DNAマイクロアレイを用いたソバ由来のアレロケミカルの研究

利用DNA微阵列研究荞麦中的化感物质

基本信息

项目摘要

これまでの研究の結果、ソバのアレロケミカルとして6種の成分を分離したが、今回、全活性法でもっとも寄与率の高い成分を調べた結果、ルチンが最も寄与が高く、没食子酸がこれに次いで重要であることが判明した。ルチンは最も強い全活性を、没食子酸は最も強い比活性を示す化合物である。そこで、この2種のソバ由来のアレロパシー物質の影響をマイクロアレイで分析した。シロイヌナズナを用いて、DNAマイクロアレイを行い、ソバのアレロケミカルが遺伝子発現に及ぼす影響を調べた。シロイヌナズナをアグリポットあるいは3段重ねプラントボックスを用いて開花期まで栽培し、ソバのアレロケミカルを投与した後、mRNAを抽出し、DNAマイクロアレイ法によって、影響を受ける遺伝子の解析を行った。マイクロアレイは、Affymetrix GeneChips Arabidopsis ATH1 Genome Arrayを用い、24,000の遺伝子を対象に検索した。カテコール化合物の比較として、L-ドーパとその関連化合物を投与し比較検定した。上記の化合物に暴露時間を変化させて変動する遺伝子を調べた結果、6時間の暴露で、没食子酸では168の遺伝子が、ルチンでは55の遺伝子が、それぞれ高発現したことがわかった。しかし、両者に共通して高発現となったのは、14遺伝子のみであった。本研究により、ソバに含まれるアレロケミカルによるストレスに反応して誘導される重要な遺伝子のいくつかが明らかになった。誘導された遺伝子の中で代表的なものは、「代謝」、「細胞レスキュー・細胞防御および毒性」、「細胞間情報伝達機構」および「転写」などであった。
The results of this study showed that the six components were separated and the total activity method was used to adjust the high content of gallic acid. Lectin is the compound with the strongest overall activity, and gallic acid is the compound with the strongest specific activity. Analysis of the effects of two kinds of substances on the origin of the disease The gene expression and the effect of DNA on gene expression were investigated. 3-segment analysis of mRNA, DNA and protein expression after flowering Affytrix GeneChips Arabidopsis ATH1 Genome Array with 24,000 pieces of DNA For the comparison of Katekul compounds, the comparison of L-dopa and related compounds was performed. Note that the compound exposure time changes, the gene transfer results, 6 time exposure, gallic acid, 168 gene transfer, 55 gene transfer, and high detection. 14 years ago. This study is aimed at exploring the potential of these new technologies. Inducing the gene in the middle of the word represents "metabolism,""cell defense,""intercellular information transmission mechanism," and "writing."

项目成果

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Transcriptome analysis of allelochemicals from buckwheat of selected allelochemicals identified in buckwheat
荞麦中鉴定出的化感物质的转录组分析
total activity of selected allelochemicals identified in buckwheat
荞麦中确定的选定化感物质的总活性
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Anna Golisz;Gawronski S W;Syuntaro Hiradate;Yoshiharu Fujii
  • 通讯作者:
    Yoshiharu Fujii
Microarray. analysis of Arabidopsis plants in response to an allelochemical L-DOPA
微阵列。
Allelopathic potential of polish cultivars of buckwheat
波兰荞麦品种的化感潜力
植物の全生涯に影響をおよぼすアレロパシー活性を検定するライフサイクルアセスメント法の開発
开发生命周期评估方法来测试影响植物整个生命的化感活性
  • DOI:
  • 发表时间:
    2007
  • 期刊:
  • 影响因子:
    0
  • 作者:
    Anna Golisz;Yoshiharu Fujii;Helena Gawronska;Stanislaw W.Gawronski;藤井義晴
  • 通讯作者:
    藤井義晴
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    新藤 充

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