梅物の防御反応を誘導するペプチドのコンビナトリアル化学の手法による探索
梅物の防御反応を誘導するペプチドのコンビナトリアル化学の手法による探索
批准号:
15780087
负责人:
宮下 正弘
金额:
$2.11万
依托单位:
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
财政年份:
2003
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2003 至 2005
中文摘要
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英文摘要
昨年度までの研究において、コンビケム手法によって作製したペプチドライブラリから植物の防御反応を誘導するペプチドを効率的に探索することを目的とした、ハイスループットスクリーニング法を構築した。今年度は、新規活性ペプチドの探索を目的として、すべてランダムなアミノ酸配列を有するライブラリを作成し、スクリーニングを行なった。ライブラリの配列に含まれるアミノ酸がすべてランダム化された場合、そこに含まれるペプチドの種類は膨大なものとなる。そこで、まず4残基のランダムペプチドライブラリを作成し,スクリーニングに供した。このライブラリは、含まれる配列をすべて合成し、スクリーニングに供することができる残基数である。スクリーニングの結果、この4残基ライブラリからは、活性ペプチドは見出されなかった。その理由として、このライブラリに含まれるペプチドは短く直鎖状であるため構造が固定化されていないことが考えられた。そこで、両末端にCys残基を導入し環状化させることにより構造を固定化したライブラリを作製し、スクリーニングに供したが、このライブラリからも活性ペプチドは見出すことができなかった。これらの結果から、残基数の少なさが大きな要因であると考え、6残基の直鎖ペプチドライブラリを作製した。この場合、すべての配列の組み合わせからなる理論上のペプチドの種類すべてを網羅することは不可能であり、今回はその1%相当(約47万種類)をスクリーニングに供した。その結果、数種のペプチドがスクリーニングにおいて陽性反応を示した。しかしながら、本方法ではペプチドの配列決定を活性検出後に行なうが、これらのペプチドはいずれも構造決定に至らなかった。これらのペプチドは合成途中に副反応により修飾された可能性もあり、エドマン分解以外の方法で配列決定を行なうことが必要であると思われた。
期刊论文(2)
专著(0)
科研奖励(0)
会议论文
Development of a Cell-Based Assay for the Screening of Novel Plant Activators from Combinatorial Peptide Libraries
开发用于从组合肽库中筛选新型植物激活剂的细胞测定法
DOI:
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发表时间:
2005
期刊:
Peptide Science 2004
影响因子:
--
作者:
[Yukari Otake, Masahiro Miyashita, Masashi Oda, Hisashi Miyagawa]
通讯作者:
Hisashi Miyagawa
Structure-Activity Relationships of Flagellin-Derived Peptides Which Induce Plant Defence Reponses
诱导植物防御反应的鞭毛蛋白衍生肽的构效关系
DOI:
--
发表时间:
2004
期刊:
Peptide Science 2003
影响因子:
--
作者:
[K.Miyata, Y.Otake, M.Miyashita, H.Miyagawa]
通讯作者:
H.Miyagawa
植物の防御反応を誘導する新規ペプチドのランダムライブラリからの探索
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批准号:18780087
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项目类别:Grant-in-Aid for Young Scientists (B)
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资助金额:$2.3万
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财政年份:2006
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负责人:宮下 正弘
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依托单位:
海外基金