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原生生物太陽虫類の分子系統解析

原生日光虫的分子系统发育分析

基本信息

批准号：
03J00129
负责人：
坂口美亜子
金额：
$ 1.41万
依托单位：
University of Tsukuba
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至 2005
项目状态：
已结题

来源：
https://kaken.nii.ac.jp/grant/KAKENHI-PROJECT-03J00129/
关键词：
分子系統原生生物太陽虫 Centrohelida

项目摘要

本研究の目的は、これまで真核生物における系統上の位置が不明確であった原生生物太陽虫類の分子系統解析によって解明することである。太陽虫類の大きなグループの一つである有中心粒太陽虫の系統的位置を調べるため、昨年度シークエンスを行い配列決定したRaphidiophrys contractilisのSSU rRNA、α-チューブリン、β-チューブリンの配列を用いてさらに詳しい分子系統解析を行った。まず、今年度新たに報告のあった他の太陽虫グループのSSU rRNAの配列を加えて最尤法による解析を行ったところ、有中心粒太陽虫は他のどの太陽虫グループとも近縁性は見られず、また他の真核生物グループとも特に高い近縁性は見られなかった。次に、R.contractilisのα-チューブリン、β-チューブリンに加え、同じRaphidiophrys属のR.ambiguaのアクチンのアミノ酸配列を用いて連結データセットを作成し、最尤法による解析を行ったところ、有中心粒太陽虫は他のどの真核生物グループよりも紅藻に近縁性を示した。しかし、WSH及びAU検定の結果、有中心粒太陽虫は紅藻あるいはアメーボゾアの姉妹群である可能性、または有中心粒太陽虫がアメーボゾアと紅藻の間で独立して分岐した可能性があることが示唆された。以上の結果は論文としてまとめられた(JME,2005. in press)。さらに他の分子マーカーとして、elongation factor 2の配列を決定中であり、今後このアミノ酸配列を加えて分子系統解析を行い、有中心中太陽虫の系統的位置を明らかにするつもりである。

The purpose of this study is that the location of the eukaryotic system is not clear. The molecular system of protozoa, protozoa, insects and insects is analyzed and understood. The location of the centrosome of the insect system, the location of the Raphidiophrys contractilis system, the location of the host system, the location of the system. This year's new report reports that he is suffering from worms such as worms and SSU rRNA. The best way to do this is to analyze the lines of worms, central worms, worms, eukaryotes and eukaryotes. Secondary, R.contractilis alpha-phenotypic acid, β-eukaryote, Raphidiophrys, eukaryote, eukaryote and eukaryote. The results of the results of WSH and AU tests, the possibility that there are centromeres, the possibility of sister groups, the possibility of independent bifurcation, the possibility of bifurcation, and the possibility of bifurcation. As a result of the above results, this is the most important thing in this article (JME,2005. In press). In the future, the location of the molecular system analysis system, the location of the central worm system, the location of the central worm system, the location of the molecular system, the location of the central worm system, and the location of the central worm system.