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凝縮転移下におけるDNA二重らせん鎖の力学的応答に関する理論的研究

DNA双螺旋链缩合转变力学响应的理论研究

基本信息

批准号：
03J11025
负责人：
和田浩史
金额：
$ 1.15万
依托单位：
The University of Tokyo
依托单位国家：
日本
项目类别：
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份：
2003
资助国家：
日本
起止时间：
2003 至 2004
项目状态：
已结题

项目摘要

本研究の目的は、一分子計測実験において観測された高分子電解質一分子の力学物性を理論的に理解することである。実験事実を要約する。DNAは溶液中で強く負に帯電した高分子であり、多価カチオン存在下では凝縮相へ転移する。光ピンセットを用いてこのDNAの広がりを制御し張力を測定すると、特筆すべき二種類の力学応答曲線が得られる。弱い凝縮に対しては張力が一定となるプラトー相が出現するのに対し、深い凝縮に対しては張力が急激な変化を繰り返す相が現れる。このような特異な弾性は、系の強い非平衡性と長距離の静電相互作用がもたらす複雑さを顕著に反映している。本研究では主に以下の二つの理論的考察を行った。相転移の理論と高分子の弾性が動的に結合したGinzburg-Landau型の現象論モデルを提案し、その理論的・数値的解析を行つた。モデルに基づくシミュレーションの結果、実験結果をほぼ定量的に再現する結果を得た。同時に、伸張過程における分子内部の構造変化を明らかにするとともに、実験で観測される張力曲線の履歴現象が有限速度の伸張を特徴付けるkineticな現象であることを界面ダイナミクスの観点から明らかにした。これらの成果をまとめた論文は初年度に公表済みである。DNAの凝縮転移は静電効果が引き起こすユニークな相転移のひとつである。静電効果が中心的役割を果たす相転移の大部分は理論的に未解明であるため、ミクロからのアプローチが不可欠である。そこで対イオンの効果をあらわに取り入れた、高分子のばねビーズモデルにもとづく動力学シミュレーションを行った。その結果、実験結果と見事に対応する力学特性を再現し、さらに対イオンの空間構造を調べることにより、これらの力学特性のミクロレベルからの理解を確立した。主な成果をまとめた論文は現在、Physical Review E誌に投稿中で、今後掲載の見込みである。

The purpose of this study is to measure the molecular mechanical properties of polymer electrolytes and to understand them theoretically. This is the first time I've ever been in a position to do this. In the presence of strong negative electrons in DNA solutions, condensation occurs. Two kinds of mechanical response curves were obtained by measuring the tensile strength of DNA in light and light. Weak condensation, tension, and phase change occur in the presence of deep condensation, tension, and phase change. The strong nonequilibrium and long-distance electrostatic interactions of the system are reflected in the complex interaction. This study is mainly concerned with the investigation of the following two theories. The theory of phase shift and the theory of polymer behavior are combined with the theory of Ginzburg-Landau phenomenon. The results of the basic analysis, the results of the quantitative analysis and the results of the quantitative analysis are obtained. At the same time, the structure of the molecular interior is clear, and the tension curve is characterized by finite velocity. The results of this paper are as follows: The condensation of DNA causes electrostatic effects. The static electricity effect is the center of the work, the phase shift, and most of the theoretical unsolved problems. The results of the study were as follows: The results of the experiment and the spatial structure of the experiment are reproduced, and the mechanical properties of the experiment are understood. The main achievements are now published in the journal Physical Review and published in the future.