DNAマイクロアレイを用いた植物エストロゲンの作用メカニズムの解明
DNAマイクロアレイを用いた植物エストロゲンの作用メカニズムの解明
批准号:
05F05636
负责人:
木山 亮一
金额:
$1.54万
依托单位国家:
日本
项目类别:
Grant-in-Aid for JSPS Fellows
财政年份:
2005
资助国家:
日本
项目状态:
已结题
起止时间:
2005 至 2007
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英文摘要
内分泌撹乱物質としては、植物エストロゲンなど白然界に存在する物質や合成化合物が存在して、ヒトに対してホルモンに似た作用を示す。本研究の目的は、トキシコゲノム分野において有力な手法のひとつであるDNAマイクロァレイ法を用いて植物エストロゲンや合成化合物の中からエストロゲン活性を有する物質を探索し、さらに、それらをマーカーとして用いて、未知の化合物やエストロゲン活性評価がされていない化合物について遺伝子レベルでの解析を行うことにある。本研究では、catechin類、フタル酸エステル類、及び、Zearalenone類について解析を行った。まず、DNAマイクロアレイ実験を行うための化合物の濃度条件(EC50)をSRBアッセイにより決定した。カテキン類に関してはいずれも細胞増殖活性は認められなかったが、9個のフタル酸エステル(及びフタル酸塩)についてSRBを行ったところ、いくつかの化合物は強い細胞増殖活性を示した。これらの化合物についてDNAマイクロアレイ解析を行ない、得られた遺伝子発現プロファイルをそれぞれの化合物の間で比較した。化合物間の比較は、統計的な相関解析を用いて行い、結果はエストロゲンに対する相関係数で表示した。さらに、DNAマイクロアレイ解析に用いた遺伝子の機能による解析も行った。GenBankデータベースのアノテーションによって6つの機能グループにまとめて相関解析を行ったところ、化合物の間でそれぞれ異なる機能グループの遺伝子について異なる応答が見られた。これらの相違は化合物の性質を分けるのに有用であると考えられる。さらに、Zearalenone類についてもDNAマイクロアレイ解析を行ったところ、いずれの化合物もエストロゲンに対して非常に高い相関を示した。以上の結果、DNAマイクロアレイ解析は様々な化合物に適用でき、エストロゲン活性の評価に有効であることが分った。
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Comparative profiling of the gene expression for estrogen responsiveness in cultured human cell lines.
培养的人类细胞系中雌激素反应性基因表达的比较分析。
DOI:
--
发表时间:
2007
期刊:
Toxicology In Vitro 21
影响因子:
--
作者:
[Inoue, A., Seino, Y., Terasaka, S., Hayashi, S., Yamori, T., Tanji, M., and Kiyama, R.]
通讯作者:
R.
Focused Microarray Analysis : Characterization of Phenomes by Gene Expression Profiling.
聚焦微阵列分析:通过基因表达谱表征现象组。
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
Current Pharmacogenomics 4
影响因子:
--
作者:
[Inoue, I., Tanji, M., Kiyama, R.]
通讯作者:
R.
DOI:
10.1016/j.toxlet.2005.10.005
发表时间:
2006-05
期刊:
Toxicology letters
影响因子:
3.5
作者:
[Shunichi Terasaka;A. Inoue;M. Tanji;R. Kiyama]
通讯作者:
Shunichi Terasaka;A. Inoue;M. Tanji;R. Kiyama
Periodic bent DNA : A functional component of genomic DNA and chromatin.
周期性弯曲DNA:基因组DNA和染色质的功能成分。
DOI:
--
发表时间:
2006
期刊:
DNA Structure, Chromatin and Gene Expression
影响因子:
--
作者:
[Kiyama, R., Wada-Kiyama, Y.]
通讯作者:
Y.
Study of the signaling cascade for estrogenic chemicals by genome technologies
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批准号:23K11443
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$3.0万
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财政年份:2023
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负责人:木山 亮一
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依托单位:
周期性bentDNA構造の解析より得られるゲノムDNA上の機能領域の体系的解析
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批准号:09277205
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$1.79万
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财政年份:1997
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负责人:木山 亮一
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依托单位:
新しいゲノム・サブトラクション法を用いたがん抑制遺伝子の探索
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批准号:08265217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.11万
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财政年份:1996
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负责人:木山 亮一
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依托单位:
新しいゲノム・サブトラクション法を用いたがん抑制遺伝子の探索
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批准号:08265217
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research on Priority Areas
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资助金额:$2.11万
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财政年份:1996
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负责人:木山 亮一
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依托单位:
遺伝子プロモーター領域における三重鎖DNA形成による転写反応制御
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批准号:07680674
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项目类别:Grant-in-Aid for Scientific Research (C)
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资助金额:$1.41万
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财政年份:1995
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负责人:木山 亮一
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依托单位:
海外基金