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受容体タンパク質の活性化に対する振動エネルギー移動の理論的研究

受体蛋白激活振动能量传递的理论研究

基本信息

批准号：
02J00230
负责人：
久保稔
金额：
$ 1.28万
依托单位：
Osaka University (2003)Hokkaido University (2002)
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2002
资助国家：
日本
起止时间：
2002 至 2003
项目状态：
已结题

项目摘要

1.受容体内振動エネルギー移動の分子動力学シミュレーショングルタミン酸受容体はリガンド誘導型イオンチャネルであり,脳の神経伝達に関与している.リガンドの結合は受容体リガンド結合部位のArg485側鎖を振動励起することが,昨年度の研究から明らかにされている.次のステップとして,Arg485の振動励起に対してsensitiveに応答する部位を分子動力学計算によって明らかにした.Arg485の振動励起エネルギーの約40%が,0.5ピコ秒以内にLys730に移動した後,主鎖に沿ってJヘリックスへと移動して,数ピコ秒でJヘリックスにサブÅの原子変位を与えた.Jヘリックスはサブユニット間の会合部位に位置している.膜貫通部位の構造が解明されていないため,その後のダイナミクスを調べることは不可能であったが,アセチルコリン受容体(神経伝達に関わる他のリガンド誘導型イオンチャネル)ではサブユニットの回転がチャネルを活性化していることが最近明らかにされた.グルタミン酸受容体でもサブユニット間に与える摂動がサブユニット間の運動のトリガーとなって,チャネルの活性に関与している可能性がある.2.モデル化合物を用いた反応と振動のカップリングの実験的検証タンパク質の振動ダイナミクスが反応や機能に関与していることを実験的に調べるために,よりシンプルな光合成モデル化合物ポルフィリン-フェロセン結合系の光電子移動を時間分解蛍光up-conversion測定およびpump-probe過渡吸収測定によって調べた.ポルフィリン-フェロセン結合系をS_2状態へ励起すると,50フェムト秒でS_1状態へ緩和した後,110フェムト秒でフェロセンからポルフィリンへ電子移動が起こることが明らかにされた.生体分子に匹敵するこの超高速電子移動は溶媒の極性に依存しなかった.pump-probe信号にはコヒーレントな振動ダイナミクスが振動成分として観測され,その振動の位相は電子移動に伴ってシフトすることもつきとめた.モデル化合物においては分子振動が反応とカップルしていることが明らかにされた.

1. The molecular dynamics of the acceptor, the molecular dynamics, the molecular dynamics, the acid receptor, the recipient, the recipient and the recipient. In the joint of the capacitive body and the recipient, the Arg485 device is excited to stimulate the capacitive device. Last year's study showed that the test was completed. During the second half of the cycle, the Arg485 vibrator excited the sensitive sensor to answer the molecular dynamics calculation of the device. Arg485 vibration exciter caused an error of about 40%. After half a second of the Lys730 movement, the main driver moved the machine along the terminal. Count the number of seconds, the position of the atomic bit and the position of the rendezvous position. The part of the membrane is made to understand that it is not possible to know that it is not possible to know that it is not possible to do so in the back of the film. There is no significant difference between the activity of the acid receptor and the activity of the recipient. 2. The chemical compound uses the anti-vibration device, the anti-vibration mechanism, the anti-vibration mechanism and the anti-vibration mechanism. The combination of photoelectron mobility time decomposition photoluminescence up-conversion to determine the transition absorption of pump-probe and the concentration of UV. The combination system is SOS 2. After 50 min of SOS 1 status, 110 min of room temperature is required. The mobile phone is sensitive and sensitive. Biomolecules are sensitive to ultra-high-speed electronic movement. the solvent is sexually dependent. Pump-probe signals do not affect the performance of the vehicle. The components of the generator are excited, and the phase electrons are moved along with the phase motors. The chemical compound is sensitive to the molecular vibration. the molecular vibration is sensitive to the molecular vibration.