古細菌型レチナール蛋白質の機能分化機構
古菌视网膜蛋白的功能分化机制
基本信息
- 批准号:03J09669
- 负责人:
- 金额:$ 2.37万
- 依托单位:
- 依托单位国家:日本
- 项目类别:Grant-in-Aid for JSPS Fellows
- 财政年份:2003
- 资助国家:日本
- 起止时间:2003 至 2005
- 项目状态:已结题
- 来源:
- 关键词:
项目摘要
光センサーとして機能する古細菌型レチナール蛋白質,ファラオニスフォボロドプシン(ppR)では,機能発現時の構造変化に蛋白質内プロトン移動が伴うことを,これまでに我々は明らかにした.そこでppRのプロトン移動を,電気生理学的手法によって電流として捉えることを試みた.電気生理学的測定を適用するために,アフリカツメガエル卵母細胞におけるppRの発現系を構築した.ppRのmRNAをインジェクション後3〜5日目の卵母細胞に光照射を行うと,微弱な外向き電流が観測された.この電流は,ppRの構造変化速度を加速するazideを添加すると増大したことから,ppRの構造変化に伴う蛋白質内プロトン移動を電流として捉えたものと考えられる.これまで古細菌型レチナール蛋白質の電気生理学的データは分光学的データと比較して少なく,本成果をさらに進展させれば別視点から蛋白質構造変化を捉えることが可能になる.また,蛋白質の表面構造・構造変化を簡便に検出する方法の開発も試みた.具体的には,対象とする蛋白質で系統的にシステイン導入変異体を作製し,システインのチオール基と金との反応性から変異導入部位の表面露出性を評価した.新奇な点は,金としてガラス基板上の金薄膜を用い,金-チオール反応の検出に表面プラズモン共鳴シグナルを用いた点である.実際この方法を立体構造既知のカリウムイオンチャネルに適用したところ,チャネルの開閉に伴う大域的な構造変化を検出することができた(現在投稿中).これらの方法をppRやその類似蛋白質に包括的に応用し,各蛋白質の特性をより多面的に捉えれば,古細菌型レチナール蛋白質の機能分化に重要な特徴を明らかにできると考えられる.
Hikari nobacterial functional archaeal protein, ファラオニスフォボロドプシン (ppR)では, the functional structure of the present structure changes にプロトン movement within the protein が companion うことを, これまでに我々は明らかにした.そこでppRのプロトンmovableを, electrophysiological techniquesによってcurrentとしてCaptureえることをtrialみた. Determination of electrophysiology is applicable to するために, アフリカツメガエルoocyte におけるppRの発existing system をconstructionした.ppRのmRNAをインジェクション 3~5 days after oocyte irradiation, light irradiation, weak outward directionきcurrentが観measurementされた.このcurrentは,ppRのstructural change speedをaccelerateするazideをaddするとincrease largeしたことから,ppRのstructural changeに合うprotein intra-protein movement をcurrent として灈たものと考えられる.Comparison of the electrophysiological spectroscopy of the archaea type レチナール protein and the の电気physiology of the して小なく, Achievements, progress, different perspectives, protein structure change, catching, protein possible, protein structure The surface structure and structure modification method is simple and easy.にシスステイン introductory variant を production し, システインのチオールbase と金とのreflexivity から剉variant introduction part table The surface is exposed, the evaluation is novel, the gold thin film on the substrate is used, the gold-チオールanti-濜の検出にsurface プラズモンresonanceシグナルを用いた点である.実界この法を三级structuringknownのカリウムイオンチャネルにApplicable したところ, チャネルのopening and closing に companion う大区なstructural change を検出することができた(now Submitting).これらの法をppRやそのsimilar proteins include the use of に応, and the characteristics of each protein are multi-faceted The functional differentiation of the archaeal protein is important.
项目成果
期刊论文数量(15)
专著数量(0)
科研奖励数量(0)
会议论文数量(0)
专利数量(0)
Yuki Sudo et al.: "Interaction of Natronobacterium pharaonis phoborhodopsin (sensory rhodopsin II) with its cognate transducer probed by increase in the thermal stability"Photochemistry and Photobiology. 78. 511-516 (2003)
Yuki Sudo 等人:“通过增加热稳定性来探测法老嗜碱杆菌磷视紫红质(感觉视紫红质 II)与其同源传感器的相互作用”光化学和光生物学。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Importance of specific hydrogen bonds of archaeal rhodopsins for the binding to the transducer protein
- DOI:10.1016/j.jmb.2006.01.061
- 发表时间:2006-04-07
- 期刊:
- 影响因子:5.6
- 作者:Sudo, Y;Yamabi, M;Kamo, N
- 通讯作者:Kamo, N
Masayuki Iwamoto et al.: "Proton release and uptake of pharaonis phoborhodopsin (sensory rhodopsin II) reconstituted into phospholipids"Biochemistry. (印刷中). (2004)
Masayuki Iwamoto 等人:“将法老视紫红质(感觉视紫红质 II)重构为磷脂的质子释放和摄取”生物化学(2004 年出版)。
- DOI:
- 发表时间:
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
- 通讯作者:
Role of charged residues of pharaonis phoborhodopsin (sensory rhodopsin II) in its interaction with the trans-ducer protein
法老荧光紫质(感觉视紫红质 II)带电残基在与转导蛋白相互作用中的作用
- DOI:
- 发表时间:2004
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Hoshino;K. et al.;Y.Sudo
- 通讯作者:Y.Sudo
Transient movement of helix F revealed by photo-induced inactivation by reaction of a bulky SH-reagent to cysteine-introduced pharaonis phoborhodopsin (sensory rhodopsin II)
大量 SH 试剂与半胱氨酸引入的法老视紫红质(感觉视紫红质 II)反应导致光诱导失活,揭示了螺旋 F 的瞬时运动
- DOI:
- 发表时间:2004
- 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:Hasegawa D;Kobayashi M;et al.;H.Yoshika
- 通讯作者:H.Yoshika
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- DOI:
- 发表时间:
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脂膜中钾通道 KcsA 的打开/关闭结构和功能:使用单分子测量的综合方法
- DOI:
- 发表时间:
2013 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
角野歩;炭竈 享司;岩本 真幸;出羽 毅久;老木 成稔 - 通讯作者:
老木 成稔
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K+选择性渗透中离子与水的耦合比
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- 发表时间:
2008 - 期刊:
- 影响因子:0
- 作者:
横尾幸子;米澤淳;増田智先;桂敏也;乾賢一;岩本 真幸 - 通讯作者:
岩本 真幸
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