The Journal of Biochemistry. (発表予定). (2003)
Kei Odai:“水性条件下 γ-氨基丁酸和谷氨酸结构的理论研究”《生物化学杂志》(即将出版)。
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
小田井圭: "Theoretical Research on Structures of γ-aminobutyric Acid and Glutamic Acid in Aqueous Conditions"J.Biochem.. 133. 335-342 (2003)
Kei Odai:“水条件下 γ-氨基丁酸和谷氨酸结构的理论研究”J.Biochem.. 133. 335-342 (2003)
DOI: --
发表时间:
期刊:
影响因子: --
作者: []
通讯作者:
二機能性タンパク質のダイナミックな構造と機能制御
  • 批准号:
    23K23852
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额:
    $3.41万
  • 财政年份:
    2024
  • 负责人:
    久保 稔
  • 依托单位:
二機能性タンパク質のダイナミックな構造と機能制御
  • 批准号:
    22H02588
  • 项目类别:
    Grant-in-Aid for Scientific Research (B)
  • 资助金额:
    $11.23万
  • 财政年份:
    2022
  • 负责人:
    久保 稔
  • 依托单位:
Isolation of neighboring cell-interacting factors in plants
時間分解紫外共鳴ラマン分光法の開発とそれを用いたセンサー蛋白質の活性化機構の解明
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